三个月大的分子检测公司iKaryos Diagnostics本周开始提供基于阵列的癌症样本全基因组分析。
这项名为“虚拟核型”的新服务使用Affymetrix snp -基因分型阵列为肿瘤学家和病理学家提供拷贝数和杂合性损失信息，以帮助指导患者的治疗。
肿瘤学家和病理学家目前使用更传统的技术，如荧光技术原位iKaryos在一份声明中说，通过杂交来观察患者的拷贝数和LOH。这家私人控股公司表示，通过更广泛地获取这些信息，专家们将能够确定特定肿瘤的侵袭程度，或者它是否有可能复发。
iKaryos公司总部位于内布拉斯加州奥马哈市，据该公司官员称，iKaryos公司的成立是为了将这项服务商业化，该公司与同样位于奥马哈的克莱顿大学(Creighton University)和克莱顿医学实验室(Creighton Medical Laboratories)合作提供这项服务。
iKaryos的联合创始人兼首席医疗官吉尔·哈根科德(Jill Hagenkord)本周表示，她和联合创始人费德里科·蒙扎(Federico Monzan)今年4月开始通过克莱顿医学实验室(Creighton medical Labs)提供这项服务，两人都是分子病理学家。该公司目前正在努力吸引更多的病理学家和肿瘤学家使用虚拟核型服务，该服务是通过Creighton的临床实验室改进法案(clinical Laboratory Improvement act)提供的实验室开发的临床测试。
根据Hagenkord的说法，iKaryos与Creighton之间存在收费服务关系，并就知识产权达成了协议。她拒绝进一步讨论知识产权问题。她还表示，iKaryos使用了各种Affymetrix目录SNP阵列，这些阵列是根据识别临床可操作异常所需的密度选择的。
在癌症检测中使用SNP阵列是相对较新的，Hagenkord引用了过去几年在体质异常检测领域成功采用阵列技术的例子，作为iKaryos等服务的发展方向。vwin德赢ac米兰合作
哈格科尔德说:“这类似于体质遗传异常市场。BioArray新闻这个星期。她指出，华盛顿州斯波坎市。总部位于美国的Signature基因组实验室是2004年首批开始提供基于阵列的体质检测的公司之一，但现在“美国有60多个实验室为体质疾病提供基于阵列的细胞遗传学检测，因为它已经成为护理标准。”根据Hagerkord的说法，“癌症检测是基于阵列的核型分析的下一个明显市场。
“iKaryos是我们学术实验室的业务开发和营销部门，”哈根科德说，他同时也是克莱顿大学分子病理学和临床基因组学实验室的医学主任。她说，客户可以向iKaryos发送冷冻或福尔马林固定的石蜡包埋的肿瘤样本，iKaryos将提取和处理数据，将结果数字化，然后使用软件工具重新创建和查询肿瘤的基因组。然后，该公司对结果进行分析，并为客户提供一份报告，供他们做出治疗决定。
哈根科德说:“我们可以告诉你，这是一种比大多数肾脏肿瘤更容易复发的肾脏肿瘤，或者肿瘤的侵袭性有多强，或者特定的异常对不同的癌症意味着什么。”
首席执行官罗伯特·克莱恩告诉记者BioArray新闻本周iKaryos的目标是使用现有细胞遗传学方法的肿瘤学家和病理学家。他指出，该公司将在佛罗里达州奥兰多举行的分子病理学家协会会议上展出。目前，该公司正在权衡争取潜在客户的不同销售方式。
Klein在描述虚拟核型时说:“我们提供一份签名的病理报告，其中包含可操作的信息，并将其提供给订购医生。”“肿瘤学家和病理学家的生死取决于复制数的变化。这些在文献中得到了很好的证实，我们提供的信息类型是病理学家和肿瘤学家已经了解的。”“他们知道如何解读我们报告的拷贝数变化。我们还有一个大型数据库，可以查询之前运行样本的大量信息。”他补充道。
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克莱因表示，基于阵列的癌症诊断的市场可能是“巨大的”，但作为一家初创公司，它取决于iKaryos来创造这个市场。他说:“我们所处的位置是，我们有责任传播有更好的癌症诊断方法。”
由于大多数肿瘤学家和病理学家依赖传统的细胞遗传学方法来获取iKaryos提供的信息，该公司将自己定位为提供一种补充技术，在某些情况下，是当今市场上的替代技术。vwin德赢ac米兰合作
克莱因说:“这与现有的竞争技术相比具有竞争力。”他拒绝提供定价信息，但表示FISH面板的价格将高于iKaryos的服务收费。
在扩张方面，Klein表示iKaryos专注于目前的产品，尽管“其他应用程序正在开发中”。他还表示，由于监管问题，这项服务将仅通过iKaryos的实验室提供，不过该公司未来可能会开设其他分支机构。
哈根科德说，虽然公司目前规模很小，但随着向更多的病理学家和肿瘤学家出售服务，iKaryos很容易承担更多的工作量。Hagenkord说:“这个试验的好处是它是为全基因组关联研究而设计的，所以它实际上是非常可扩展的。”“你可以在不增加人员的情况下提高产量。能够提供翻译是唯一的限制因素，”Hagenkord补充道，但他说iKaryos已经有工作人员可以根据需要接项目。