随着新员工的加入和几名新成员进入其科学顾问委员会，便携式质谱公司908 Devices正转向蛋白质组学市场。
本月，该公司宣布在SAB内部成立了一个专门的蛋白质组学小组，由来自多个研究领域的6名领先的蛋白质组学研究人员组成。该公司还聘请Will Thompson担任首席科学家，他曾是杜克大学蛋白质组学和代谢组学的助理研究教授，也是杜克蛋白质组学核心的副主任。
在生命科学领域，总部位于波士顿的908传统上专注于生物制药市场，定位其ZipChip毛细管电泳样品分离平台和Rebel基准质谱系统，用于生物制剂表征和生物加工。
908的首席技术官克里斯•布朗(Chris Brovwin德赢ac米兰合作wn)表示，该公司不断收到来自现有和潜在客户关于其工具蛋白质组学应用的询问。
他说，再加上研究人员和投资者对蛋白质组学的兴趣日益浓厚，公司决定探索进入该领域。
SAB蛋白质组学小组的六名成员是普林斯顿大学分子生物学教授Ileana Cristea;Cedars-Sinai医疗中心的医学教授Jennifer Van Eyk;吕南菲尔德-塔南鲍姆研究所高级研究员Anne-Claude Gingras;哥本哈根大学诺和诺德基金会蛋白质研究中心教授兼副主任Jesper Olsen;Renã范德比尔特大学化学系副教授罗宾逊;以及斯克里普斯研究所分子医学教授约翰·耶茨。
此外，随着汤普森等人的加入，908正在“围绕这个领域建立内部专业知识”，布朗说。他说，该公司还与SAB小组以外的蛋白质组学研究人员建立了关系和合作，并补充说，该公司计划在今年秋季的美国质谱学会年会上展示部分工作成果。
ZipChip设备是908蛋白质组学战略的核心。毛细管电泳(CE)长期以来一直被认为是蛋白质组学研究的一种潜在分离工具，但迄今为止，它被广泛地用于生物制药工作和DNA分析，而液相色谱在蛋白质组学研究中占主导地位。
CE根据蛋白质和多肽的质量和电荷分离蛋白质和多肽。与信用证相比，这种方法具有潜在的优势，也许最显著的是速度。布朗说，ZipChip可以在大约8分钟内实现分离，而LC需要大约2小时。
奥尔森说:“你可以得到非常尖锐的峰值，比通常使用LC得到的峰值要尖锐得多。”“这使你能够在很短的时间内集中大量信号，这使你在质谱仪中获得比LC分析的等效样品强得多的[信号]。”
Olsen说，限制CE在蛋白质组学中使用的主要因素之一是该技术能够处理的样本量相对较小。vwin德赢ac米兰合作
“这一直是主要问题，”他说。“容量太低了，所以你无法装载足够数量的多肽来真正运行复杂的混合物。”
蛋白质组学向包括单细胞蛋白质组学在内的更小样本的转变，以及能够分析这种小样本的更快、更灵敏的质量规格的发展，使CE成为一个潜在的有用工具。
他说:“现在，大规模配置的扫描速度非常快，每秒可以分析多达40甚至100个肽。”“所以他们有处理这种非常尖锐的色谱所需要的测序速度。”
具体到ZipChip，他说其基于芯片的格式使其成为蛋白质组学研究人员潜在的有吸引力的设备。
他说:“一切都是整合的。”“他们有一个源，你可以直接点击质谱仪，从我所看到的，它可以适应大多数流行的质谱仪。所以这让更广泛的社区更容易获得它。”
奥尔森说，他的实验室有兴趣探索CE在使用小样本量的实验中的效用，如单细胞蛋白质组学和临床工作。
Brown说，虽然蛋白质组学领域朝着更小样本量的方向发展为ZipChip提供了机会，但908公司也有兴趣修改该技术，使其更适合更大的样本量。vwin德赢ac米兰合作
他说，这可能涉及样品制备方面的工作，包括可能将某种形式的样品浓度纳入系统，或者可能与另一家公司合作，将他们的样品制备技术纳入其中。vwin德赢ac米兰合作他举了蛋白质组学初创公司Seer的例子，该公司在质谱分析之前使用纳米颗粒对蛋白质组学样本进行分离和富集。
他说:“我们正在两面派工作。”“我们能否适应更大的样本量，并将其压缩到更小的体积，以便与CE一起使用?同时，是否有大量的蛋白质组学从本质上面向更小的样本量，在这方面我们有直接优势?”
908公司希望取得进展的另一个领域是自上而下的蛋白质组学。CE在这一领域已经比自下而上的蛋白质组学更加普遍，包括斯克里普斯的耶茨在内的研究人员已经探索它的效用自上而下的研究。
这个月，自上而下蛋白质组学联盟发起了一项新的倡议，为在自上而下研究中使用CE制定指导方针。该组织在一份声明中指出，“CE提供的高分辨率在分离生物和生物制药样品中的各种蛋白质形式和非共价蛋白复合物方面将特别有价值。”
Neil Kelleher是西北大学生命过程化学研究所的主任，也是一名顶级的自上而下蛋白质组学研究人员，他说，在自上而下研究中，CE是反相LC的补充，允许分离和识别用LC检测不到的蛋白质形态。在他看来，这是原生模式蛋白质质谱仪的最佳分离选择，原生模式蛋白质质谱仪分析蛋白质的折叠态。
他说:“在变性的、自上而下的发现模式中，如果你同时使用LC和CE，你可以识别出新的蛋白质形态。”他特别指出，CE在分离磷蛋白质形态方面更有效。他补充道:“在原生模式中，LC世界中确实没有(与CE)类似的东西。”
Kelleher不是908蛋白质组学小组的成员，他说他已经与该公司就其CE技术进行了沟通。vwin德赢ac米兰合作
在CE领域，908并不是唯一一家。Sciex一直是为蛋白质组学研究提供CE系统的主要供应商之一，今年1月收购了总部位于加州弗里蒙特的CE公司Intabio，尽管该交易主要集中在生物制药领域，而不是蛋白质组学市场。
此外，今年6月，Thermo Fisher科学公司与加拿大安大略省的Advanced Electrophoresis Solutions公司签署了一项协议，根据协议，两家公司将共同推广Thermo Fisher的质谱系统用于生物制药和蛋白质组学应用，以及AES的全柱成像检测毛细管电泳系统用于蛋白质分离、量化和表征。
虽然ZipChip是908蛋白质组学推广的重点，Brown说该公司也在探索Rebel桌面质谱系统在蛋白质组学领域的可能应用，最有可能用于有针对性的分析。
他说:“你可以想象，在未来，如果你正在做定向蛋白质组学分析，而不是一个大规模的发现实验，如果你知道你在寻找什么，[Rebel]可能能够完成这项工作，并在某种程度上普及对这类分析的访问。”“我们不会让Thermo或Bruker倒闭。”