纽约(GenomeWeb)——斯德哥尔摩的一项前瞻性、基于人群的研究表明,结合血浆蛋白生物标志物、遗传多态性和临床变量的前列腺癌筛查方法可能会减少标准前列腺特异性抗原筛查可能发生的过度诊断。
这项研究是赛默飞世尔科学公司和卡罗林斯卡学院医学流行病学和生物统计学部门Henrik Grönberg正在进行的一项合作研究的结果。
在这项研究中,今天在网上发表柳叶刀肿瘤学,研究人员指出,在检测具有高风险特征的癌症(Gleason评分至少为7分)时,筛查试验明显优于单独的PSA。
该方法包括血浆蛋白生物标志物PSA和其他五种蛋白质的检测,以及232个与前列腺癌相关的多态性的qPCR基因分型,以及年龄和家族史等临床变量。
为了选择患者,作者使用税务登记簿随机联系50至69岁的瑞典男性,并邀请他们进行筛查。该评估方法被称为斯德哥尔摩3,或STHLM3模型,分别在11130名男性和47688名男性的训练和验证样本上与PSA单独进行了比较。
最终,作者预测这种筛查方法可以减少约三分之一的活组织检查次数,并可以避免44%的良性活组织检查。
他们进一步指出,在美国,前列腺活组织检查减少30%,相当于每年减少约30万例手术,但该方法仍然可以在PSA浓度低的男性中识别出临床显著的癌症。
赛默飞世尔的新业务——临床下一代测序和肿瘤学研发副总裁吉姆·戈德西(Jim Godsey)在接受GenomeWeb采访时表示:“对于生物标志物来说,像这样规模巨大、具有前瞻性的试验非常罕见。”
STHLM3测试具有商业潜力,但Godsey表示,该项目仍处于转化研究阶段。他补充说,赛默飞世尔大约一个月前创建了临床测序业务,这项测试是肿瘤学投资和IVD重点的代表。
Henrik Grönberg在一封电子邮件中告诉GenomeWeb,当他的团队在2011年开始计划STHLM3研究时,它正在寻找满足周转时间、所需血浆和DNA量以及每个样本成本要求的蛋白质和遗传平台。
Grönberg表示:“我们很快意识到,位于乌普萨拉的赛默飞世尔科技公司(Thermo Fisher Scientific)拥有出色的多路复用技术,可以适应并用于我们在癌症方面的需求。”并补充说,该小组选择了赛默飞世尔vwin德赢ac米兰合作的QuantStudio 12K Flex实时PCR系统,因为它“灵活、快速、易于使用”。在这项研究的蛋白质检测方面,研究小组使用了该公司的ImmunoCAP ISAC,这是一种基于生物芯片的免疫分析平台。
Grönberg将与赛默飞世尔的合作描述为“与联合开发团队的密切合作,解决问题并分享知识。”
Grönberg表示,STHLM3测试将于2016年3月在瑞典进行实验室开发测试。
他指出,其他几个国家的团体和组织已经联系了研究人员,他们对在各自的地理位置和临床环境中验证该测试感兴趣。他补充说:“与赛默飞世尔的研究合作使得在全球范围内进行合作变得容易。”
QuantStudio 12K Flex最初是推出了2011年底,赛默飞世尔生命科技公司推出了该产品。赛默飞世尔公司基因科学产品管理总监Elliot Shelton在接受GenomeWeb采访时表示,这是一个仅供研究使用的系统,可以通过灵活的配置运行大量的靶标。
该平台的主要特点之一是能够运行OpenArray板,这是该公司的纳米流控qPCR技术。vwin德赢ac米兰合作Shelton解释说:“这是一个非常灵活的系统——OpenArray格式有11种不同的可配置格式,所以你可以从任何地方选择16个目标,最多256个目标。”
用户可以从大约900万个预先设计的SNP检测中进行选择,定制qPCR阵列,该公司还可以设计定制检测,例如在卡罗林斯卡研究中使用的检测。谢尔顿说,这些板是在Thermo现场制造的,样品和主混合物由用户添加。
但Shelton指出,QuantStudio 12K Flex系统的一个主要区别在于它使用可移动的块,因此研究人员可以使用96孔板或OpenArray板,每次运行大约可以进行12000个qPCR反应。
由于系统配置的灵活性,成本有所不同。他说,对于支持openarray的版本,价格不到20万美元。该公司没有公开这些平板的价格,但Shelton指出,纳米流体反应的大小允许最小的试剂使用量,使得像卡罗林斯卡研究这样的大型项目更具成本效益。
Shelton进一步说,自从OpenArray问世以来,已经有190篇论文使用了OpenArray技术,该公司的网站上有一个可分类、可过滤的列vwin德赢ac米兰合作表,以帮助研究人员。
Thermo公司现在将继续致力于前列腺癌筛查试验的商业化。Thermo公司的Godsey说:“提供我们的工具的好处是,有时与Grönberg博士一起获得这样的美妙结果,然后能够将其商业化,并创造出一种对全球男性产生影响的fda批准的产品。”