纽约(基因组网)-丹麦阿塞迪生物技术公司一直在与六家丹麦医院合作,临床验证其从母亲血液中分离循环胎儿细胞的技术,并分析其DNA,用于无创产前诊断。vwin德赢ac米兰合作
阿塞迪公司的首席执行官Palle Schelde说,阿塞迪公司希望在vwin德赢ac米兰合作不久的将来通过一家大型诊断公司将这项技术商业化,最理想的是成为这家公司的一员。他补充说,该公司尚未获得该技术的许可,但正在“准vwin德赢ac米兰合作备一个结构化的销售过程”。
谢尔德说:“为了将这项技术的巨大商业潜力释放到产前市场,我们现在已经达到了公司历史上的一个节点,该技vwin德赢ac米兰合作术已经为商业化做好了准备。”
上个月,阿塞迪的研究人员和他们在奥胡斯大学医院的合作者发表五个临床病例是更大的验证研究的一部分产前诊断,表明基于细胞的无创产前检测可以检测染色体非整倍体和亚染色体畸变,并将结果与有创检测结果进行比较。
然而,自动化技术以获得更高的吞吐量和降低其成本仍然存在挑战,研究人员表示,目前这与侵入vwin德赢ac米兰合作性测试类似。
此外,还需要进行临床试验来确定该试验的敏感性、特异性和阳性预测值。最后,基于细胞的NIPT可能会与其他产前检测解决一些相同的问题,例如镶嵌性的检测。
几十年来,人们一直在研究从母亲血液中提取细胞的NIPT,最近一些学术和商业团体也开始了研究取得了进展并致力于临床试验.与无细胞NIPT不同的是,基于细胞的NIPT针对的是纯胎儿DNA进行分析,而无细胞NIPT分析的是来自母亲和胎儿的碎片DNA的混合,这种方法近年来已经开始流行。因此,它有望提供与侵入性方法(如羊膜穿刺术和绒毛膜绒毛取样)相同的高质量结果,包括染色体畸变和拷贝数变异。作为一种诊断性检测,它不需要侵入性检测的确认,而侵入性检测目前被推荐用于无细胞NIPT阳性结果。
但在母体血液中循环的胎儿细胞非常罕见,而且很难从每个样本中持续分离出足够数量的胚胎细胞。Arcedi表示,该公司目前已经克服了这一挑战。
阿塞迪的方法,一年前在出版他与贝勒医学院的合作者一起,使用几种针对标记物的抗体来丰富和染色母体血液中的滋养层细胞。据该公司首席技术官Ripudaman Singh称,该公司拥有这些标记的知识产权,有效期到2031年。vwin德赢ac米兰合作此外,该公司使用了一种专有的方法来处理血液,他说,并开发了一种在荧光扫描仪下识别胎儿细胞的算法。逐个挑选胎儿细胞,然后从几个细胞中提取DNA进行全基因组扩增,然后通过阵列比较基因组杂交(aCGH)或下一代测序进行分析。
据奥胡斯大学医院的临床遗传学家、最近这项研究的资深作者艾达·沃格尔(Ida Vogel)说,论文中提到的5个病例是一项正在进行的验证研究的一部分,迄今为止,Arcedi已经分析了约600个样本。她说,该公司已经能够从每个样本中分离出胎儿细胞,包括从肥胖女性中分离出的细胞,这些女性的无细胞NIPT有时无法获得足够的胎儿DNA。
Vogel说,丹麦的临床医生普遍对无细胞NIPT持怀疑态度,因为它只检测唐氏综合症和其他一些情况,而这些情况下的胎儿畸形可能是由多种类型的染色体畸变引起的。因此,她所在的医院很有兴趣与阿塞迪公司合作,因为这样他们就可以研究一种只需要血液样本但不只是寻找唐氏综合症的检测方法。
她说,在她所在的丹麦地区,仍然是标准的孕早期筛查将约5%的女性诊断为高风险,其中80%的人目前选择侵入性检测,20%的人选择无细胞NIPT。
在他们的研究中,奥胡斯大学的研究人员收集了30毫升妇女的血液,这些妇女在早期三个月的筛查后被确定为高风险,并选择了CVS的侵入性检测。血液被送往阿塞迪公司进行胎儿细胞分离和DNA扩增。在这项研究中,Arcedi使用了自动化实验室解决方案公司的基于毛细管的CellCelector来挑选胎儿细胞,并使用Rubicon基因组公司的Picoplex WGA试剂盒进行WGA。辛格说,从采集血液到DNA扩增,这个过程大约需要14个小时,而aCGH又增加了几天的测试时间。
平均而言,研究人员从每个血液样本中分离出13个胎儿细胞,并从2到7个细胞中分析DNA。
奥尔胡斯大学的研究人员使用安捷伦技术公司的阵列,对扩增的胎儿细胞DNA和侵入性CVS样本进行aCGH。在5个病例中的2个,他们使用Illumina的平台和VersiSeq NIPT分析软件进行了无细胞NIPT。
基于细胞的NIPT能够复制所有5个病例的侵入性检测结果,包括21三体、13三体、2三体、涉及12.4兆酶重复和染色体4和8之间不平衡易位的21部分三体。在两例病例中,无细胞NIPT也检测到异常
然而,对于13型三体和2型三体的病例,侵入性检测也发现了高度嵌合体,而基于细胞的NIPT无法检测到,因为它分析的细胞太少。
此外,基于细胞的NIPT产生了一个假阳性结果,即19号染色体的重复,而CVS检测没有发现,这可能是DNA质量问题的结果。Vogel说,染色体微阵列最初也受到类似质量问题的困扰,但随着时间的推移,这些问题都得到了解决,未来基于细胞的NIPT可能也会得到解决。
总的来说,她说,基于细胞的NIPT不仅可以识别染色体非整倍体,还可以识别较小的畸变,如缺失和复制,这是令人鼓舞的。然而,有一些——没有在出版物中显示——太小了,测试无法检测到。她说,目前的检测极限在5兆到10兆之间,但有可能提高测试的分辨率。
沃格尔说,她的医院即将与阿塞迪公司展开另一项为期一年的研究,计划于明年1月开始,合作伙伴希望为至少200名选择无细胞NIPT的妇女提供基于细胞的NIPT作为额外测试。
沃格尔说,除了证明该检测的敏感性和特异性外,Arcedi还需要降低常规临床使用的成本。目前,成本在2000美元左右,与侵入性检测的价格范围相似。
辛格说,到目前为止,Arcedi专注于从每个样本中获取胎儿细胞,目前的技术还没有实现自动化,也没有优化成本。vwin德赢ac米兰合作“既然我们已经实现了从每个样本中分离胎儿细胞的目标,这就是我们目前的重点,”他说。
根据Vogel的说法,该测试的主要优势之一是它比无细胞的NIPT有可能发现更多类型的疾病,包括那些从母亲传给胎儿的疾病。她说:“我认为它永远无法达到与侵入性检测相比的质量。”“当然,这样做的好处是,你不必采集侵入性样本。”
“如果价格合理,它可能成为所有孕妇的筛查测试,”研究报告的另一位作者、奥胡斯大学医院(Aarhus University Hospital)的妇产科教授尼尔斯·乌尔德杰格(Niels Uldbjerg)说。“这将是终极用途。”