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新的倡议旨在推动开发,在自上而下的蛋白质组学中使用毛细管电泳

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纽约 - 随着上个月的推出一项新倡议,一群自上而下的蛋白质组学研究人员正在寻求推动技术开发,并增加在线毛细管电泳的使用作为质量规范分析的分离技术。vwin德赢ac米兰合作

由财团赞助自上而下的蛋白质组学,旨在制定在自上而下的研究中使用CE的准则,并在各种实验室和CE-MS系统中表征当前CE系统的能力。

该倡议是因为CE在生物野蛮行业中看到了显着的摄取,作为完整蛋白质表征的工具,并进入了自下而下和自上而下的蛋白质组学研究。

8月,例如,基于波士顿的CE和大规模公司908个设备宣布该公司在其科学咨询委员会中形成了专门的蛋白质组学小组,公司的首席技术官Chris Brown,并指出它近年来始终收到了当前和潜在客户关于其Zipchip CE平台在蛋白质组学中的应用的询问。vwin德赢ac米兰合作

6月,Thermo Fisher Scientific签署了与加拿大的安大略省的高级电泳解决方案协议,该公司将共同推广用于生物牧师和蛋白质组学应用的热渔夫的质谱系统和AES的全柱成像检测毛细管电泳系统,用于蛋白质分离,量化和表征。

两种形式的Ce,毛细管区电泳,其基于其质量和电荷分离分子,以及毛细管等电聚焦,其基于其等电点分离分子(它们没有净电荷的pH),最常用于蛋白质组学尽管两种技术在蛋白质组学中的常见远远不如液相色谱。

Michigan州立大学助理教授梁良太阳表示,由蛋白质组学研究人员的有限摄取,是由于各种因素。

他指出,一个主要问题一直是CE器件和质谱仪之间的界面稳定性差。另一个重大挑战是CE系统的小型装载能力,其中有限的样本研究人员可以使用CE分离和分析,这反过来限制了质量规范分析的灵敏度。

由于除样本本身之外,这些负载容量限制已经进一步加剧了,所以在建立用于分离样品分子的电连接所需的许多设置中,“鞘液”是许多设置。这种鞘液进一步稀释了西北大学的研究员Kevin Jooss的样品,以及CE主动的领导者之一。

在过去,乔西斯说,这些限制意味着研究人员不能达到足够深入的样品,以分析最受欢迎的蛋白质组的一部分。

“有CE-MS和蛋白质的应用,但总有敏感性或复杂性问题,”他说。

然而,现在,CE技术的改进使研究人员能够与CE达到相似的敏感性,vwin德赢ac米兰合作因为它们可以与Nanolc可以与Nanolc表示。“我们现在达到了人们真正感兴趣的东西,例如癌症相关蛋白质的低丰度蛋白质。”

他说,像Sciex和908个设备这样的公司提高了他们的CE技术的性能和易用性,以应对生物野蛮行业的需求。

优势维持兴趣

仍然持续存在于由于其几种潜在的优势而早期迭代本技术的局限性,特别是为自上而下和完整的蛋白质分离。vwin德赢ac米兰合作

一个优点是什么Alexander Ivanov,东北大学化学副教授和该倡议的领导者,被描述为CE的“开放和管状配置”,它允许它分离蛋白质而不使它们变性,使其符合天然蛋白质和蛋白质复合物的分析。。

CE还能够使用很少的样品损失使用非常小的样品量。此外,CE系统的oboss是非常灵活的,因为毛细管可以涂有不同的化合物,以优化不同种类样品的分离。

“通常,您有一个LC列具有这些属性,如果我想分析不同类型的样本,我需要切换到不同的列,”他说。“带有动态涂层,您可以避免CE,因为您可以从同一基本毛细管开始,并适应您的需求。”

CE还提供比LC更锐利的分离峰。太阳指出,对于将蛋白质和蛋白质复合物等较大分子分离,特别适用。

“如果分析物更慢地扩散,则您的分离效率将更高,”他说。“因此,当我们从小分子到肽到蛋白质到蛋白质复合物时,我们变得更大,更大,这意味着它们漫射较慢,这意味着理论上我们得到更好的分离效率。”

在LC的情况下,该较慢的扩散导致更宽的峰值和更低的数据。

Sun表示,他的小组和其他人的研究还证明了CE提供的灵敏度明显高于LC,注意到CE-MS可以产生与使用LC-MS产生的数据相当的数据,以12倍到一个百倍的样品。

他引用另一种潜在的优点,相对易于预测CE设备中蛋白质的行为,例如,他说的是通过CE系统的蛋白质形式的运动可以用作确认其识别的其他信息。

也就是说,“仍然有很长的路要走了将[技术]带到下一阶段,”Ivanov指出。vwin德赢ac米兰合作

在CE和质谱仪之间开发更稳定和用户友好的界面仍然是需要改进的区域。CE分离的再现性也是一个问题,甚至可能会改变结果。

“我们正在施加高电压以产生电流并在通道或毛细管上移动离子,并且使用的试剂的组合物变化,”Ivanov表示。“如果运行太长,或者如果您对多轮和多个注射使用相同的缓冲区,并且我们在缓冲区中耗尽某些离子,那可以有助于某些可重复性问题。”

乔西斯说,虽然CE已经前进到了可能与Nanolc相当的可再现性水平,但是在CE中的变异有更多因素。例如,如果你的背景电解质pH为4.0或4.1可以轻微你的分离差异。所以你必须非常严格地准备样品。“

联盟的倡议旨在制定和颁布的标准和做法,以帮助研究人员最有效地使用CE。例如,一个问题是CE运行中的标准是否可以通过使研究人员正常化运行和实验室的CE数据来帮助重复性问题。

参与者还希望提高CE的个人资料将有助于推动吸收和技术的发展。vwin德赢ac米兰合作

“如果有人从未正确地教授CE或甚至意识到其能力或存在,他们就会不太可能自己决定冒险进入该领域,这对其在工业和学术界的知则有影响,”乔斯说。

为了启动联盟,在世界各地排队了12个实验室,将使用其内部CE-MS设置分析标准化的蛋白质混合物,以获得使用各种仪器和协议的各种混合来生成的数据的感觉。

“我们正试图展示使用这些不同实验室的不同专业知识的CE-MS技术,”孙说。“这将为我们提供坚实的倡议基础,然后我们将继续前进到更复杂的蛋白质样本。”

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