纽约(基因组网)-临床药物遗传学实施联盟希望发布一些基因指南，专家机构认为这些基因缺乏证据，不应该用于指导治疗决策，但公司仍然将其纳入测试并大力营销。
本月早些时候，在田纳西州孟菲斯市举行的一次财团会议上，太平洋保险公司联席主席玛丽·雷林列举了一长串该集团着眼于实现的目标，包括发布“不可采取行动但被大力推广的基因指南”。
“作为临床药理学家，我们的部分工作是倡导以证据为基础的适当使用药物和检测，并反对不适当的详细营销，”Relling说，他同时也是圣裘德儿童研究医院制药科学部的主任。“我们很乐意在这方面提供帮助。”
在某种程度上，CPIC已经在缺乏临床可操作性证据的基因-药物对中找出了特定的双倍型或表型。但还有更多的基因没有在太平洋卫生委员会的指南中特别提到，证据不足，但实验室还是在对它们进行营销测试。
MTHFR就是这样一个例子。在互联网上快速搜索会找到许多网站，例如这一个，他们声称MTHFR突变与许多疾病有关，包括心脏病、中风、高血压、妊娠并发症、精神障碍、自闭症和某些类型的癌症。但研究没有发现支持这种基因疾病关联的证据，包括美国医学遗传学和基因组学学院在内的许多专家机构都建议不要对MTHFR变体进行常规检测。
太平洋保险公司还没有发布关于这种基因的指导方针把它和一些药物放在一起在文献中，它与类风湿关节炎药物甲氨蝶呤和化疗药物奥沙利铂有关。然而，这些基因药物组合目前被CPIC评为“C”级，这意味着基因药物对没有足够的临床可操作性证据。
“我们从我们的成员和其他人的调查中了解到，他们非常希望能够指导哪些基因药物对是不可操作的，”Relling告诉GenomeWeb。
虽然太平洋保险公司已经考虑发布关于不可操作基因的指导方针一段时间了，但与可操作PGx基因列表相关的大量工作阻碍了进展。然而，瑞林认为，由于美国食品和药物管理局(Food and Drug Administration)正更加关注药物遗传检测的营销方式，该小组更迫切地要更直接地解决不可作用基因的问题。
FDA认为“有效的”基因药物PGx关联是那些它已经审查并在药物标签中引用的。去年，FDA发出安全警报警告医学界，实验室正在销售不在药品标签上的基因药物协会检测，并联系了几家公司，了解他们的营销做法。据FDA称，他们接触过的大多数公司都同意从宣传材料和检测报告中删除特定药物的提及，但弗吉尼亚州北部的Inova Health System公司没有遵守该机构的要求。
这导致该机构发送了一个警告信．此后，卫生系统完全停止了PGx测试．虽然太平洋太平洋保险公司同意一些实体可能在营销PGx检测缺乏证据的适应症，但可以理解的是，专家组不同意该机构的观点，即只有fda批准的药物标签才是有效的基因药物关联的来源。
在一个博客来自斯坦福大学的Relling和Teri Klein是CPIC的联合首席研究员，他们回应了FDA的警告信，特别挑战了FDA在致Inova的信中所断言的“CYP2C19基因型与药物对艾司西酞普兰和舍曲林的反应之间的关系尚未建立”。他们指出，CPIC专家在回顾文献后得出结论，CYP2C19表型对这两种药物是可行的。
据Relling称，太平洋保险公司还向FDA发送了一封信，并联系了该机构的领导人，询问其向Inova发出警告信的理由。目前，一名FDA官员被列为具有观察员地位的太平洋太平洋保险公司成员。她说:“我们已经联系了FDA的成员，要求他们继续参与太平洋太平洋保险，并提出定期与他们会面讨论问题。”“我们希望与FDA保持沟通畅通。”
除了在影响PGx检测的政策问题上与FDA合作外，太平洋太平洋保险公司还有一长列的行动项目，包括使其指南更易于计算，包括开发一种新的PGx检测方法应用程序编程接口在社区中扩大PGx术语的标准化，并与ClinGen和ClinVar等其他组织合作，以提高其指南在该领域的可见性和使用。
在医疗保健领域，人们普遍认为，当临床医生在护理点拥有这种信息并将其嵌入电子健康记录和临床决策支持中时，药物遗传学信息最有用。然而，实验室之间在报告等位基因功能和表型术语方面缺乏标准化是药物遗传检测的主要障碍。
“你可以想象，如果每家医院都有自己的一套条款，”雷林说。“当我们甚至无法就测试名称或测试结果的基本解释达成一致时，电子病历供应商或其他软件开发人员将不可能提出一个推动临床决策支持的标准化系统。”
为了解决这个问题，几年前，太平洋保险公司在药物遗传学专家中发起了一项调查，并尝试将某些基因的PGx术语标准化。随后，他们在2017年发布了标准条款医学遗传学纸雷林说，从那以后，人们对这些术语有了很好的理解。
然而，在最初的过程中，CPIC专注于最容易处理的基因，如药物代谢酶、转运体和HLA基因。太平洋太平洋保险公司计划让社区参与类似的努力，试图为专家们在第一次过程中无法达成一致的基因达成标准条款，比如VKORC1和某些药效基因。
“好吧，我们做了简单的基因，”雷林说。“现在，是时候解决这些更困难的基因了，看看我们是否可以为它们的等位基因功能和表型提出共识术语。”
当专家们对已知的基因提出了自己的术语，使用了几十年，并就此发表了论文时，达成共识是具有挑战性的。例如，尽管在药物遗传学研究中，“广泛的代谢物”一词长期以来被普遍用于表示“正常的代谢物”，但CPIC的调查显示，大多数专家希望去掉前者，只使用后者，以避免在临床环境中混淆。
基于CPIC达成的共识，该小组现在将在指南中使用“正常代谢物”一词，并期望该领域的其他人也这样做，但Relling说，这样做也有可能激怒许多科学家，他们在过去40年里一直使用“广泛代谢物”一词。
此外，太平洋保险公司一直在与其他组织合作，包括ClinGen和ClinVar，以确保其指南被纳入那些广泛使用的资源。这两项由美国国家卫生研究院资助的研究正在共同努力，以提高医学领域对基因组变异的认识。ClinVar是一个数据库，汇集了基因组变异及其与人类健康关系的信息。ClinGen召集专家整理有关基因和变异的知识，并迅速成为定义精确医学和研究中使用的基因和变异临床相关性的中心资源。
ClinGen发布了基因和相关表型的摘要，CPIC希望与该组织合作，以确保在涉及药物基因时，资源参考了该联盟的指导方针．太平洋太平洋保险公司和pharmkb(一个聚合和管理基因变异和药物反应信息的在线知识库)几年来一直致力于研究如何将太平洋太平洋保险公司的信息输入ClinVar。
然而，根据Relling的说法，在ClinVar中显示变异的结构与药物基因的报告方式不太一致。在非常基本的水平上，ClinVar变异的临床意义被描述为可能良性、良性、意义未知的变异、可能致病或致病。她说:“这些术语对药物基因没有意义。”
此外，CPIC的指导方针是以基因为中心的，而ClinVar是以变体为中心的。在描述药物基因变异时，重要的是要注意双倍型，但如何将双倍型的信息获取到ClinVar中一直具有挑战性．“要想弄清楚如何以一种有用的方式将太平洋保险公司指南中的信息输入ClinVar，这不是一件小事，”Relling说。“但我们不会放弃。”
除了推动药物基因指南这一核心工作外，太平洋保险公司还希望解决一长串项目，该财团也在探索未来的资助模式。迄今为止，太平洋太平洋保险公司的资金来自NIH的拨款，该财团目前正在使用2018年7月开始的为期五年的拨款。
然而，瑞林说，NIH“面临着相当大的压力”，要停止资助数据库类型的资源。作为一项应急计划，万一NIH的资金失去了，太平洋保险公司一直在考虑如何继续开展工作。据瑞林说，太平洋保险公司有严格的规定，限制指导方针作者的利益冲突，例如，如果财团开始接受捐赠，捐赠者将“必须以某种方式保持距离”。
“我们没有利益冲突，这很重要，”她对太平洋太平洋保险公司孟菲斯会议的与会者强调。“至关重要的是，我们的指导方针是由那些不会因为测试是否进行而获得一分钱的人制定的。如何做到这一点是一个挑战，我们将向你们所有人寻求帮助，试图解决这个问题。”