旧金山湾区创业公司十亿toone正准备推出一项产前基因筛查测试，该测试将五种单基因隐性遗传病的母体携带者筛查与胎儿的反射性无创产前测试(NIPT)相结合。
该公司计划在下个月的一个早期访问项目中，将这种名为Unity的测试提供给数量有限的诊所。该方法使用了该公司开发的下一代测序和分子计数技术。vwin德赢ac米兰合作之后，该公司还计划进军液体活检癌症检测领域。
3月下旬，总部位于门洛帕克，由首席执行官Oguzhan Atay和首席技术官David Taso创立的BillionToOne宣布了一项投资计划A轮1500万美元这轮融资由蜂鸟投资公司和NeoTribe投资公司领投。其他参与者包括旧金山湾区的商业加速器Y Combinator，它也为该公司提供了种子资金;文明企业;五十年;500 Startups伊斯坦布尔;和HOF资本。
这家公司大约有10名员工，它的名字来源于一个事实，即许多隐性疾病都是由人类基因组中超过30亿个碱基中的一个碱基变化引起的。
Unity使用来自单一母亲血液样本的无细胞DNA进行两种检测，并依赖于扩增子测序和多重连接探针扩增(MLPA)。它首先确定妇女的囊性纤维化、脊髓肌萎缩、镰状细胞病、阿尔法地中海贫血和贝塔地中海贫血的携带者状态——美国妇产科学会建议所有妇女都应该进行携带者筛查。
如果她是其中一种疾病的携带者，则会自动进行反射性NIPT，以确定胎儿是否有可能患有这种疾病(估计有1%的病例会出现这种情况)。
曹说，公司选择了这五种疾病，因为指南建议对它们进行携带者筛查，而且目前还没有无创筛查测试，当父母被发现是携带者时。
他说，在传统的携带者筛查中，如果母亲的检测结果呈阳性，那么父亲就要接受检查，只有当他也是携带者时，孕妇才会接受侵入性诊断测试，以确定胎儿是否受到影响。然而，并不总是能够从父亲那里获得DNA，例如，美国40%的孕妇是单身母亲。在其他情况下，只有母亲而不是父亲有包括携带者筛查的健康保险，这让检测呈阳性的妇女在整个孕期都很担心，尽管她的孩子很可能是健康的。Unity不需要任何父亲的DNA来评估胎儿疾病的风险，从而避开了这一问题。
十亿toone的产品主管Shan Riku说，由于医疗补助和私人支付通常覆盖孕妇的携带者筛查，这项检测“将是每个人都能获得和负担得起的”。她说，该公司计划只对测试的携带者筛查部分收费，使公司能够更有效地向医疗补助人群提供该测试。
“底层统一”是一种分子计数技术，由十亿元科技公司的科学家开发，并在一篇论文中描述vwin德赢ac米兰合作预印在BioRxiv上个月。该方法使用所谓的定量计数模板(QCT)合成DNA分子作为参考，目前该公司已经为此申请了四项专利。在PCR扩增之前，它们被插入到无细胞DNA中，并被设计成以与它们感兴趣的相应基因相同的速率扩增，它们与这些基因共享某些区域。添加的QCT分子的数量可以从测序数据中计算出来，它们可以帮助确定来自样本中特定基因的DNA分子的数量。
“通常情况下，当人们看到丰度信息时，他们会说，我有这么多的阅读次数，这个等位基因的阅读次数与另一个等位基因不同，但你不知道这有多少分子，”拥有莱斯大学生物工程博士学位的Tsao解释说。“我们能够将读取计数转换为分子数，因此我们可以得到DNA的绝对计数。”
了解样本中每个等位基因的绝对数量可以让研究人员确定胎儿是否受到疾病的影响。例如，对于镰状细胞病的致病性变异，Tsao说:“如果在(母体)血液中有10%的胎儿片段，那么受影响的儿童等位基因片段将为0.55。”“然而，对于一个只是携带者的胎儿来说，等位基因分数是0.50。因此，区分0.55和0.50的情况是我们判断胎儿是否受到影响的方法。”
与数字聚合酶链反应相比(数字聚合酶链反应也提供绝对分子计数)，十亿toone公司的NGS方法的主要优势是允许更多的多路复用，因此它可以并行测试更多的条件和变异。
该公司计划提供Unity作为实验室开发的测试，该测试可以在怀孕10周后进行，目前正在门洛帕克建立CLIA实验室。该公司的目标是向临床医生提供检测包，临床医生将把孕妇的血液样本送到该公司进行检测。预计测试的周转时间约为两周，最初不会在纽约进行。
“我们确实认为我们的第一批客户将是医疗补助项目较多的诊所，因为这是最需要无创产前检查的地方，也因为它可以在患者群体中得到补偿，”Tsao说。
在最初的临床验证研究中描述BioRxiv研究人员与加州大学旧金山分校的科学家合作，预印本;贝勒医学院;和印度Ghaziabad的Yashoda超级专科医院，使用来自印度的母亲血液样本，测试了该方法检测胎儿中β -珠蛋白(HBB)基因杂合或纯合变异的能力。他们发现，在所有27例测试中，结果与新生儿HBB基因型一致。
Riku说，在印度的另一项研究也显示了100%的一致性。该公司选择印度是因为那里的β地中海贫血携带者比率相当高。
此外，BillionToOne正在与贝勒医学院进行一项由美国国立卫生研究院资助的研究，在这项研究中，研究人员使用Unity测试镰状细胞病。因为这种疾病包括在德克萨斯州的新生儿筛查项目中，他们可以在孩子出生后将NIPT结果与新生儿筛查结果进行匹配。
Tsao说，还需要更大规模的研究来确定Unity的临床敏感性和特异性，但这些研究可能会在该测试商业化后进行，类似于现有nipt的评估方法。
该测试的定价信息尚未公布，但Riku说，该公司正在制定一个财政援助计划，因此患者的自付费用将保持在较低水平。据曹教授介绍，该药物的标价预计将低于目前最便宜的用于染色体非整倍体的NIPT。
Tsao表示，如果专业指南开始建议对附加条件进行携带者筛查，那么BillionToOne可能会扩大Unity测试的范围。明年，该公司还计划推出一种用于染色体非整倍体的NIPT，它将与许多现有的用于胎儿三体的NIPT竞争。Tsao说:“用我们vwin德赢ac米兰合作的技术，因为它是如此的量化，我们相信我们可以提出一个非常经济有效的三体NIPT。”
此外，该公司正在研究癌症的液体活检检测。绝对计数技术的一个优势是它可以降低癌症突变的检测极限。vwin德赢ac米兰合作Tsao说，目前的检测极限通常用等位基因分数百分比表示，但有了绝对量化，“你可以把检测极限设为分子的数量，这在物理上更有意义。”所以你可以说，如果有10个或更多的致癌基因分子，那么我们就能够检测到它。”
他说，这种计数方法的另一个优点是能够以更高的灵敏度检测基因扩增或拷贝数变异。他补充说，这可能具有临床意义，例如在乳腺癌中检测HER2扩增。