生物医学公司brigene Biosciences正在扩大其化学蛋白质组等压质量标记亲和特性(IMTAC)平台的项目管道,以发现和开发用于难以药物治疗靶点的小分子,并计划在来年启动至少一个ind启用项目。
该公司最近还与武田制药(Takeda Pharmaceutical)进行了合作,涉及使用IMTAC平台确定神经退行性疾病的药物和治疗靶点。
IMTAC平台通过一种专有的计算算法,通过药物与目标分子的相对结合亲和性,将药物与目标分子进行匹配。该平台主要包括三个关键元素:独特的共价小分子库、活细胞筛选和定量质谱分析。
活细胞暴露在一个小分子库中,其成分与细胞的蛋白质结合。然后细胞被裂解,从文库中提取与分子结合的蛋白质。这些蛋白质被富集并消化成质量大致相等的多肽(等压),用于质谱分析,从而识别蛋白质并量化它们与相应小分子的相对结合亲和力。
然后,BridGene评估任何与感兴趣的细胞靶点结合的小分子,以判断它们影响疾病表型的能力。
这一策略与其他公司将高通量蛋白质分析技术应用于药物研发的策略类似铁路联运疗法,它执行蛋白质下拉,然后等压标记和质谱。
brigene的联合创始人兼首席执行官曹平解释说,IMTAC有几个不同之处,其中关键是其专有的小分子库,实现蛋白质组筛选和活细胞靶向筛选的能力,以及该公司的结合亲和分析算法。
该平台还可用于共价和非共价小分子的筛选。
“据我们所知,竞争平台只专注于共价小分子,”曹说。
“我们最大的优势,”他补充说,“是我们可以识别传统上不能药物的靶点,包括含有浅结合袋的靶点。”
配体结合位点通常对应于蛋白质表面的大的和/或深的裂口。囊袋的深度可以通过限制配体的运动,并以几何形状将其锁定在适当的位置,从而有助于加强囊袋内发生的任何结合活动。相比之下,浅的结合囊通常需要更多的结合能来固定配体,如生物活性化合物,这使得锁定这些位点更具挑战性。
最近,该公司通过2021年AACR-NCI-EORTC分子靶点和癌症治疗虚拟国际会议上的5个摘要展示了IMTAC的药物和靶点发现能力。
讨论的发现包括难以药物靶点的小分子配体,如RhoA、TEAD1、SRSF1和WDR5,以及以前未知的伊布替尼和舒尼替尼的非激酶靶点。
该公司目前正处于开发TEAD1小分子抑制剂的早期阶段,用于治疗间皮瘤、胶质母细胞瘤、脂肪肉瘤和胰腺癌等。该公司还发现了几种表观遗传调节剂WDR5的抑制剂,并计划开发针对WDR5依赖性癌症的新药,该药物基于该屏幕上的铅撞击,名为BGS2597。
最后,BridGene已经确定了致癌RhoA-Y42C突变的共价配体,该配体可以抑制含有突变的CCK-81细胞系的细胞生长。
TEAD1项目目前是进展最快的。该公司计划明年进行一项IND支持研究,并希望在2023年申请IND。
尽管该公司没有透露其他项目的细节,但它有一个繁忙的管道计划。
“我们将主导优化三到五个项目,并将完成[一个]在活的有机体内每两年研究三个项目,”曹说,“然后将一到两个项目转入IND(阶段),然后我们将批准其他项目。”
曹补充说,在这些项目中,brigene将继续改进IMTAC平台,“将引入更多优化,以进一步提高吞吐量,扩大我们的小分子库。”
BridGene目前使用IMTAC平台与一些生物技术和制药公司合作。例如,该公司最近扩大了与武田的合作,以发现神经退行性疾病的靶点和小分子候选药物。
武田公司神经科学药物研发部门负责人Ceri Davies在一份声明中说:“使用BridGene的新型化学蛋白质组学平台可以帮助我们快速识别新的靶点和新的候选药物,这些药物有可能靶向使人衰弱的神经疾病的潜在机制。”
BridGene成立于2018年,于今年5月完成了1200万美元的a轮融资。