纽约(基因组网)-一种变异PHACTR1基因似乎具有保护作用由INSERM的Jean Dallongeville领导的一个国际研究小组在2016年的一份报告中说，他们从年轻成年人的颈动脉夹层中分离出来自然遗传学今天。
虽然颈动脉夹层(通往大脑的动脉撕裂)在一般人群中并不常见，但它是年轻人中风的主要原因。
Dallongeville和她在颈动脉夹层和缺血性中风患者小组的同事们对近1400名颈动脉夹层患者和14000多名对照组进行了全基因组关联研究。由此，他们锁定了一些与颈动脉夹层相关的位点，包括PHACTR1中的一个。
研究报告的合著者、伦敦大学皇家霍洛威学院的潘卡吉·夏尔马在一份声明中说:“进一步的基因分析和全球范围内的这类合作，为确定中风的潜在机制提供了希望。”
在GWAS的发现阶段，研究小组收集了1393例CeAD病例和14416例欧洲血统对照的DNA样本，在Illumina公司的Human610-Quad或Human660W-Quad BeadChip上进行基因分型。研究对象的平均年龄为44岁。
由此，他们在两个位点上发现了两个具有全基因组意义的snp: PHACTR1内含子2上的rs9349379和LRP1内含子1上的rs11172113。其他一些snp，包括LRP1和LNX中的snp，也达到了显著性，但水平较低。
此外，通过imputation，他们在CCDC102B染色体18q22.1和17q21.1上发现了显著的snp，尽管后者估计具有较低的小等位基因频率。
为了验证这些关联，Dallongeville和她的同事对另外659例CeAD病例和近2650例对照组进行了基因分型。为此，他们特别关注与PHACTR1、LRP1、FGGY、LNX1或ZNF804A相关的snp，以及18q22.1附近的两个snp。
研究人员报告说，在这项后续研究中，PHACTR中rs9349379位点的相关性最强。对发现和验证队列的荟萃分析也发现rs9349379与颈动脉夹层之间有很强的相关性。G等位基因似乎具有保护作用。
研究人员说，另一个强烈的关联是LNX1的rs6820391，但与PHACTR中的一个不同，它具有很高的近似贝叶斯因子，这只表明了一种暗示性的关联。
Dallongeville和她的同事指出，PHACTR1位于一个高度保守的区域，这表明它的蛋白质具有重要的，但尚不清楚的生物学作用。他们补充说，它与血管管的形成和肌动蛋白聚合有关，这表明它在血管生成中起着作用。
他们鉴定的PHACTR1 SNP rs9349379也与心脏病发作有关，它和LRP1上的rs11172113也与偏头痛易感性有关。
研究人员说，偏头痛在颈动脉夹层患者中比在更广泛的人群中更常见，但rs9349379位点的G等位基因与较低的偏头痛风险相关，尽管心脏病发作的风险增加。
对于CeAD，研究人员还报告了PHACTR1位点的rs9349379[G]等位基因与较低的疾病风险相关，无论是在发现队列还是验证队列，在他们对发现队列和验证队列的总体荟萃分析中，优势比为0.77。
夏尔马补充说:“我们的发现使我们对基因组的这一区域如何影响关键血管功能有了更深入的了解，这可能对治疗这些严重和致残的疾病有重大意义。”