本文已更新，以澄清作为正确10K研究的一部分，对于系统中还没有测试结果的患者，基于他们的种族和他们所服用的药物，PGx测试的有限数量的决策支持警报。
截至今年年初，梅奥诊所(Mayo Clinic)一项研究药物基因组学效用的10,000名参与者已经对77个基因进行了基因测序，其中一部分信息已被存入他们的电子医疗记录中，而大部分数据正在推动更多的研究。
Right 10K研究的目的是评估在患者需要之前，在他们的EMRs中预先获得PGx信息是否能改善他们的结果，并通过避免不良事件节省医疗费用。
随着测序工作的完成，有13个与药物反应相关基因变异的研究参与者已经将这些信息纳入他们的EMRs中，以便在护理点通过临床决策支持警报向医生提供，同时与其他基因相关的信息也可用于研究。Richard Weinshilboum是梅奥诊所的药理学教授，他是个体化医学中心药物基因组学项目的联合主管，他说他的同事们现在专注于收集证据，以证明PGx检测在人群中的临床效用，并发现新的药物/基因相互作用。
在开始Right 10K之前，梅奥进行了一项涉及1000名患者的试验，结果表明，只要有5个基因/药物对，99%的患者都有可操作的变体。Weinshilboum说:“最终，药物基因组学将成为每一次治疗过程中不可或缺的一部分。”“我们预见到了这一点，我们希望在梅奥医院为此做好准备。”
然而，梅奥的目标从一开始就不只是为了研究而研究，而是实施一个项目，从这些调查中吸取教训，并利用它来改善病人的护理。这就是为什么当梅奥与贝勒医学院合作为了对1万名患者的药物基因进行测序，他们确保在clia认证的实验室进行测试。这将确保一旦有证据证明新药/基因相互作用的有效性，就可以迅速添加到患者的EMRs中。
Weinshilboum致力于研究基因变异对药物反应的影响，他相信药物基因组学将成为临床基因组学中最先普及的一个方面。他开玩笑说:“一个人在这一行干了这么久，连自己的观点都没有，这一点也不夸张。”但是为了广泛的消费者采用，Weinshilboum承认测序的成本必须进一步降低，需要有更多的证据来证明常见和罕见变异对药物反应的影响，医生和患者都需要认识到这些信息的价值。
梅奥十多年来一直有这些目标，同时它一直在稳步投资资源，以进行像Right 10K这样的研究。例如，2009年，它在明尼苏达州罗彻斯特校区建立了一个生物储存库，开始收集和存储样本，为研究提供燃料。然后，在2012年，它开设了个体化医学中心(CIM)，以容纳领先的生物标志物研究和医生教育工作的专家。2013年，梅奥开始在其EMR系统中构建PGx决策支持警报。
对于Right 10K的参与者，因为他们已经接受了测试，他们的数据已经在EMR中，决策支持系统就改变药物或剂量提出了具体的临床建议。一旦测试完毕，PGx结果和信息学公司OneOme的一份报告(包括他们对大约400种药物的反应能力的信息)就会被添加到EMR中，并将报告副本邮寄给患者，并上传到他们的在线患者门户网站上。对于没有参与研究且在EMR中还没有PGx结果的梅奥患者，有限数量的PGx决策支持警报建议基于他们正在服用的药物和他们的种族或民族进行基因检测。
当研究人员进行正确的10K研究时，一路上都有挑战。Weinshilboum说:“我们对我们正在进入的事情的复杂性有些naïve。他举例说，事实证明，从贝勒大学向梅奥大学导入测序数据非常困难，因为这两家机构的系统以不同的格式存储这些数据。
兼容性问题现已解决，序列数据在手，梅奥的重点是了解这些信息如何先发制人地影响患者的长期结果和医疗成本。这些信息对于像Weinshilboum这样的PGx支持者所希望看到的广泛接受是必要的，因为这需要保险公司的参与。
不幸的是，PGx测试很少能满足付款人的证据要求，这仍然是利益相关者之间辩论和争议的话题。例如，评论最近出版的在临床药理学与治疗学“，斯坦福大学的Teri Klein及其同事对保险公司要求进行随机对照试验提出了异议，认为这样的研究通常是不必要的、不切实际的，甚至是不道德的。
Weinshilboum说:“在我们谈论的这种规模下，进行随机试验几乎是不可能的。”他补充说，梅奥已经与几家保险公司进行了讨论，试图更好地了解他们希望看到的数据类型。据Weinshilboum说，虽然许多保险公司仍然有PGx测试的非覆盖政策，但有几家公司已经表示有兴趣为某些受益群体提供这种类型的测试。他说:“但是他们想要证据，他们想要参与设计证据产生的方式。”
Right 10K项目通过对基因测序而不是对特定snp进行基因分型，也积累了大量数据，启动了数十个研究项目，以探索未来可在临床应用的新型遗传变异的功能。梅奥在其内科教师中发起了PGx研究提案的征集活动，目前已有30个机构审查委员会批准的方案。
他说:“我们的教职员工提出的提议数量之多让我们感到震惊，他们说想用这1万名患者来测试药物X。”“真正开处方的是现场的(医生)，他们对哪些药物是问题，哪些药物是他们想要测试的最有创意的想法。”
从教师那里获得研究思路也是向梅奥的医生传授药物基因组学知识的一个机会。提出这些项目的医生通常会参与到研究中，并通过经验成为特定实践领域药物基因组学的重要人物，帮助其他同事跟上速度。
“当然，(医生)会阅读教科书和期刊文章，但我们总是会问我们的同事，他们是如何治疗病人或处理某个问题的。我们互相学习，”个性化医疗中心副主任康斯坦蒂诺斯·拉扎里迪斯说。“如果有人是一个冠军，致力于一个项目，从中学习，并看到它的价值，那么这个人就是向实践的其他部分传播这些信息的最佳人选。这就是我们使用的模式。”
当药物遗传学第一次在一位高血压患者身上发挥作用时，梅奥的家庭医生、预防医学专家塔米姆·拉乔(Tamim Rajjo)有点难以置信。Rajjo给这位患者开了两种常用的一线药物，利尿剂和ACE抑制剂，但当她的血压仍然无法控制时，他又给她开了β受体阻滞剂美托洛尔(Toprol)。一周内，患者抱怨非常疲劳，这是美托洛尔的常见反应，通常通过降低剂量来控制，Rajjo在这个病例中就是这样做的。
尽管如此，这位平时很活跃的病人还是继续抱怨疲劳。最终，Rajjo决定查看她的PGx测试报告，发现她携带了CYP2D6变异，这使她美托洛尔代谢能力较差。基于此，他决定停止美托洛尔，并在不同的药物类别中给她一种药物。“这就像一个开关。对她来说，这就像白天和黑夜，”他回忆道。“我很难相信会是这样。”
尽管Rajjo过去曾参加过药物基因组学的讲座，但这是他第一次在实践中实施它。他说:“我是被迫把它结合起来的，但这是有道理的。”“这种药物并不是这名患者的最佳选择。时期。这让我大开眼界。”
同时，对于正确10K研究的参与者，他们的医生现在会收到警报，如果他们在13个药物基因中有可操作的变体，这些变体已被纳入决策支持。虽然PGx信息可能不会对每个患者都起作用，但当决策支持提醒他可能有重要的交互时，Rajjo肯定会注意并采取适当的行动。对于那些同时服用五种或五种以上药物的患者，那些药物-药物或药物-基因相互作用的风险更大的患者，他会积极地查看他们的医疗记录，寻找这些潜在的问题。
Rajjo不会说自己是技术的早期采用者。他打趣道:“如果iPhone 10上市，我五年后就会买。”他说，在遇到这位高血压患者之前，他对药物基因组学并不熟悉，并承认他感到内疚，因为他没有更清楚地意识到这一点，所以他可以更快地帮助她。
“当你看到患者生活的变化时，你会感到好奇，”他说，并指出他特别感谢他收到的关于参加Right 10K和其他研究的患者潜在PGx相互作用的警告。尽管Rajjo的许多同事还没有为他们的病人订购测试，但他说，在药物基因组学方面吸引和教育医生的最好方法是“将科学与实践联系起来”。
梅奥并不是唯一一个致力于实施先发制人的药物基因组学，并对医生进行该学科教育的大型学术卫生系统。近年来，全国各地的莫菲特癌症中心、北岸大学健康系统、佛罗里达大学和范德比尔特大学都开展了类似的项目。然而，随着这些项目的形成，美国食品和药物管理局(fda)，这个曾经直言不讳地支持药物遗传学的机构，已经转向了更为谨慎的立场。
去年，该机构发布了一份安全警报警告医疗保健提供者不要使用未经FDA批准的PGx测试。由于该机构对实验室开发的测试(LDTs)已经有了大约20年的实践执法自由裁量权，市场上大多数PGx测试，包括那些通过Mayo等医疗保健系统内的先发制人测试项目提供的测试，都是在没有FDA批准的情况下，在CLIA实验室进行的LDTs。
这是该机构最近发布的安全警报警告信在未经监管机构批准的情况下，Inova Health System的基因组实验室提供了PGx检测，这一行为受到了律师和药物基因组学专家的批评。斯坦福大学的Klein和圣裘德儿童研究医院的Mary Relling都是临床药物遗传学实施联盟(CPIC)的联合首席研究员特定的问题FDA建议，“既定”PGx信息的唯一来源是其更新或批准的药物标签。
例如，FDA声称“CYP2C19基因型与药物对艾司西酞普兰和舍曲林的反应之间的关系尚未建立”，他们在药物基因学知识库的一篇文章中断言网站PGx专家发布的CPIC指南也是有效的信息来源，该小组在回顾文献后得出结论，CYP2C19表型对这两种药物是可行的。
梅奥成立了一个特别工作组，审查了FDA更新的PGx信息的药物标签，以及来自CPIC和荷兰药物遗传学工作组的建议，以确定提醒医生注意的特定药物/基因对。与Weinshilboum共同指导梅奥中心个体化药物基因组学项目的王利伟说，药物/基因关系被纳入EMRs，并有“充分的临床证据”支持的决策支持警报。
在拉扎里迪斯看来，即使有证据支持使用许多药物基因组学适应症，限制成功率的主要步骤仍然是医生教育和允许将这些信息整合到临床实践的工作流程。梅奥试图解决这个问题的一种方法是在决策支持系统中嵌入“询问梅奥专家”功能，向医生提供关于药物/基因相互作用的在线教育信息。
拉扎里迪斯说，在研究方面还有更多的工作要做。他指出，虽然梅奥医院正在进行的研究旨在提高医生教育水平和展示临床效用，但仍有必要提高对遗传学和其他因素对药物反应的相互作用的理解。拉扎里迪斯说:“除了药物基因组学之外，还有很多关于药物代谢的额外信息。”他指出，两个具有相同遗传变异的人对特定药物的反应可能仍然非常不同。
“不仅基因信息对药物代谢很重要。它是你吃什么、喝什么，以及你接触到什么。”“这是另一个层次的知识，我们甚至没有能力完全理解，但这是我们代谢药物的重要组成部分。”