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研究表明,遗传乳腺癌风险SNP评分比传统方法提高

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年代anantonio - Myriad Genetics本周公布了86 SNP乳腺癌风险评分的完整验证数据,该公司认为,这可以帮助护理大量缺乏众所周知的癌症相关基因突变的女性。

在昨天的圣安东尼奥乳腺癌研讨会上,Myriad的研究人员展示了一项涉及1600多名患有和未患乳腺癌的欧洲血统女性的研究。他们表明,与单独使用Tyrer-Cuzick模型相比,多snp风险评分与Tyrer-Cuzick模型(考虑了各种患者特征及其乳腺癌家族史的风险估计)在预测女性5年和终生乳腺癌风险方面具有更好的预测性。

Myriad公司生物统计学研究高级经理、验证研究的首席研究员以利沙·休斯在SABCS上说:“这个综合评分比Tyrer-Cuzick的歧视准确性要高得多。”“对于一般人群样本,综合得分的平均风险将与Tyrer-Cuzick的平均风险匹配得非常一致,(表明)校准是相同的。”

riskScore测试是myRisk的一个附属项目,这是一个下一代测序小组,测量与八种遗传癌症风险升高相关的28个基因。具体来说,myRisk中11个乳腺癌相关基因的突变——BRCA1、BRCA2、TP53、PTEN、STK11、CDH1、PALB2、CHEK2、ATM、NBN、BARD1——具有较高或中等风险,但仅在10%的女性中出现。

为了开发一种更广泛实用的测量方法,Myriad最近推出了riskScore,该公司声称,它可以为大多数这些基因中没有致病突变的欧洲血统女性提供信息。麦利亚德公司的首席医疗官乔纳森·兰开斯特在会议上接受采访时表示,那些myRisk乳腺癌风险基因检测呈阴性的女性“通常没有任何答案”。“她们可能知道自己有乳腺癌家族史,但却无法从基因上解释。”

当未受乳腺癌影响的女性,如BRCA1/2、TP53等众所周知的高危基因呈阴性时,临床医生面临着一项艰巨的任务,即如何建议她们加强MRI监测、药物化学预防或双侧乳腺切除术。“在(突变)阴性患者中,这是一个非常困难的讨论,特别是双侧乳房切除术的利弊,”MD Anderson癌症中心临床癌症遗传学项目的联合主任Banu Arun在一次采访中说。“在临床中,我们都希望模型或分数能够帮助我们进行这些讨论。”

Myriad进一步对近6500名没有乳腺癌且myRisk阴性的欧洲裔女性进行了联合算法的队列评估,报告称38%的人终身风险大于20%,7%的人终身风险大于35%。

在一般人群中,大约12%的女性会在一生中患乳腺癌。然而,当女性一生中患乳腺癌的风险增加到20%或更多时,以Tyrer-Cuzick为例美国癌症协会(American Cancer Society)、国家综合癌症网络(NCCN)和美国妇产科医生大会(American Congress of Obstetricians and Gynecologists)建议,她应该每年接受一次核磁共振(MRI)筛查和乳房x光检查。兰卡斯特说,那些终生风险超过35%的人也可以采取更积极的干预措施。

SABCS的一些专家指出,有数据表明,Tyrer-Cuzick在某些情况下可能高估了乳腺癌风险,并质疑这可能会如何影响Myriad的综合风险评分识别风险较低人群的能力。Arun说,临床不仅需要识别高风险患者,还需要识别风险较低的患者,这样低于20%风险阈值的患者就可以避免进行核磁共振检查和其他干预。

RiskScore报告了作为连续变量的乳腺癌风险估计。在验证研究中,在6500名患者队列中,风险估计从0.88%的低到66%的高。Lancaster指出,验证研究为riskScore的准确性提供了高可信度,但尚不清楚临床医生将如何处理这些信息。

在SABCS,专家们对这个和其他多基因评分是否准备在临床中实施持不同意见。贝勒医学院(Baylor College of Medicine)的助理教授朱莉·南吉亚(Julie Nangia)说:“我确实认为,未来我们会有更多的测试来研究这方面的问题。”她指出,她已经为一些患者订购了Myriad的风险评分系统。然而,Nangia补充说,在医生完全了解其临床用途之前,需要有更多的测试经验。

兰卡斯特回忆说,当临床医生第一次了解到BRCA1和BRCA2带来的风险增加时,许多人不愿意建议他们的患者采取预防措施,如乳房切除术和卵巢切除术。兰卡斯特在加入Myriad之前曾指导莫菲特癌症中心(Moffitt Cancer Center)的女性肿瘤中心。他说:“当时,很多医生对自己理解BRCA1突变意味着什么没有信心。”“人们花了很多年的时间才意识到,基于风险(信息)做一些相当激进的事情是可以的。”

他预测了在临床实践中整合riskScore的类似轨迹。

在NGS小组的情况下,如myRisk,许多社区肿瘤专家已经感到不确定关于如何处理基因突变只会轻微增加女性患乳腺癌几率或外显率不明确的患者。当基于snp的风险评分与中等风险基因(如ATM)一起使用时,还可以提供更明确的风险评估。

携带BRCA1或BRCA2基因突变的女性一生中患乳腺癌的风险分别高达65%和45%,指南建议从特定年龄开始进行更频繁的筛查和降低风险的手术。相比之下,对于ATM基因突变的女性来说,乳腺癌的患病风险会增加到17%到52%之间机构提供具体的筛查指南,但指出没有足够的证据提出降低风险的乳腺切除术的建议。

兰卡斯特说,即使在BRCA1/2的情况下,也不是所有的突变都是相同的。他说:“我们仍在试图理解为什么一个家庭成员在31岁时患了乳腺癌,因为她携带了BRCA1基因突变,而一个姐妹携带了完全相同的基因突变,却完全没有患乳腺癌,或者在七八十岁时患了乳腺癌。”

兰开斯特表示,尽管Myriad目前只向myRisk结果为阴性的女性推销riskScore,但许多专家表示有兴趣与该公司合作,研究这些snp是否可以提高对myRisk小组中11个基因之一发生突变的女性的乳腺癌风险的了解。

澳大利亚彼得·麦卡勒姆癌症中心的伊恩·坎贝尔说,他的团队已经开发了一种多基因乳腺癌风险测试,并计划将其用于5%到10%的女性身上,这些女性的低至中度风险基因发生了突变,而这些突变本身是不可操作的。

梅奥诊所(Mayo Clinic)的乳腺癌遗传学研究员费格斯·库奇(Fergus Couch)不同意多基因风险评分已经准备好在临床应用。然而,他认为这些评分应该继续在研究环境中使用,因为它们似乎是传统风险测量方法(如Tryer-Cuzick)的有用补充,对于那些高危基因没有突变的女性来说。

一个例子是智慧审判这是一项偏好容忍的随机试验,对10万名年龄在40至75岁的女性进行了基于风险的乳房x光检查方法与年度乳房x光检查的比较。对于接受个性化筛查的女性,研究人员正在使用乳腺癌监测联盟的模型来评估她们的非遗传风险因素,同时对她们进行9个高外显性基因的检测,并使用Color公司进行的96-SNP多基因检测来确定她们5年患乳腺癌的风险。BCSC和多基因风险评分(很快将包括153个snp)都经过校准,用于不同的种族。

麦利亚德的风险评分目前只针对那些医生指出她们是欧洲血统的女性。然而,每个在myRisk上测试的患者,无论种族,也将根据Tyrer-Cuzick得到他们一生的疾病风险估计。

兰卡斯特表示,Myriad正在收集其他族裔的数据,以便riskScore能更广泛地应用。他说:“我们希望能够为每一位患者提供这一服务,不论其种族。”

Arun说,虽然在临床中有多基因风险评分的需要,而且一些医生正在使用这些评分,但大多数医生可能希望在广泛采用这些措施之前看到这些措施是否有助于他们的决策和改善患者预后的前瞻性数据。如果最终有数据显示这些多基因风险评分之间的比较情况,也会有所帮助。

“它们都是建立在不同的群体之上的,”她说。“但在理想的世界里,如果把所有这些队列和风险评分进行比较,那不是很好吗?”

最终,为了利用这些风险模型并明确了解它们的效用,多达100万名女性需要在WISDOM这样的试验中进行研究,该项研究的主要研究员之一劳拉·V·安特·维尔(Laura V 'ant Veer)说。她说:“这是我在这次会议上的请求,我们团结起来,讨论如何把这一切结合起来。”

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