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跨谱系GWAS检测出新的肺癌易感位点

纽约——一个由贝勒医学院的研究人员领导的国际团队,通过一项包括来自多个祖先背景的数十万人的全基因组关联研究元分析,追踪到与肺癌风险有关的新变异。

BCM临床和转化医学研究所主任、资深通讯作者Christopher Amos及其同事解释说:“了解肺癌易感性的基因结构将有助于揭示肺癌是如何发展的,并有助于识别新的易感性标记,以便更好地进行风险评估,以早期发现和诊断、靶向治疗和改进预防措施。”

对于一个研究发表在自然遗传学周一,研究人员收集了61,047名肺癌患者和超过947200名未受影响的对照组的基因分型资料,这些对照组包括来自欧洲、东亚和非洲血统的参与者,他们来自之前的十几个全基因组关联研究。

“大多数GWAS关注的是来自欧洲祖先群体的基因同质病例对照研究,”作者指出,并补充说,“跨祖先分析可以改善对低频和罕见等位基因的关联信号检测,如果它们在一个群体中更频繁,并帮助确定功能变异,当功能变异和标记等位基因之间的连锁不平衡(LD)有可变性时。”

除了在过去的研究中涉及肺癌风险的变异外,该团队还强调了几个之前未发现的已知位点的变异关联,以及五个过去未报道的位点。收集的危险变异包括特定人群或肺癌组织亚型的肺癌易感位点,如肺腺癌、肺鳞状细胞癌或小细胞肺癌。

虽然肺癌风险总体上与15个遗传基因座一致,但研究人员将14个新的和已知的风险基因座与腺癌联系起来。他们还检测到9个鳞状细胞癌相关位点和2个小细胞肺癌相关位点。

他们的分析还指出了对肺癌风险具有人群特异性影响的罕见和更常见的风险变异,包括与欧洲或非洲血统的小细胞癌相关的罕见IL17RC变异,以及与非洲血统参与者的小细胞肺癌相关的低频率HCG15基因变异。

“罕见变异的关联往往是特定于人群的,”作者报告说,“但即使是影响吸烟行为的常见变异的关联……也显示出人群特异性。”

从那里,研究人员转向精细绘图和表达定量性状位点分析,结合DNA损伤分析,重点关注几个肺癌相关组织和48个候选基因,似乎可以解释一些新的和已知的肺癌风险关联检测-包括风险基因从潜在的靶向途径相关的DNA损伤,细胞应激反应,或免疫活性。

“总的来说,”作者报告说,“我们对多祖先人群中人群特异性GWAS的跨祖先meta分析有助于阐明肺癌的病因和机制。”

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