一项多中心验证研究即将完成，MDx初创公司Episona预计将在今年第三季度末推出其精子甲基化测试，以诊断男性不孕症并预测体外受精的成功。
Episona的联合创始人、总裁兼首席执行官Alan Horsager告诉GenomeWeb，他和其他联合创始人创办这家公司的初衷是通过分析父母的精子DNA来预测未来后代的健康状况，尤其是神经系统疾病的发展。
虽然这仍是一个长期目标，但霍萨格说，Episona决定首先解决一个具有更直接临床相关性和更直接商业化途径的目标——男性不育症。
该公司的方法依赖于Illumina HumanMethylation450珠子芯片阵列来测量全基因组精子DNA甲基化模式，以预测男性生育状况和由此产生的胚胎质量。
Episona和犹他大学的合作者，发表了概念的初步证明去年发表在杂志上的关于其方法的研究生育与不育。
这项研究由犹他大学的道格拉斯·卡雷尔和南加州大学的安德鲁·史密斯领导，他们是Episona的另外两位联合创始人，他们回顾性地研究了127名接受体外受精治疗的男性夫妇的样本。
研究人员将体外受精患者群体分为两组:选择了大约50名胚胎发生良好且妊娠阳性的患者，以及另外70名体外受精后胚胎发生相对较差的患者，其中一些人成功怀孕，一些人没有。对于所有这些夫妇来说，导致不孕不育的主要女性因素被排除在外。然后，研究人员将这两组人与54名正常精子捐赠者的样本进行了比较，这些精子捐赠者已被证明具有生育能力。
使用他们基于阵列的甲基化分析策略，该团队能够开发出一种预测模型，区分男性生育状况，敏感性为82%，阳性预测值为99%。
根据霍萨格的说法，当试图预测男性对夫妇不育的贡献以及由此产生的胚胎质量时，该公司技术的敏感性下降了，但特异性仍然很高。vwin德赢ac米兰合作在概念验证研究中，该小组在预测良好胚胎和成功怀孕方面看到了高达50%的敏感性，没有假阳性。
霍萨格解释说，由于该测试的临床定位，特异性是更重要的衡量标准，因为它可以最大限度地降低假阳性结果的风险，从而排除一对夫妇成功怀孕的可能性。
自发表该研究以来，该公司一直在寻求对这些初步结果的多中心前瞻性验证，通过10个不同的临床地点招募了大约400名患者，包括多伦多、亚特兰大、洛杉矶和西雅图的体外受精中心。
虽然他不能分享结果的细节，但Horsager说Episona已经分析了一些早期数据，发现根据研究人员对最初概念证明的预期，该测试的敏感性和特异性似乎令人鼓舞。
该研究的结论是，该公司一直在为今年第三季度末的商业发布做准备。霍萨格说，他和同事们从2015年初开始筹集资金支持这条道路，净赚了约135万美元的天使资本。
该公司计划以LDT的形式提供其测试，目前正在努力通过CLIA认证和其实验室的加州许可证。
对于最初的湿实验室样品处理，该公司将与LabCorp子公司国家遗传学研究所合作。Episona将在自己的CLIA设施中进行数据分析。
霍萨格表示，该公司的商业战略将是在试管婴儿实验室市场寻找客户。生育治疗在很大程度上是自费的，因此在某些方面，该公司将个别患者视为其客户，但它将直接向向这些个人提供体外受精服务的公司和中心推销这项测试。
霍萨格表示，为了实现这一目标，许多参与该公司目前前瞻性验证研究的中心将在今年晚些时候上市后成为潜在的目标客户。
目前，DNA碎片被用于男性生育诊断领域，但Horsager说，与Episona打算验证其甲基化方法的方式相比，这种测试的有效性和实用性仍然相对未经证实。
基因测试目前也存在，以确定无精子症或精子生产受损的分子原因。例如MDx公司lucigene推出了基于pcr的y染色体微缺失测试去年在欧洲对精子发生受损的男性进行了检测。
但霍萨格表示，这种测试与Episona的使命并不重叠，Episona的使命是在没有明确答案的夫妇中识别男性不育，比如缺少精子。
展望未来，Horsager说Episona还计划对精子甲基化的其他诊断或预测用途进行研究，该公司认为甲基化是一种迄今为止在MDx领域相对被忽视的分析物。
霍萨格说:“显然，精子是一种配子，它对后代有贡献，所以我们对那里发生的事情很感兴趣，是否有一些变化可能会影响后代。”
此外，该公司还希望研究精子表观遗传学是否也能为男性自身的疾病风险提供诊断潜力。
最后，Horsager说，Episona还在研究测序技术是否可以为甲基化分析提供比公司目前测试所基于的450K阵列更好的分析平台。
由于该公司的预测方法不依赖于检测特定的甲基化位点，而是依赖于测量整个基因组区域的甲基化模式，因此深度测序覆盖可能并不需要获得足够的分辨率。他说，这可以降低测序技术的使用成本，否则与450K阵列技术相比，测序技术的成本仍然过高。vwin德赢ac米兰合作