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阿尔茨海默病的疾病Meta分析识别新型差异甲基化基因座

纽约 - 通过对阿尔茨海默氏病的外观一致性协会研究的荟萃分析,一支国际研究人员已经确定了与不同脑区中神经纤维缠结的蔓延相关的新型差异甲基化基因座,并穿过皮质。

一篇论文在周四发表自然通信研究人员指出,阿尔茨海默氏症的Ewas突出了神经病理学相关的DNA甲基化差异,但它们在样本尺寸中受到限制,并且通常研究了大脑的不同区域。对于它们的荟萃分析,它们组合来自六种DNA甲基化研究的数据,总共1,453个个体,并确定与称为Braak阶段的神经纤维纤维缠结相关的差异甲基化。

他们在颞叶皮质中发现了236个显着的CPG,在颞弧菌95中,10个在Entorhinal皮质中,小脑中没有。总体而言,研究人员表示,十字皮质荟萃分析确定了与神经病理学相关的220个CpG,注释为121个基因。其中,以前没有以这种意义阈值报告84个基因。

“我们的研究是其最大的研究,对可能有一天的基因组区域提供了重要的见解,这是埃克塞特大学和研究高级作者的埃克塞特教授Katie Lunnon,在一份声明中表示。“这项工作的下一步是探讨这些表观遗传学是否导致所表达的基因和蛋白质水平的可测量变化。然后,这将允许我们探索我们是否可以将已知改变表达水平的现有药物能够重新培养现有的药物这些基因和蛋白质,有效治疗痴呆症。“

前额定皮层代表了研究人员最大的数据集,具有961个样品,它们鉴定了236个显着的差异甲基化位置,其中193个被注释为137个基因,43个未催化的基因座。以前的前额叶皮质的Ewas始终报告了Hoxa基因簇作为在阿尔茨海默氏症中高甲基化的区域,其中细胞型特异性Ewas证明这是衍生自神经元的。实际上,研究人员报告说,它们在霍氏菌中留在霍尔达3中的前额叶皮质中发现的最重要的差异甲基化位置,另外16个显着的差异甲基化的位置也向该基因注释。

“作者写道,”该基因座似乎在前额叶皮质中具有更高的Braak阶段,并在颞克鲁斯中稍微小的程度。“

它们还鉴定了许多新基因,包括一些具有多种显着的差异甲基化的位置。前额外皮质中的一个值得注意的新型位置被注释给ADAM10,一种编码α-分泌酶的基因,其在非淀粉样蛋白途径中切割应用。

它们对其颞克鲁斯Ewas数据集进行了类似的荟萃分析,其鉴定了95个显着的探针,其中75个被注释为53个基因。Entorlinal Cortex数据集的荟萃分析鉴定了10个显着探针,注释为八个基因,包括ANK1和SLC15A4基因。

研究人员表示,随着小脑中缺乏缺乏显着的探针,表明,Alzheimer的DNA甲基化变化是Cortex细胞类型的特异性。该观察结果与小脑中的神经纤维缠结缠结相关,尽管已经在该区域中报道了一些漫反射淀粉样蛋白β斑块。

研究人员然后将数据组合在不同的皮质组织中以鉴定常见的差异甲基化基因座。它们发现220个显着的探针,其中168个被注释为121个基因,并且观察到所有皮质队列和组织的类似DNA甲基化模式,用于220探针。总共154个差异甲基化的位置是高甲基化的,66个是脱甲基化。

十字皮质分析中最显着的探针是CG12307200,其位于TPRG1和LPP基因之间的代族区域中。此探针以前据报道,与神经斑块负担和后期诊断具有重要关联。

研究人员还报道了十字皮质荟萃分析确定了174个新型显着的差异甲基化的位置,注释为102个基因。尽管先前已经报道了这些基因11,但其余96个代表阿尔茨海默氏症的强肥大,而且这些新型基因中的许多具有多种显着的探针。

“许多这些基因座是新的,并且需要进一步研究,以探讨其在疾病病因中的作用,”作者结束了。“我们强调提名的表观遗传变化在很大程度上与遗传效应无关。”

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