NEW England Biolabs、Waters和Genos公司已同意支持人类Glycome项目,在未来三年提供价值300万欧元(340万美元)的无偿试剂和服务。
人类Glycome项目联合主任、克罗地亚萨格勒布大学生物化学和分子生物学教授Gordan Lauc表示,新的合作伙伴关系将在2021年底前支持对3万个人类样本中的聚糖进行分析。
Lauc说:“这个想法是让糖科学以外的研究人员能够将糖组学添加到他们的研究中。”他说:“沃特斯和NEB将提供消耗品,而Genos将使用这些消耗品进行聚糖分析。”
去年10月,劳克帮助启动了人类糖精计划。哈佛大学国家功能糖组学中心主任理查德·卡明斯(Richard Cummings)是该项目的另一位联合主任。这项全球努力以人类基因组计划为蓝本,旨在绘制人类糖缀合物(或聚糖)的结构和功能,即共价附着在蛋白质主干上的低聚糖。
组织者认为,通过更好地了解聚糖结构及其对功能的影响,有可能了解单个蛋白质或复杂的多蛋白质和多细胞系统的功能。聚糖活性的改变与多种疾病有关。
“人类的糖源极其复杂,关于糖源的知识远远落后于关于基因和蛋白质的知识,”Lauc指出。“有必要协调该领域研究人员的活动,以确保最佳地利用现有资源。”
劳克还说,该项目是标准化分析方法、化学标准和数据库的工具,这样就可以比较不同实验室获得的结果。
该项目的目标包括:以蛋白质和特定位点的方式绘制聚糖结构,记录所有人类细胞和组织中所有糖蛋白的个体间和个体内的变异性;确定单个聚糖对其糖缀合物功能的影响;了解调节糖基化的机制、途径和系统;以体液和组织特异性的方式描述正常的人类糖原;制定协议、试剂、分析工具和报告指南,以促进最佳研究实践;建立人类糖蛋白数据的公共数据库;促进糖科学领域的教育。
该项目去年在克罗地亚的杜布罗夫尼克举行了首届会议,上个月在克罗地亚的斯普利特举行了第二次会议,NEB、Waters和Genos正式成为联合成员。Lauc说,自项目开始以来,参与者一直致力于“确保可以向参与研究人员提供的集中可用资源”。
劳克还是Genos的首席执行官,Genos是一家总部位于萨格勒布的生物技术公司,拥有约50名全职员vwin德赢ac米兰合作工。由于Genos的大部分工作都得到了研究经费的支持,Lauc说Genos在很大程度上是一个“研究机构”,但它也提供糖基化分析服务,使用超高效液相色谱(UPLC)和液相色谱-质谱(LC-MS)。作为准会员,Genos将免费为该计划提供分析服务。
位于马萨诸塞州伊普斯维奇的NEB蛋白质修饰研究科学总监Chris Taron说,该公司自1990年以来一直保持着一个专注于糖生物学的研究小组,并称该公司对人类Glycome项目的支持是其在这一科学领域“兴趣的自然发展”。公司提供多种聚糖分析试剂。它还提供了一个n -聚糖测序试剂盒,可用于典型的特征N-链聚糖结构。
NEB将提供PNGase,这是一种从糖蛋白中分离n -聚糖的酶,作为其对项目贡献的一部分。
Taron说,人类Glycome项目将促进研究人员对糖生物学的理解,并使靶向治疗的发展成为可能。
他说:“NEB相信,这种对人类糖蛋白的系统探索有可能帮助书写转化医学的新篇章。”
总部位于马萨诸塞州米尔福德的沃特斯公司将提供其Acquity UPLC技术和GlycoWorks RapiFluor-MS样品制备试剂盒,作为其对该项目的贡献的一部分。vwin德赢ac米兰合作
根据Lauc的说法,供应商已经同意提供试剂和服务,每年分析1万个人体样本。这些样本将由项目参与者进行分析,这些参与者由该计划的指导委员会挑选。所有分析结果将通过与瑞士洛桑的瑞士生物信息学研究所合作开发的存储库提供给社区的所有成员。
Lauc指出,人类糖源计划目前没有专门的资金。相反,参与调查的人员正在将他们自己相关工作的发现输入到项目中。网站的努力提供一个列表支持人类糖精计划目标的个人资助研究。
该项目目前有五个部门。哈佛大学的卡明斯领导了一个专注于人类糖蛋白多样性的部门,而劳克负责监督人体体液糖蛋白的个体间变异性。澳大利亚格里菲斯大学糖组学研究所的Daniel Kolarich领导了一个致力于人类组织糖组的个体间变异的部门,而佐治亚大学复杂碳水化合物研究中心的Michael Pierce负责监督人类糖组功能相关性和调节的工作。Manfred Wuhrer是荷兰莱顿大学医学中心蛋白质组学和代谢组学中心的负责人,负责负责糖科学分析方法和标准的第五部门。
“所有工作都是由参与研究人员的个人研究项目资助的,”Lauc评论道。“我们希望这种情况会随着时间的推移而改变,我们将能够为该项目提供中央资金。”
在没有主要资金来源的情况下,人类Glycome项目正在制定短期目标,并组织子小组来推进项目的目标。Lauc指出,其中一个目标是分析、分离并将人体内所有主要聚糖作为标准。他说,另一种方法是绘制总血浆糖蛋白和IgG糖蛋白的个体差异,以及它们与主要复杂人类疾病的关系。
哈佛大学的卡明斯说,该项目的成员目前正在参与对人类肺糖蛋白和人脑糖蛋白进行测序。他的研究中心还将合成糖肽和聚糖作为标准,并正在创建人类材料、组织、细胞和糖蛋白的档案,以供全球分布分析。中心也是他说,利用组织化学标本(如病理学家收集的标本)制造聚糖抗体,可用于识别聚糖的空间和时间表达。
卡明斯承认,糖蛋白“比基因组复杂得多”,可能需要“数十亿美元和数十年的工作”来绘制它。卡明斯说:“预计人类聚糖的多样性是巨大的,可能存在数十万种不同的聚糖。”“识别和测序它们,并描述它们在健康和疾病中的表达是一项艰巨的任务。”
与此同时,他说,人类糖蛋白工程的回报可能是巨大的,因为聚糖合成和周转缺陷与许多疾病和紊乱有关。它还将补充基因组学研究。
卡明斯指出:“了解糖蛋白也将使我们对基因组之谜有极大的了解。”他说:“有数百种不同的基因产生和降解聚糖,数千种基因编码蛋白质,成为糖蛋白。”卡明斯补充说,虽然这个项目“令人生畏”,但参与者致力于制定战略和共享资源,包括合成和自然研究材料和数据。
"我们面临着艰巨的任务,”卡明斯说,“但我们无所畏惧。”