纽约(GenomeWeb) - Diomics是亚利桑那大学最近的一个分支,专门从事下游DNA分析的样本收集技术,在过去的一个月里实现了一些积极的发展,以支持其最近推出的旗舰生物样本收集产品,用于法医和分子诊断应用。
首先,上月末,北德克萨斯大学健康科学中心著名法医专家布鲁斯·巴道尔(Bruce Budowle)实验室的研究人员发表了一项研究,表明Diomics的核心技术Diomat从血液和唾液样本中提取的DNA和PCR产物明显高于知名的竞争生物样本收集技术。vwin德赢ac米兰合作
此外,Diomics最近获得了美国专利商标局授予的两项美国专利,涵盖其样本采集技术和相关方法的各个方面;vwin德赢ac米兰合作上周,该机构任命前美国国家过敏和传染病研究所(National Institute of Allergy and Infectious Diseases)内部研究主任托马斯•金特(Thomas Kindt)为首席安全官。
最后,Diomics公司首席执行官John Steel表示,该公司最近搬进了位于加州Carslbad的新工厂,并拥有更大的生产设施,目前正在加大其第一款产品X-Swab的生产,用于从生物样本中收集DNA,用于DNA定量和STR分型等下游法医分析PCR内幕这个星期。
斯蒂尔说,X-Swab产品已经上市约三个月了,“我们不仅在销售它……我们不得不提高产量,因为我们的订单超过了我们的生产能力。”“在取证和诊断领域,对这类设备的需求很大。”
斯蒂尔拒绝更详细地量化这一需求,但他断言,就从血液中恢复DNA而言,“我们比相关的商业产品好8到9倍”,而对于唾液样本或口腔拭子,“我们在DNA呈现方面大约好3到4倍”。这些不是增量变化——就你能从一个小样本中得到什么而言,这些是量子飞跃。”
该论文由UNTHSC团队发表于国际法医学:遗传学似乎证实了斯蒂尔的说法。
在这项研究中,研究人员比较了Diomat样本收集材料的平方(X-Swab产品尚未上市)与Copan Flock的Copan 4N6FLOQSwab的恢复DNA和产生成功的STR分型结果的能力。
Diomics的Diomat技术vwin德赢ac米兰合作最初由亚利桑那大学开发,并授权给Diomics,是一种具有极高稳定性的聚合物材料,具有高吸收率,能够从各种表面提取生物材料,但它也可以在特定的提取条件下溶解,从而将收集到的大部分DNA释放到溶液中。与此同时,Copan Flock产品由垂直排列的短合成纤维组成,旨在最大限度地提高DNA收集和洗脱效率。
UNTHSC团队选择Copan Flock产品与Diomics的技术进行比较,因为与其他商业收集产品相比,“我们在自己的实验室中看到了Copan的vwin德赢ac米兰合作最佳回收率”,前Budowle实验室成员、最近这项研究的第一作者帕梅拉·马歇尔(Pamela Marshall)说PCR内幕这个星期。“我们想采用市场上最好的产品之一,并将其与这种新型棉签进行比较。”
研究人员使用已知数量的纯化DNA,以及不同数量和稀释的全血和唾液样本,比较了两种收集材料的性能。他们通过DNA定量和STR分型评估了DNA恢复,使用了许多不同的DNA提取试剂盒和法医PCR平台。
研究人员指出,Diomics产品在纯化DNA 1纳克和2纳克时的DNA产量与Copan Flock产品相当,但在纯化DNA 5纳克时的DNA产量是Copan Flock产品的两倍——接近但未达到统计显著性。
同时,Copan Flock产品在1:5稀释全血时的DNA回收率略高于Diomics产品,而Diomat在1:10和1:50稀释全血时的DNA回收率显著高于Diomat。类似地,x -拭子材料在各种唾液稀释中显示出显著更高的DNA产量。
研究人员还评估了仅使用Diomat材料的1:100全血稀释,发现当DNA产量与不使用拭子材料的对照进行比较时,平均回收率为80%——数据与先前获得的结果一致,表明很大一部分DNA可以从较低数量的DNA类型样本中回收。
此外,STR分型结果表明,与Copan Flock产品的DNA相比,从Diomat材料中提取的DNA倾向于产生更高的峰高,研究人员证明这一结果可能是由于PCR中的Diomat提取物增加了产量。他们推断,这是由于Diomat材料在特定的DNA提取条件下几乎完全溶解,可能比其他材料产生更多完整的DNA片段。
马歇尔说:“对于我们几乎所有的样本,从提取方法到不同类型的样本,几乎所有时间X-Swab[材料],即使DNA数量相同,也能提供更高的[PCR产物产量]。”“这种聚合物的共纯化肯定会产生影响。此外,当你有这样的东西,几乎溶解在提取时,你也可能得到更好的DNA链,而不是从[其他基质]中得到更好的DNA链,因为它们的收集方式可能是碎片化的。”
马歇尔总结说,总的来说,Diomat材料对法医科学家来说是一个福音,特别是当考虑到传统上DNA含量太少的样本时,无法进行有意义的分析。
Marshall说:“只要稀释1- 100,回收率就能超过80%,这对该领域来说是非常重要的。”“我确实认为它在其他实验室会表现得很好……我真的认为这将影响各个层面的犯罪实验室。”
马歇尔现在是新奥尔良南方大学法医学项目的临时主任,她指出,如果她在巴道尔实验室有更多的时间,她会想用上皮细胞测试棉棒材料,以模拟所谓的“触摸DNA”样本——例如,当一个人抓住门把手时留下的DNA。她还指出,尽管她的新实验室可能不会进行这样的研究,但巴道尔实验室可能会。
事实上,Diomics的Steel指出,该公司目前正在与多个实验室合作,继续在各种法医应用中测试x -拭子。这包括一种“DNA胶带”产品,可以实现马歇尔提到的那种上皮细胞收集和DNA纯化。Steel指出,该公司希望在未来四个月内推出这样一款产品,作为X-Swab产品的补充。
此外,该公司还着眼于分子诊断领域,从非常小的生物样本中收集DNA并从这些棉签中洗脱最大数量的DNA的能力可能是一个主要优势。
斯蒂尔说:“通过诊断,我们将寻求通过使用更小的触摸、血液、唾液和尿液样本,而不是大瓶的这些样本,在肿瘤学、糖尿病和其他疾病载体方面取得进展。”“如果你在寻找β细胞死亡,胰岛细胞死亡,这将与糖尿病有极大的相关性;或者肿瘤学,寻找一些已知的标记,并且在不运输大量材料的情况下这样做。”
斯蒂尔表示,自2012年从亚利桑那大学分离出来以来,Diomics已从私人高净值人士那里筹集了大约270万美元,目前正在寻求额外的资金来帮助推动扩张。
此外,亚利桑那州董事会代表亚利桑那州立大学于4月获得了美国专利号8685,747,“用于生物样本收集的多孔材料”。Diomics有这个专利的许可吗这项交易是由亚利桑那州立大学的亚利桑那科技企业帮助撮合的,因此专利上有亚利桑那vwin德赢ac米兰合作州立大学的名字。
斯蒂尔说,Diomics上个月获得了自己的专利,美国编号为8,759,075,“生物样本收集装置及其生产和使用方法”——这是该公司预计在未来几个月获得的几项额外专利中的第一项。
斯蒂尔说,有了这项专利保护,Diomics现在“在各个方面进行合作,包括取证和诊断机会,以及其他一些应用”。“在未来几个月的某个时候,你可能会看到一个相当重要的企业合作伙伴关系,”他补充道,但没有详细说明。
“我们甚至还没有触及表面,”他补充说。“光是法医就需要数百万份棉签,加上这些薄膜和其他潜在的应用,这是一个新的、有趣的机会。”