纽约(GenomeWeb) -卡罗林斯卡学院的一个团队将使用2800万瑞典克朗(300万美元)的研究经费，进一步开发一种多组学前列腺癌检测方法，以及设计后续诊断方法，以帮助治疗该疾病的患者。
这种基于血液的测试叫做Stockholm3该测试由一组蛋白质和遗传标记组成，已经在卡罗林斯卡医学院提供，作为实验室开发的一种测试，用于识别患侵袭性前列腺癌风险更高的男性。
利用Erling-Persson家庭基金会提供的新资金，研究人员的目标是在新的队列中进一步验证Stockholm3，扩大小组中标记物的数量，并开发下一代基于测序的预后测试，以改善转移性癌症的治疗。
“通过将基因组学、蛋白质组学和成像技术相结合，我们拥有了显著改善前列腺癌诊断的工具，”卡罗林斯卡医学院癌症流行病学教授Henrik Grönberg说，他负责监督该项目。
Grönberg告诉GenomeWeb，这项工作的官方名称是“个体化前列腺癌诊断管道”，资金将覆盖未来三年的所有研究成本。
除了Grönberg的组织，参与的合作伙伴还包括卡罗林斯卡大学医院、斯德哥尔摩市议会和英国前列腺癌组织。
预计后者将在明年开始对英国医疗系统中1万名男性进行Stockholm3测试的评估，其中五分之一将是非裔。Grönberg表示，类似的验证研究计划在比利时、德国、荷兰和挪威在未来两年内进行。
Grönberg说:“国际上对Stockholm3测试有浓厚的兴趣，包括希望在医疗保健环境中验证该测试的研究小组和实验室提供商。”
他说，其中包括美国医疗机构Kaiser Permanente和前列腺癌基金会(前列腺癌基金会)等。
从这些不同的研究中收集到的所有信息将被过滤到卡罗林斯卡大学的努力中，以建立一个以斯德哥尔摩为中心的诊断工具箱3。该测试依赖于5种蛋白质生物标志物，100个SNPs和临床数据来确定衡量患有侵袭性前列腺癌风险的单一评分，定义为Gleason评分至少为7。
Grönberg网站说:“对患者来说，这只是一个简单的血液测试，就像前列腺特异性抗原测试一样。”
在2012年至2014年期间，该测试在斯德哥尔摩大都市区的6万名男性中进行了评估。所谓的STHLM3试验的结果介绍了在柳叶刀肿瘤学去年。通过使用Stockholm3，研究人员能够将侵袭性癌症的检出率提高20%，同时与临床实践相比，将不必要的活组织检查减少一半。他们还能够在PSA浓度低的患者中检测出侵袭性癌症。
从那时起，该测试已通过卡罗林斯卡大学医院作为LDT提供。Grönberg说，瑞典国家健康和福利委员会目前正在评估Stockholm3在国家筛查计划中的使用。
卡罗林斯卡使用赛默飞世尔科技公司的产品进行Stockholm3测试。Grönberg指出，他的团队已经与赛默飞世尔公司“密切合作”开发测试之前描述的该伙伴关系是“与联合开发团队、解决问题和分享知识的密切合作”。
Stockholm3的遗传成分是使用Thermo Fisher公司的QuantStudio 12K Flex实时PCR系统进行的，这是一种桌面设备，可以在大约20分钟内进行定量PCR分析。Stockholm3的血浆蛋白分析组件使用赛默飞雪的ImmunoCAP ISAC进行，这是一种基于生物芯片的免疫分析平台。
Grönberg指出，赛默飞世尔未来将致力于Stockholm3测试套件的商业化。
他承认确实存在其他基于血液的前列腺癌多重检测，但说它们不包括遗传标记，也没有在大型队列中进行前瞻性验证。
虽然他没有指定竞争小组，但用于确定前列腺癌侵袭性的基于血液的检测包括一些人专注于生物标志物AR-V7．位于马萨诸塞州剑桥市的Exosome Diagnostics公司最近推出了一种以尿液为基础的测量病人肿瘤侵袭性的试验。
测试管道
Grönberg表示，有了这笔新资金，他的团队应该能够实现四个主要目标。首先是在非白种人人群中验证Stockholm3。他说，与英国前列腺癌协会的合作，以及在欧洲其他地方计划的其他项目，应该会推进这一目标。
Grönberg的团队也可能会随着这些研究信息的生成而扩展测试本身。其他研究小组也建议在Stockholm3中添加标记，卡罗林斯卡大学甚至制定了一个使用内部生物库评估这些标记的流程。
该团队还对将Stockholm3与磁共振成像结合，然后进行靶向活检感兴趣。Grönberg说:“我们的假设是，Stockholm3测试结合MRI将进一步增加临床意义重大癌症的检测。”
该小组目前正在进行一项基于800个核磁共振成像的可行性研究，并将很快开始一项更大的、10,000个队列的随机对照试验。如果结果是积极的，卡罗林斯卡大学将在2018年开始使用Stockholm3结合MRI。
还设想了一种与Stockholm3相关的基于预后测序的测试。
他说:“对预后标记物的需求很大，我们相信从活检中分析的基因组标记物可以成为一种选择。”
为了开发测试，Grönberg将依赖于瑞典癌症临床测序项目开发的工具(ClinSeq)，由他执导。ClinSeq成立于2013年，致力于构建癌症基因组分析的基础设施，着眼于设计新的基于基因组学的测试。根据Grönberg的报道，ClinSeq档案包括对所有650个与癌症相关的基因进行测序，以及进行RNA-seq来估计所有2万个人类基因的表达水平。
Grönberg表示，他的团队将评估大约2000个样本，然后进行前瞻性验证研究。基于这一分析结果，Grönberg的团队将为前列腺癌活组织检查开发一份浓缩的、“经济高效的档案”，随后可在临床上实施。
他说:“我们的想法是开发一种肿瘤特征的基因组评分，可以补充Gleason评分。”
Grönberg指出，前列腺癌是瑞典最常见的癌症形式，每年有超过10,000例病例和2,500例死亡。这些新的测试应该有助于识别和治疗那些患有恶性癌症的患者，改善健康状况，降低死亡率。