纽约——加薪后5500万美元本周早些时候，以色列分子诊断公司Nucleix渴望通过识别新的生物标志物和验证其甲基化肺癌检测进一步推进肺癌诊断领域。
这家基于rehovot的公司还预计，今年晚些时候，其膀胱EpiCheck试验将获得美国食品和药物管理局510(k)的批准。
Nucleix的EpiCheck平台在液体样本，特别是血液和尿液中，寻找循环肿瘤DNA (ctDNA)上的组织特异性甲基化模式。
从样本中提取ctDNA后，EpiCheck使用甲基化敏感酶对其进行消化，然后在实时PCR仪上进行处理。然后，该平台使用其EpiCheck软件对结果进行评估，根据测试标记的相对甲基化水平，生成0到100之间的数值分数(EpiScore)。如果该分数等于或高于某一阈值，则该样本被视为癌症阳性。
Nucleix首席执行官Chris Hibberd指出，该公司在过去的一年里通过开发下一代测序(NGS)版本的平台来改进EpiCheck。他说，NGS使公司能够在血液样本中识别新的与肺癌相关的甲基化和其他潜在的生物标志物。
Nucleix目前正在使用Illumina公司的测序仪器进行NGS检测，但Hibberd说，该检测足够灵活，可以在其他仪器上运行。PCR版本的检测可以在患者血液样本中识别多达6种甲基化生物标记物，可以在Qiagen的检测上运行RotoGene-Q以及赛默飞世尔科技公司的ABI 7500仪器。
Hibberd说:“我们正在寻求(构建)Lung EpiCheck的第三版，它将这些改进结合在一起，并进行大量的验证工作，如额外的甲基化生物标志物。”“问题是我们能否再找到一到两个甲基化标记物……添加到检测中。”
Nucleix发表了一项研究在十月在欧洲呼吸杂志强调了Lung EpiCheck公司诊断不同阶段肺癌的能力。通过对欧洲和中国肺癌患者的研究，该团队发现lung EpiCheck对所有肺癌分期具有87%的敏感性和64%的特异性。该试验对I期NSCLC的敏感性为78%，特异性为64%。
该公司还与未披露的临床合作伙伴开始了一项多年前瞻性研究，以验证在一组重度吸烟者身上的检测结果，该公司将长期监测这些重度吸烟者是否患有肺癌。虽然CTC筛查的最初人群包括55岁及以上每年吸30包烟的患者，但希伯德说，美国预防服务工作组在3月更新了推荐指南，将50岁以上每年吸20包烟的吸烟者纳入其中。
希伯德补充说:“这有效地使我们研究中可供筛查的患者数量翻了一番。”他的团队现在的目标是在研究的第一阶段监测3500到7500名患者。
Nucleix计划在参与研究的吸烟者中观察几种不同的肺癌亚型。具体来说，希伯德表示，公司将针对“快速增长”和“通常是致命的”亚型，如小细胞肺癌和非小细胞肺癌。他的团队将在2021年招募患者，并在与FDA对话后继续试验。
在Lung EpiCheck的新验证研究完成后，Nucleix计划申请510(k)批准。
随着新一轮的融资，Nucleix现在已经提高了约94美元几百万的资金自它于2008年推出。
Hibberd强调Nucleix还在圣地亚哥建立了一个新的实验室。该公司预计将在未来几周内获得CLIA认证，随后在今年晚些时候获得CAP认证。该公司希望最终在2022年提供一种仅供研究使用的Lung EpiCheck检测方法，估计每次检测的价格为250美元。该公司此前计划在今年夏天之前推出实验室开发的测试。
虽然Hibberd拒绝提供关于RUO服务的细节，但他表示，用户有望在“几天内”收到结果。
膀胱癌
Nucleix还向FDA提交了膀胱EpiCheck试验的510(k)申请，该试验分析了膀胱复发的15个甲基化生物标志物，去年秋天完成了一项未发表的多中心验证研究。
虽然Hibberd承认，FDA的反应由于COVID-19大流行而有所放缓，但Nucleix预计将在未来几个月内收到答复。该公司还在寻找商业合作伙伴，在获得批准后扩大膀胱EpiCheck在美国的业务，并期待与商业合作伙伴合作，提供配套版本的检测。
液体活检公司除了Nucleix喜欢圣杯和Guardant Health也在开发或提供基于甲基化的检测方法，以检测肺癌等早期癌症。Hibberd认为，EpiCheck从典型的甲基化方法中脱颖而出，因为其专利的基于酶的方法避免了起始遗传物质的破坏，具有低背景噪声。
Hibberd说:“以前的发现工作遭受了苛刻的处理步骤，只评估了有限的甲基化位点。”“利用我们的技术和NGvwin德赢ac米兰合作S……我们正在用一种干净的酶法调查更广泛的地点。”
在美国以外，Nucleix目前提供膀胱壁检测作为一种ce标记目前，该公司正在评估Lung EpiCheck检测获得CE标记的最佳时间。他还指出，该公司正在寻找两种检测方法在中国的潜在商业化合作伙伴。