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大型GWAS meta分析增加了湿疹风险变异的数量

纽约(基因组网)-一个国际研究小组已经追踪到10个与炎症性皮肤条件特应性皮炎(也被称为湿疹)明显相关的新基因座报道自然遗传学今天。

通过一项多祖先全基因组关联研究元分析,研究人员从过去的26项研究中发现了近21400例湿疹病例和超过95,400个对照,发现基因组中有20多个新的和已知的湿疹相关位点。

在数以万计的病例和近23万未受影响的对照中进行的验证测试证实了欧洲10个新的风险位点的关联。这些包括先天免疫基因及其周围的snp, T免疫细胞相关基因,以及与其他炎症条件相关的基因。

在一份声明中,该研究的共同第一作者、布里斯托大学的综合流行病学和社区医学研究员拉维尼娅·帕特诺斯特指出,这些发现“为湿疹的重要疾病机制提供了新的见解”。

帕特诺斯特提醒说,每一个新发现的变异只占该疾病整体遗传力的一小部分。尽管如此,她指出,对这些和其他与湿疹风险有关的变异的进一步审查可能会指向改善治疗的途径。

研究人员解释说,特应性皮炎的典型特征是由T细胞通路和皮肤屏障变化介导的炎症事件。因此,混淆表皮屏障相关基因FLG的突变与强烈的湿疹风险有关,这也许并不令人惊讶。

在这种疾病中具有更微妙作用的变异仍在研究中。研究小组指出,之前的GWAS已经在欧洲、日本和中国人群中确定了20个与湿疹相关的基因座,尽管湿疹背后的许多遗传性仍然无法解释。

为了对这种情况的基因因素进行最新研究,研究人员收集了21399例湿疹病例和95,464例未受影响的对照组的基因分型数据。

这些参与者中的大多数是欧洲后裔,尽管来自日本人、非裔美国人或拉丁裔个体的研究数据也被包括在内。

基于基因组中超过1500万个位点的直接基因分型和归因变异模式,研究团队缩小了21个与欧洲个体的特应性皮炎有全基因组显著联系的位点,并在对所有祖先群体的个体进行更广泛分析时,发现了6个位点与明显关联的位点。

该研究的作者指出,这组可疑的SNP包括之前发现的与哮喘、过敏致敏和自我报告过敏等疾病相关的几个位点的变异。

总之,研究小组发现,荟萃分析中27个基因座中的21个出现在免疫相关疾病的研究中,如炎症性肠病和牛皮癣。

考虑到这一点,研究人员专门检查了与IBD、牛皮癣、1型糖尿病和其他自身免疫疾病相关的150多个变异的信号,发现了这些疾病与湿疹遗传风险之间的额外重叠。

该团队的基因集富集分析表明,与湿疹相关的变异在涉及T细胞极化和先天免疫信号的基因中过度代表。

最后,通过对21,059个病例和228,628个对照的11个候选位点的针对性测试,研究人员验证了其中10个位点在欧洲后裔个体中的关联。在多祖先分析中,其中6个基因显示出与湿疹的基因组显著关联。

该研究的作者总结道:“所有新发现的易感性位点都与(自身)免疫调节有关。”他们补充说:“尽管这并没有降低维持皮肤屏障在预防和治疗特应性皮炎中的重要性,但我们的研究结果为针对免疫调节的新方法提供了支持。”

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