总部位于德国的罕见遗传性疾病诊断公司Centogene成立12年后，正准备向美国扩张，目前该公司正在等待美国食品和药物管理局(fda)对其用于生成临床变异报告的诊断工具的批准。
自成立以来，先生科技一直专注于新兴市场——中东、亚洲和拉丁美洲。去年12月，为了促进其不断增长的业务，该公司在6月进行了a轮融资后，搬到了德国罗斯托克一个更大的1.5万平方英尺的工厂融资2500万欧元(3100万美元)。
但先生基因意识到，进一步的增长需要进军美国，其首席执行官阿恩特·罗尔夫斯(Arndt Rolfs)称美国是“全球最重要的基因检测市场”。考虑到这一点，Centogene于去年12月在波士顿开设了办事处，并计划于今年4月在那里开设一个经clia认证的实验室。
罗尔夫斯最近在36届会议间隙表示，进军美国市场“是我们的诊断和工业部门的扩张计划之一，目的是加速公司的增长。th一年一度的摩根大通医疗保健会议。
罗尔夫斯表示，这一交易尤其有可能扩大其在至关重要的医药市场的影响力。目前，该市场约占先生基因收入的一半。他说，2017年，该公司的收入为3500万美元，预计2018年的收入将同比增长40%。
罗尔夫斯说，该公司目前的制药合作伙伴包括Shire、Alexion Pharmaceuticals和Alnylam，以及“所有较大的中型”公司和开发孤儿药的小型公司。他还说，Centogene正在与更多的制药合作伙伴进行谈判，但他还不愿透露细节。
在寻求药物开发合作伙伴关系的过程中，先达基因的目标是改善疾病的流行病学。此外，它还促进了疾病的早期诊断，主要是通过向制药公司提供生物标记物来测试其药物的疗效。
Rolfs说，诊断越早，“我们就越能更好地了解临床表型，就能更好地用生物标记物等可量化参数支持我们的合作伙伴，[这样他们就能决定]这是否是一个开始治疗的迹象。”
随着对伴随和补充诊断的日益重视，生物标志物已经成为药物开发过程中的重要工具，但是，Rolfs说，许多制药公司仍然没有看到自己在疾病诊断中的作用。Centogene的目标是让他们相信，在疾病早期诊断方面与该公司合作，可以让患者更早开始药物治疗，从而改善患者管理，增加收入。他说，罕见病尤其如此。
Centogene公司的核心业务是其CentoMD基因型和表型突变数据库，该数据库包含从大约20万名匿名患者中挑选出来的520多万种变异，这些患者同意使用他们的数据。罗尔夫斯说，每个季度，有1.5万到1.8万名新患者的数据被添加到CentoMD。
该公司上周宣布，在CentoMD中已识别出超过10亿个等位基因。2016年，Centogene向FDA提交了CentoMD 510(k)审查申请，但随后实施了21圣根据罗尔夫斯的说法，根据世纪治愈法案，该机构已确定不再监督CentoMD，也不再接受FDA的审查。
在与该机构讨论后，CentoMDx提交了一款重新设计的产品，名为CentoMDx。他说，这是一款“诊断工具，临床医生可以在其中上传一个变异的呼叫格式文件，CentoMDx将为阳性变异提供诊断报告。”
该设备目前正在接受FDA的审查新创Rolfs表示，该公司将对其进行审查，并可能最早在本月对其营销许可做出决定。
此外，该公司已将其Centocard DBS试剂盒以及三种未公开的生物标记物提交给FDA，以获得可能的许可。
Centocard是一种基于滤纸的技术，用于收集10滴血，然后由Cevwin德赢ac米兰合作ntogene进行测试，包括删除/复制测试，外显子组和/或单基因测试，以及生物标志物检测测试。
秋天，生特根和Qiagen达成协议使用CentoMD将样本-洞察研究与罕见疾病的临床测试相结合。Qiagen已经有了一个数据库叫做人类基因突变数据库Qiagen Bioinformatics基因疾病全球产品管理总监Rupert Yip在一封电子邮件中说，HGMD包含了有关遗传性疾病突变的信息，虽然HGMD包含了在文献中发表的致病遗传变异的数据，并被纳入医疗指南，作为评估变异的参考，但它不包括临床致病性评估。相比之下，CentoMD的数据基于患者病例，并为这些患者中观察到的变异提供了致病性评估。因此，CentoMD的数据“对那些想要知道这些变异是如何被另一个临床实验室评估的实验室来说非常有吸引力。”
此外，CentoMD的大部分数据是未发表的，这是它与HGMD以及ClinVar的主要区别，ClinVar是Qiagen公司也使用的基因型-表型关系的公共数据库。“文献中报告病例的手工专家策展仍然很重要，”美国医学研究所副总裁肖恩·斯科特(Sean Scott)说市场开发，基因组学和生物信息学试剂盒。“从诊断实验室捕获临床注释变异，这些病例和观察到的变异可能没有在文献中报道或提交给ClinVar(这是观察到的变异的绝大多数)也很重要——这就是为什么Qiagen与Centogene合作的原因。”
罗尔夫斯指出，CentoMD的另一个显著特征是，它包含了来自不同种族的数据，而不仅仅是来自白种人。他补充说，CentoMD活跃在110多个国家，拥有由3.5万多名医生组成的网络，他们将患者样本发送给该公司。
种族多样性很重要，因为在一些种族群体中，一种变异可能意味着某种疾病的风险，而在其他种族中，相同的变异可能是良性的。例如，他说，BRCA突变已经被证实与法裔加拿大人的乳腺癌有关，这些患者经常被建议进行乳房切除术。然而，在日本人群中，同样的突变与乳腺癌无关，因此，可能不建议对这些患者进行乳房切除术。
“所以，这是一个简单的例子，基因解释必须在种族背景下完成。如果你不能接触到不同的种族，你可能会失去适当的关注，对病人的[障碍]，”Rolfs说。
对于其药物开发工作，Centogene的全球队列使其合作伙伴能够了解在哪些区域特定的突变导致特定的表型。他说:“Centogene可以向制药公司显示特定疾病患者的地理位置，实际有多少患者，”制药公司经常遗漏大部分患者，“以及(他们)应该寻找什么症状，”因为一些患者可能没有表现出所有症状，从而导致误诊。
不过，罗尔夫斯承认，在CentoMD中存在种族差距。Rolfs说，从统计学上讲，对于任何种族来说，在数据被认为具有临床相关性之前，都需要10万至15万名患者的样本。他说，先达基因已经测试了大约13万名白种人，“在这方面，我们已经达到了一个临界点。”
相比之下，Centogene检测的阿拉伯患者数量在8万到9万之间，而对于蒙古、俄罗斯和日本人群来说，“我们才刚刚开始，”罗尔夫斯说。
他说，Centogene还使用多组学方法来收集数据，这可以提供一个人更全面、更完整的临床情况。2016年底，该公司开始发售全基因组测序作为一项服务，并通过其CentoGenome测试，此外还有自2014年以来就在菜单上的临床外显子组测序。该公司总共提供超过3500个基因的基因检测。
它还提供转录组学测试，将RNA作为“诊断的信息工具”，以及蛋白质组学和代谢组学测试。为了进行全面的诊断，“通常你必须访问所有这些不同的、更通用的平台，”罗尔夫斯说。
Centogene并不是唯一一家采用多组学方法进行疾病诊断和生物标志物检测的公司。其他采取类似方法的公司包括生物技术公司Berg，其疑问句生物学平台也使用多种组学方法来加速生物标志物的发现。此外，范例诊断公司推出了一个注册研究今年4月，该公司利用其多组学测试收集患者健康和预后信息。该测试结合了DNA测序，mRNA表达分析和免疫组织化学分析，涵盖了广泛的蛋白质面板。
在研究方面，宾夕法尼亚大学的研究人员在夏天宣布了一个涉及multiomics剖析以寻找与成人和儿童肾移植结果相关的生物标志物。
然而，罗尔夫斯说，Centogene是独一无二的，因为它专注于罕见遗传疾病。该公司提供约7000种遗传性罕见疾病的检测，其中可以诊断4000种。他说，对于剩下的3000个，“我们能够看到表型”，但Centogene无法识别致病基因。
包括基于酶的测试、临床化学测试和生物标记物测试在内，该公司总共提供8,000项测试。生物化学测试的价格在115美元到410美元之间，而生物标志物测试的价格在210美元到290美元之间。基因检测的价格在150美元到4800美元之间。
罗尔夫斯说，Centogene公司30%到40%的检测是免费提供给病人的，因为他们负担不起。作为回报，在患者同意的情况下，Centogene从患者样本中获得临床数据，然后用于改进和更新其CentoMD数据库。
他说，一旦波士顿实验室投入运营，该公司将寻求CAP认证和CAP ISO 15189认证。
他补充说，在美国，该公司很可能不会寻求付款或报销，如果患者无法支付检测费用，生达基因将承担费用。
Rolfs说，从长远来看，这种模式更有经济意义，因为它可以从患者的测试样本中收集到有价值的临床信息。他说:“如果我为基因检测花费了10欧元，但基于与制药公司的合作，我将以100欧元或500欧元的价格收回，那么这不是一笔糟糕的交易。”