纽约(基因组网)——在上个月公布了一些强有力的早期数据后,拉古纳诊断公司正在推进一项基因表达测试的开发和商业化计划,该测试可以帮助诊断精神分裂症和双相情感障碍,通过区分患有一种疾病的人与另一种疾病的人,以及两者都没有的人。
该公司描述了使用全基因组微阵列进行测试的训练和测试的初始灵敏度结果在一项研究中发表在分子神经精神病学.作者报告说,由此产生的18基因测试可以正确区分三组-已知的精神分裂症患者,双相情感障碍和健康对照组-在两次不同的临床访问中,准确率为83%至88%。
商业公司和学术团体多年来一直致力于将基因组学注入精神病学实践中,但到目前为止,这些进展主要集中在药物基因组学方面——利用药物代谢和体内运输的遗传信息来帮助预测哪些药物可能对特定个体不起作用。
拉古纳瞄准的是一个不太流行的应用程序,希望提供一种算法基因表达评分,可以帮助初步诊断:在这种情况下,当患者出现第一次精神病发作的迹象时,可以区分哪种疾病——精神分裂症或双相情感障碍。
该研究的主要作者、加州大学欧文分校功能基因组学实验室主任马奎斯·沃特(Marquis Vawter)在一份声明中说,Laguna Dx计划解决一个“严重的未满足的需求”。
“目前,还没有fda批准的针对精神疾病的临床诊断测试,”他写道。诊断过程可能需要数月或数年的临床观察和患者报告,因此患者经常需要长时间等待适当的治疗和症状的缓解。
拉古纳所追求的研究假设是,通过找到一种方法来区分不同精神疾病的特定基因表达模式,它可以帮助提供更快、更准确、更客观的诊断,避免长期未经治疗的精神病以及与之相关的自杀和认知能力下降。
上个月发表的研究报告标志着该公司的一个新的里程碑,该公司联合创始人兼首席执行官特里·奥斯本(Terry Osborn)表示,该公司成立于近10年前。
奥斯本本周说:“2009年,在这一点上,全国大约有六名研究人员对精神障碍患者的基因表达进行了研究……(所以)我到处去见了他们,并决定选择加州大学欧文分校的马克·沃特(Mark Vawter),他实际上是第一个在该领域发表论文的人之一。”
尽管该公司从最初的成立到上个月发表的研究报告花了很长时间,但它已经能够展示的东西鼓舞了它。
在分子神经精神病学在这项研究中,研究人员招募了总共90名受试者,分为三个30人的亚组——精神分裂症患者、双相情感障碍I型患者和精神病学对照组——全部在爱荷华大学进行。
然后,研究人员使用Affymetrix外显子微阵列来训练一个mRNA基因表达签名,该签名可以区分这三个亚群,使用的是两次不同就诊的血液样本。这导致了一个18个基因的生物标志物小组,在两个时间点上可以正确区分这三组,准确率在83%到88%之间。
作者承认,对这一初步发现的一个警告是,研究中的许多受试者在抽血时正在服用抗精神病药和情绪稳定剂药物,这增加了这些药物影响基因表达模式的可能性。在临床实践中,该测试需要能够在treatment-naïve未确诊的患者中区分这两种疾病。
奥斯本说,公司希望能够在下一次验证研究中更深入地解决这个问题,但目前的分析确实提供了一些线索。研究人员能够使用一个独立的基因表达数据集,其中包括无抗精神病药物的精神分裂症受试者。当他们将18个基因的生物标记物面板应用于这些数据时,他们仍然能够区分30岁以下的精神分裂症患者,准确率为86%。
然而,所有非药物受试者的准确性下降到仅64%,这突出了一个事实,即拉古纳需要在进一步的研究中重复这种类型的分析,以更有力地证明该测试将在预期人群中起作用。
该研究的作者得出结论,目前的数据虽然是初步的,但确定了在经历第一次精神病发作的患者中应用已识别的基因组可以帮助识别哪些人可能患有这两种疾病中的一种,哪些人没有。这些发现现在必须在独立的样本集中进一步验证,最好是在数量多得多的受试者中进行。
根据研究人员的说法,他们希望解决的其他问题包括,是否有一种mRNA信号不仅与鉴别诊断相关,而且与治疗反应等相关。
该团队还对目前的小组是否可以用于精神病学评估的其他方面感兴趣,例如,将重度抑郁症患者细分为更像精神分裂症或更像双相情感障碍。
奥斯本说,美国国家心理健康研究所已经建议该小组在申请下一项研究的拨款之前,应该咨询美国食品和药物管理局,以确保收集正确的数据,为未来的监管申请提供支持。该公司目前正在撰写一份相关方案,打算在年底前将其提交给FDA,并在明年的某个时候开始下一项研究。
该公司的计划是再次使用全基因组微阵列,但该公司还打算选择一个与之配套的平台,以便更容易地应用于临床。
在目前的研究中,该公司对NanoString的nCounter进行了一些实验,奥斯本说,这是该公司正在考虑的几个平台之一,所有平台都有“优点和缺点”。
在未来的商业化方面,该公司还将面临其他精神病学基因组学领域的挑战,如药物基因组学公司Assurex健康(现在归Myriad Genetics所有)。最值得注意的是,它必须证明这种类型的测试不仅可以证明分析和临床有效性,而且还可以证明临床效用。
精神病学家和临床医生将需要被说服,基因组测试实际上会带来更好的患者结果,而保险公司将希望看到任何结果改善都伴随着相关成本节约的证据。