精准医疗公司Tempus在过去几个月里进入了以COVID-19为例的传染病市场，进一步扩展了其数据驱动的诊断方法。
今年5月，这家总部位于芝加哥、拥有1600名员工的公司宣布，将在其在芝加哥和亚特兰大获得clia认证和cap认证的实验室开展COVID-19诊断PCR测试，同时开发基于测序的呼吸道病原体小组。本月早些时候在美国，Tempus获得了美国食品和药物管理局的紧急使用授权，该测试是Thermo Fisher Scientific ABI TaqPath COVID-19组合试剂盒的改进版本。
除了提供诊断性SARS-CoV-2检测外，Tempus还与学术伙伴合作，开始构建和汇总多达5万名covid -阳性患者的真实世界临床和基因组数据，包括多达1万名患者的RNA-seq转录组数据，目的是更好地了解这种疾病以及它如何影响不同的人。
今年6月，该公司还任命威尔·康奈尔医学院生理学和生物物理学副教授克里斯托弗·梅森(Christopher Mason)为新兴基因组技术副总裁，负责开发和建议下一代测序技术、将临床元数据与组学数据联系起来的计算方法，以及研究宿主对COVID-19的反应。vwin德赢ac米兰合作
梅森表示，他不会永久离开威尔康奈尔大学，但计划休假几个月，在Tempus和其他几个组织专注于与covid -19相关的研究和开发。他说:“我基本上是在做COVID-19的小休息，只是为了尽可能帮助更多的人。”
Tempus首席执行官埃里克·莱夫科夫斯基(Eric Lefkofsky)表示，该公司的机器学习和人工智能诊断方法将不同类型的患者数据添加到测试结果中，可以应用于许多疾病领域。德赢ac米兰区域虽然该公司开始研究癌症，但它宣布了计划进入抑郁症和心脏病学去年，他觉得自己已经做好了进一步拓展的准备。他说:“当新冠病毒来袭时，我们希望扩展到其他疾病领域，所以我们只是优先考虑传德赢ac米兰区域染病。”
莱夫科夫斯基说:“任何疾病领域，如果感染这些疾病的患者群体存在很大的异质性，并且有各种结果和可能的治疗方法，那么这些领域都可以通过大数据、机器学习和人工智能来增强。”他说，目标是创建“智能”实验室测试，方法是在测试结果中包括和分析其他类型的数据，并使测试尽可能个性化。
虽然人工智能增强诊断是该公司的总体目标，但过去几个月来，Tempus的COVID-19“标准”诊断业务已经开始起飞。梅森说，在两个实验室之间，该公司现在每天进行大约1.2万次SARS-CoV-2测试，如果需要，有能力每天进行1.5万次或更多测试。
根据该公司的网站，从收到样品到检测结果的周转时间为24到48小时，测试的零售价为100美元。莱夫科夫斯基说，Tempus已经与CVS健康公司、伊利诺斯州公共卫生部、大学、学校系统和其他州的机构建立了多种合作关系，为患者提供这项测试。
他说:“除了只进行测试之外，我们还收集了一些结果和反应数据，以及一些表型数据。”患者在收到测试结果后可以自愿提供这些数据。他说，目前约75%的患者选择提供这种额外的信息，包括表型数据、治疗COVID-19的药物，以及患者对这些药物的反应。
他说，随着时间的推移，坦普斯希望利用这些数据建立疾病严重程度和治疗效果的预测指标。他说:“这不仅关乎诊断，关乎你是否COVID-19阳性，还关乎为医生和患者提供数据，让他们知道什么疗法最有可能有效，以及如何最好地个性化治疗。”
莱夫科夫斯基说，虽然该公司本可以在其实验室中使用商业供应商的EUA进行SARS-CoV-2检测，但它选择申请自己的EUA，主要是因为在开始检测时，还没有很多检测收到EUA。
Tempus公司目前正在开发一种可以在家收集样本的测试版本，希望很快将其推向市场。它还在验证一种结合了流感和SARS-CoV-2检测的检测方法。
此外，该公司正在开发基于测序的呼吸道病原体小组，计划在今年晚些时候或明年年初推出。梅森说，公司一直在考虑不同的版本，并正在梳理出哪种版本是最好的。包括Illumina、Twist Bioscience和安捷伦科技(Agilent Technologies)在内的多家公司已经将下一代呼吸道病原体测序面板推向市场，“我们一直在研究所有这些公司，”他说。他补充说，为呼吸系统面板提供短的周转时间是非常重要的，因此测试结果对患者仍然有意义。
莱夫科夫斯基说，与此同时，Tempus的COVID-19数据计划“进展顺利”。该公司已与几家未公开的学术医疗中心和大型医院系统签约，成为合作伙伴，迄今已收集了超过1万名患者的临床数据。对于其中的一小部分，Tempus还将执行RNA-seq分析。根据梅森的说法，病毒测序数据和全基因组测序数据也适用于一些患者。目的是构造和管理临床数据和分子数据。
梅森说，他在Tempus的主要目标之一——尽管他也参与了将RNA测序整合到该公司的癌症诊断中——是为COVID-19计划建立患者网络，该计划的目标是增加到5万名患者。他说:“我的目标是让它成为真正的公私利益，让尽可能多的人可以获得尽可能多的数据，以尽快了解COVID-19。”“它可能对疫苗、治疗、高危患者的分层都很有用。”
莱夫科夫斯基说，该项目没有时间表或终点。“这只是在建立第一个我们认为可以帮助回答一些问题的大型数据集，”他说。
所有关于COVID-19的工作都没有让Tempus分心肿瘤检测业务不过，美国显然没有受到大流行的影响。莱夫科夫斯基说:“我们的癌症业务继续以三位数的速度增长”，这超出了2020年的计划。