纽约(360Dx) -一组国际研究人员正在开发一种新的检测方法，可以用来指导前列腺癌的治疗选择，特别是在晚期病例中。
由意大利特伦托大学的研究人员领导的研究小组最近获得了5年500万英镑(640万美元)的奖励，以推进其工作。这笔资金是通过加速器奖项目获得的，该项目由英国癌症研究中心、西班牙抗癌协会和意大利癌症研究协会资助。三人宣布总额为3000万英镑为欧洲癌症研究提供资金。
据首席研究员Francesca Demichelis介绍，这项被称为PRIME的预期测试将使用从患者样本中获得的液体活检进行，并将依赖于基因组、甲基组学和转录组学标记来得出个性化的结果。PRIME代表前列腺癌血浆综合多模态评价。
德米凯利斯是特伦托大学综合生物学中心(CIBIO)的研究员，多年来一直致力于开发一种测试，用于监测前列腺癌患者的治疗反应，特别是那些患有耐药疾病的患者。然而，新的CRUK奖可以为她的团队的研究最终进入临床提供一个平台。
她说:“这个奖项改变了我们的心态，因为它支持我们开发框架，将一种工具交到临床医生手中，可以用于他们自己的研究。”
Demichelis和他的同事已经在目标测序板上对游离细胞DNA进行了分析。她说，他们过去使用过Illumina技术，并将继续在工作中使用Illuminvwin德赢ac米兰合作a仪器，尽管他们已经尝试过其他技术。他们还使用安捷伦技术、罗氏的NimbleGen产品和其他方法进行面板设计。她没有详细说明。
该测试背后的核心概念是一种多模型设计，除了其表观基因组学和转录组学外，还可以查询无细胞DNA的基因组学，数据均来自目标测序面板。Demichelis说:“我们的想法是开发这样一种测试，即三种成分可以一起使用，并从分析的角度进行集成。”她指出，PRIME正在开发中，因此每个组件都可以以独立的方式运行。她说:“这将为未来在临床中使用这种工具来描述患者分子特征的肿瘤学家提供更大的灵活性。”
德米凯利斯拒绝详细说明测试的具体内容。她说，在接下来的五年里，该团队希望对从意大利和英国的网络中提取的样本进行分析。伦敦大学学院癌症研究所的临床科学家Gert Attard是这项新项目的联合负责人。Attard说，该团队将在共计1000名患者的多个队列中运行PRIME。
长期以来，Attard一直致力于开发治疗癌症患者的新方法。他说:“我们治疗癌症的方法是给病人服用A药，等待反应，到那时已经有数百万个癌细胞，没有耐药克隆的可能性非常低。”“所以我们看到的要么是对治疗的初步抵抗，要么是初步反应很浅，而且通常是短暂的。”
Attard说，他和Demichelis通过PRIME引入的概念——通过观察各种组学数据点来得出可以指导治疗的结果——对临床研究界来说不应该“太有争议”，尽管验证这样的测试给团队带来了许多挑战。
阿塔尔德说:“我们在从DNA中获取信息方面有很多经验，但我们可以进一步改进。”他补充说，有必要“跳出思维定式”，将对无细胞DNA的分析扩展到早期疾病，当癌细胞的比例较低．通过对序列数据、甲基化和表达进行更广泛的研究，该团队希望在PRIME的开发过程中克服这些障碍。
阿塔尔德说:“我们的测试有许多探索性的方面。“如果我们在未来18个月内获得的数据获得成功，我们将继续开发这三个方面。很明显，在转录本中有一些重要的信息没有被DNA捕获。我们要充分利用血液。要做到这一点，我们需要非常可靠的分析。”
PRIME的未来可用性尚不清楚。Demichelis说，一旦PRIME被验证，该团队将向意大利的一些站点提供测试，这些站点是一个更广泛的、由55个成员组成的癌症网络的一部分，名为met - uro，即意大利泌尿肿瘤研究网络。这反过来又有助于推动PRIME成为临床研究的免费工具。
Demichelis说:“该工具是一个组合解决方案，其中一个部分包括所有优化的协议，用于收集和处理每个单独的组件。”她说:“我们设想，数据生成可以在本地使用NGS设施完成，也可以由第三方完成，而计算将在云解决方案中完成。”“(患者样本的)分子特征将被直接传送到该部位。”
研究人员还认为，该工具可以在正在进行的临床试验中用作分层工具。Demichelis指出:“目前有200多个针对转移性前列腺癌的公开试验。“患者最常见的评估方法是组织活检，这是一个很大的障碍。”
然而，PRIME的故事也可能有商业方面的因素。
阿塔尔德说:“一旦我们的工作完成，我们谁都不想在大规模样本上进行测试。”“那会淹没我们的工作，”他说。Attard建议，通过与该领域的老牌商业参与者或提供该服务的分拆公司合作，可以对更多样本进行更广泛的审查。
许多公司已经投资于基于液体活检的前列腺癌检测，尽管应用不同。例如，基因组健康，今年早些时候Oncotype DX AR-V7，使用其合作伙伴Epic Sciences设计的检测方法运行。该测试可用于明确确定哪些患者更有可能对雄激素受体信号传导抑制剂治疗产生反应，哪些患者更适合化疗。
MDNA生命科学宣布在英国上映这是一种液体活检方法，开发人员声称可以用于在活检之前检测前列腺癌。8月，美国实验室公司已获取license到MDNA公司的技术vwin德赢ac米兰合作，为PSA水平升高的患者开发一种测试，以确定他们患有临床显著前列腺癌的风险。
到目前为止，考虑到PRIME的多模式模式，还不清楚它会采取什么形式的商业测试。Attard强调，开发和验证该测试是研究团队目前的首要任务。他说:“我们正在对这三种方法进行分析开发，一旦我们有了分析上可靠的、适合目的的测试，我们将在一些队列中实施它们。”
他补充说:“一旦检测合格，我们还需要考虑在商业上什么是最可取的，以增加检测的使用。”我们才刚刚开始，但当我们审视地平线时，这就是我们需要达到的目标。”