血浆和血清中充满了潜在的蛋白质生物标志物，可以提供关于健康和疾病机制的详细信息，而不需要侵入性的医疗程序。质谱是蛋白质生物标志物的理想发现，由于其无偏性，允许完整的血液蛋白质组的探索。血浆蛋白质组的复杂性高，动态范围大，一直是研究的难点。此外，以前质谱重现性有限，阻碍了准确的血浆蛋白质组分析。
现在，蛋白质组学公司Biognosys在2021年展示了其下一代技术癌症免疫治疗学会(SITC)，人类蛋白质组组织(HUPO),美国质谱学会会议。他们展示了该公司的平台是如何推进蛋白质组学的，因此研究人员可以探索可能开启精准医疗新时代的潜在生物标志物。Biognosys已经将其中的一些进展应用到它的下一代血浆生物标志物发现解决方案，于香港科技大学推出。新的解决方案结合了质谱蛋白质组学的最新技术，解锁了前所未有的深度和定量精度，实现真实、无偏的发现。
癌症和阿尔茨海默病的生物标志物发现
在最近的一项癌症生物标志物研究中，Biognosys展示了其血浆蛋白质组学解决方案的强大功能发表在bioRxiv在海报上展示丰而且国际．
该研究分析了180名肺癌、乳腺癌、结肠直肠癌、胰腺癌和前列腺癌患者的血浆蛋白质组自动血浆消耗和FAIMS-DIA．这个优化的工作流程增加了蛋白质组的覆盖率，在队列中识别了2700多个蛋白质，广泛覆盖了组织渗漏蛋白组、白细胞介素和信号蛋白。
该研究的作者发现了几个新的生物学相关的生物标记候选者，确认了已知的生物标记，并开发了使用蛋白质面板按癌症类型和阶段对患者进行分类的模型(参见图1）.
在第二个HUPO的研究报告在美国，Biognosys的研究人员利用他们的血浆蛋白质组学工作流程分析了阿尔茨海默症患者的脑脊液，将8名健康志愿者的脑脊液蛋白质组与16名晚发阿尔茨海默症患者的样本进行了比较。
在阿尔茨海默症患者的样本中发现了400多个明显调控异常的蛋白质，包括几个生物通路。该数据强调了几个翻译后修饰过程可能对阿尔茨海默症很重要，显示了蛋白质组学中分析蛋白质结构对神经科学应用的重要性。
加速血浆蛋白质组学技术vwin德赢ac米兰合作
在ASMS上，Biognosys展示了几项研究，展示了该公司最新的技术进步，将有利于血浆生物标志物研究。例如，公司给出了结果强调自动化深度分析技术在增强低丰度蛋白质和提高覆盖深度而不损害准确性方面的好处。此外，使用对照血浆样本，该研究表明，深度分析将蛋白质组的覆盖率从平均每次实验572个蛋白质增加到1471个蛋白质，同时保持错误率低于1%，证明了增强低丰度蛋白质的生物标志物发现的优势。
一致的结果对于药物开发管道的所有阶段的可转移性至关重要。Biognosys的血浆生物标志物发现解决方案在多个样品、仪器和研究中提供一致的定性和定量结果。Biognosys提出了一个海报在asm展示了使用本质标记的蛋白质从血浆中产生直接可比结果的能力，而不考虑用于获得结果的仪器，突出了现在可以通过质谱法实现的重现性和一致性。
高通量蛋白质组学对于支持大样本量和大数据至关重要，这些大数据可以改善生物标志物的识别。高重复性、自动化、高通量的工作流程现在允许研究人员同时分析数十万个样本。一个最近的初步研究Biognosys的大规模数据DiOGenes减肥研究强调了大量蛋白质组学数据如何支持生物标志物的发现，并将错误识别预测生物标志物的几率降低高达70%。
蛋白质组学创建高度复杂的数据集，没有先进计算的帮助是无法解释的。结果提出了在口头报告中显示Biognosys的扩展机器学习框架(AVALON)将蛋白质识别提高了10- 15%。Biognosys用一秒钟的时间讨论了使用包括深度学习在内的新技术进行数据分析在ASMS上的口头报告．
一种新的血浆蛋白质组学解决方案
Biognosys提供下一代血浆生物标志物发现解决方案，作为生物制药和学术研究人员的合同服务，承诺在每个血浆、血清或生物流体样本中识别多达3000个相关蛋白质，包括无限数量的蛋白质形态，如翻译后修饰。数以万计的肽水平数据点被收集，以确保较高的定量精度和特异性。可扩展的技术和高通量设施意vwin德赢ac米兰合作味着该公司可以量化数千种蛋白质成千上万的样品同时进行。
血浆蛋白质组学现在是一种端到端解决方案，允许研究人员搜索完整的蛋白质组，以深入了解疾病的潜在机制、治疗作用模式、预测生物标志物和治疗反应指标。质谱分析的深度和精度意味着蛋白质组学在便捷、快速和可操作的结果方面接近下一代测序，改变了生物标志物研究的未来。
了解更多关于Biognosys的血浆蛋白质组学产品https://biognosys.com/resources/plasma-biomarker-discovery/或联系Biognosys(电子邮件保护)