纽约-瑞典生命科学公司Olink蛋白质组学推出了其近距离延伸分析(PEA)蛋白质组学技术的新版本，该技术使用下一代测序技术读出结果。vwin德赢ac米兰合作
Olink首席执行官Jon Heimer表示，NGS方法将使公司在提高吞吐量和复用能力的同时降低检测成本。
Olink将在Illumina的NovaSeq平台上提供基于ngs的读出产品，并将其命名为Explore 1536。海默表示，该公司今年将以收费服务的方式提供这项服务，并计划在2021年开始提供外部安装。
PEA使用与DNA链相连的成对抗体，在抗体与目标抗体结合的情况下，使其接近。然后，它们被DNA聚合酶扩展，创造出一个新的序列，可以用作目标蛋白质的替代标记。
由于必须有两个抗体结合才能产生一个信号，因此该方法显著减少了背景，从而提高了检测的灵敏度和特异性。这使它能够在非常有限的样本量下工作，也允许比传统免疫分析可能的更高水平的多路复用。
到目前为止，该公司已经使用qPCR作为DNA序列的读数，作为被检测蛋白质的代理，但Heimer说，NGS的成本下降和NGS能够实现更快速和更高的多路复用分析的能力结合在一起，促使该公司开发新的读数。
使用NGS来读取像Olink的使用DNA条形码的蛋白质组学分析已经是一个近十年的兴趣领域。例如，早在2011年，Olink的创始人、乌普萨拉大学教授Ulf Landegren，是探索使用NGS读取Olink的接近连接试验，该方法与PEA类似，当抗体与目标蛋白质结合时产生DNA分子。
当时，兰德格伦提出，NGS的单分子计数质量可以提供比PCR更精确的读数，但海默本周表示，鉴于Olink正在努力优化其基于PCR的读数，这不再是一个显著的优势。
他说:“我们已经优化了我们的DNA寡核苷酸框架，以适应NGS，也许我们可以(稍作调整)，但我认为(在精度上)将是有限的改进，因为我们过去的质量很高，所以很难在这方面做出改进。”“我认为最重要的事情是吞吐量、平台的可访问性，也许最重要的是成本。”
至于最后一个因素，Heimer指出，公司预计PCR的成本不会像NGS那样迅速下降，而且还会继续下降。
海默说:“如果是在五年前，这是不划算的。”他补充说，NGS继续看到可观的技术进步，Olink将能够利用这些进展。
他说，NGS技术的使用将使Olink进一步扩大其蛋白质组vwin德赢ac米兰合作面板的宽度。该公司目前提供大约1500种蛋白质的检测。该公司计划明年将这一数字增加到3000人，2022年增加到4500人。
海默说，奥林克认为NGS可以帮助解决测量蛋白质数量的复杂性。
“你有敏感性、特异性、动态范围……然后是吞吐量、精度和再现性等问题，”他说。“如果你想象一个实验，比如你想测量英国生物银行，50万名患者每人有4000种蛋白质，这离现实还很远。”
他说，奥林克在18个月前就开始对这个想法进行概念验证。他补充说，该公司已经收集了5个他所说的“展示”，展示了该技术在不同研究领域的使用，其中一个是SARS-CoV-2。
Olink与Fluidigm签订了一项联合营销协议，通过该协议，Olink可以在Fluidigm的BioMark HD rtPCR系统上提供蛋白质检测，该系统允许用户在96个样本中测量多达92种蛋白质。海默表示，他预计这一产品仍会有需求。
“我们在市场上看到许多不同类型的客户，”他说。“有些人希望在每次实验中观察数千种蛋白质，而NGS平台可以实现这一点，但还有很多其他部分更喜欢观察更有针对性的问题，所以蛋白质和样本更少，qPCR仍然是首选的平台。”