纽约- Enumerix是一家由基因组学行业全明星团队组成的新数字PCR公司，已经推出了一种低成本的数字PCR方法，每次反应可以产生3000万个液滴，大大扩展了现有技术的动态范围。
该公司预计将在明年年底之前推出一款基于这种方法的商业产品，最初主要用于研究和无创产前检测市场。
该公司正在推广其下一代测序技术，作为广泛动态范围概念vwin德赢ac米兰合作的证明，它已经开发了NIPT分析，在单管工作流程中检测染色体13、18和21中总共222个位点。
Enumerix由Stephen Fodor、Christina Fan和Ari Chaney三人于2019年创立，他们之前曾在单细胞分析公司Cellular Research工作。
该团队在基因组学领域有一些令人印象深刻的诚意。Fodor曾在1992年与人共同创立Affymetrix，而Fan则是一名合作发明者和史蒂芬·奎克一起钱尼、福多和奎克于2011年共同创立了细胞研究公司。那家公司收购了作为更广泛基因组学的一部分策略用于单细胞研究，而Affymetrix是收购了2016年，赛默飞世尔以13亿美元的价格收购了该公司。
Enumerix的总经理亚伦·所罗门(Aaron Solomon)在一次采访中说，他们的团队“在细胞研究方面取得了巨大的成功，他们认为这非常有趣，他们想再做一次。”
Enumerix数字PCR方法不需要微流体，而是使用廉价的消耗品搭配标准的实验室设备。
所罗门说，液滴发生器是一种带有气孔的塑料装置。
这一块可以装进标准的200微升的管带中。样品与Enumerix的专利乳液物质一起装入，然后管条装入适配器，允许将其放入任何标准的实验室离心机。
他说:“它旋转了20分钟，离心力产生了一个水滴喷头，这些水滴进入了PCR管。”
该公司的乳液化学设计是为了将液滴沉淀到管的底部，允许在标准的热循环器中更有效地加热和冷却。它也很清晰，所以使用该公司专有的Light Sheet扫描仪仪器对管进行3D成像很简单。
与其他方法相比，增加分区数量可以增加检测的动态范围。所罗门说，这种反应的死体积为零，可以装载四倍于其他技术的样品，这两种技术都可以提高灵敏度。这在罕见分子的检测中可能特别重要，例如液体活检应用。
如在分析化学本周，成像仪器对500帧乳化液滴进行采样，并将其编译成PCR管的3D重建。然后定制软件定义分区并计数荧光液滴。
Light Sheet目前配置为检测四种颜色，Solomon说该公司可以轻松地使用组合方法在一次检测中检测12个目标。“我们可以做一些其他的技巧来超越这一点，”他说。
处理48个样本的总运行时间为2小时，而且工作流还可以实现自动化。
所罗门说，每个样品的消耗品总成本不到10美元。Enumerix计划将耗材、读取器和专有软件商业化，用于对试管进行成像，Light Sheet扫描仪的成本“与市场上数字PCR领域的其他扫描仪相当，”Solomon说。
Solomon表示，虽然其他仪器的动态范围超过4 log，但Ultra-dPCR可将动态范围扩展至2 log。“这意味着我们可以提供额外的灵敏度，而且我们不需要滴定到适当的检测浓度，”他说。
该公司负责Light Sheet仪器的工程总监Janice Lai也加入了细胞研究团队，Enumerix公司产品开发主管、该研究的第一作者Eleen Shum也加入了该团队肛门化学研究。
Shum在一次采访中说，一些系统要求用户估计样品中的分子，并在加载前稀释它们，“但在我们的测试中，你只需要把它扔进去，它就会捕获所有的分子。”
所罗门说，222-plex检测13、18和21三体，这些三体是可操作的和可报销的。
Solomon还说，NIPT空间是Enumerix的早期目标市场，但该系统也可以用于研究和翻译市场，以测量拷贝数变化和转录水平，并计数细胞转染。在临床领域，它适用于液体活检方法和微小残留疾病的检测，以及需要计数转染细胞和寻找脱靶转染的细胞和基因治疗技术。
所罗门说:“我们认为自己是CLIA实验室的合作伙伴，他们将开发这些测试。”
他说，总的来说，快速、廉价、直接的工作流程也有助于更广泛地获得基因检测，并可能提高检测的公平性。
破坏性的潜力
Ultra-dPCR系统似乎填补了NGS工作流程昂贵且缓慢的详细数据和qPCR速度快、成本低但靶标较少之间的空白。
最近，数字PCR领域也在不断发展。主要参与者Bio-Rad Laboratories和Stilla Technologies现在正在与Qiagen、Thermo Fisher Scientific和Roche的新的dPCR技术竞争，他们都在争夺使用更少仪器的更多颜色通道和更高的每液滴多路复用。
Raindance -一家公司收购了由Bio-Rad在2017年-声称1000万水滴的技术，以及几年来的几家创业公司，比如vwin德赢ac米兰合作Espira而且Lamprogen他们利用离心力与微流控芯片相结合来产生液滴。但Enumerix在产生液滴的数量方面无疑具有优势，因为大多数商业系统每次反应都会产生数万个液滴。
所罗门说，拥有3000万个液滴还可以消除“多重占用”问题，即一个液滴中不止一个分子被放大。这个问题需要其他技术来部署泊松统计，以获得正液滴的计数。
“我们可以对数百万个分子进行真正的分子计数，”他说。
而且，尽管Light Sheet扫描仪只有四种颜色，Solomon说这种消耗品的低成本可以让用户在多个管上进行检测。
多年来，数字PCR领域也充满了诉讼，与此相关，授予Fan和Fodor的单细胞专利一直是BD的一部分诉讼与10x基因公司的竞争定居．
但Enumerix已经开发并获得了广泛的知识产权组合，包括液滴生成、扫描技术和一些NIPT应用程序，Solomon说，并与其法律顾问密切合作，以确定该公司可以自由地在该领域运营。vwin德赢ac米兰合作
Shum指出，这种消耗品与其他技术也有“本质上的不同”，这将避免其他公司在微流体和液滴生成方法上遇到的知识产权问题。
Enumerix目前有一些学术合作，但还没有公开披露。它的早期版本肛门化学纸张最初是寄到bioRxiv8月。
所罗门说，到目前为止，这家位于加州帕洛阿尔托的公司一直是自筹资金，但Enumerix计划开始筹集资金用于商业化，并在明年年底全面商业化。
“我们认为我们有一个广泛适用的平台，”他说，并补充说，该技术“达到了正确的平衡，解决了迄今为止阻碍数字PCR的一些挑战。”vwin德赢ac米兰合作
Enumerix目前希望在夏天之前在现场拥有仪器，并一直在关注一些会议，并希望展示数据和海报。
而且，尽管数字PCR初创公司最近似乎被收购得相当快——去年赛默飞世尔公司收购了收购了Combinati和Bio-RadDropworks例如，Solomon说Enumerix并不将其视为端点。
“我们参加比赛是为了赢得比赛，”他说。