随着更广泛的生命科学工具领域的发展，蛋白质组学公司在2022年经历了一些紧缩，因为前两年的繁荣时期被裁员、战略调整和延期所取代。
但是，尽管蛋白质组学企业面临挑战，但随着该领域进入单细胞、单分子和空间分析等新兴领域，蛋白质组学研究继续向前发展。
单分子蛋白质分析公司Quantum-Si象征着2022年蛋白质组学的商业财富与研究和技术方面取得的进展之间的分裂。vwin德赢ac米兰合作今年年初，该公司时任首席执行官约翰·斯塔克辞职，创始人乔纳森·罗斯伯格接任临时首席执行官。与此同时，该公司的股价在2021年2月达到20.49美元的峰值，从2021年底的7.87美元跌至目前的水平，上周的交易价格低于2美元。
与此同时，该公司本周推出了其铂蛋白测序平台，这是一种台式设备，通过基于半导体的传感设备读出氨基酸特异性探针，在单分子水平上分析蛋白质。这款仪器售价7万美元，将于2023年第一季度开始发货，目前还不能完全使用新创蛋白质测序，但它的推出是值得注意的，因为它标志着用于单分子蛋白质测序的仪器的第一个商业发布——近年来，这一领域得到了业界和学术界的大量关注和投资。
事实上，今年秋天，荷兰代尔夫特理工大学(Delft University of Technology)主办了一场vwin德赢ac米兰合作关于单分子蛋白质测序的会议，让我们得以一睹这一领域的快速发展。来自Quantum-Si、Nautilus生物技术、Erisyon和Oxford Nanopore等商业公司的数十名研究人员介绍了该领域的发展。vwin德赢ac米兰合作
这是该会议的第三届，代尔夫特大学教授、组织者之一Cees Dekker指出，会议的参与者从2017年第一届的60人增加到今年的160人。
在这段时间里，该领域已经从主要关注基础科学和技术发展转向接近实际应用，最近量子硅的发射就证明了这一点。vwin德赢ac米兰合作
Dekker说:“很明显，我们有巨大的应用潜力。”他补充说，他相信单分子方法在分析非常低丰度的蛋白质以及质谱法传统上难以解决的蛋白质翻译后修饰的测量和定位等方面特别有用。
事实上，大多数单分子制药公司主要专注于这些类型的有针对性的分析因为蛋白质组规模的实验可能仍然超出了他们的能力，至少在短期内是这样。
Quantum-Si和总部位于西雅图的鹦鹉螺生物技术等单分子公司利用2021年蛋白质组学投资热潮上市。vwin德赢ac米兰合作两家公司通过与特殊目的收购公司(SPACs)的业务合并交易在纳斯达克上市，Quantum-Si筹集了约4.25亿美元的总收益，Nautilus筹集了3.45亿美元。
不过，持续的经济低迷也让一些人不得不勒紧裤腰带过日子。
“当你想到总体宏观经济气候变化时，我们看到了它的到来。鹦鹉螺号的联合创始人兼首席科学家帕拉格·马利克说:“我们知道会有变化，但我们不确定什么时候会有变化，也不确定变化的程度。”“正如我们今天所看到的，它在2023年可能不会减弱，因此作为一家发展阶段的公司，我们正试图在加速平台开发之间找到一个最佳点……同时也非常高效和谨慎地处理我们的现金跑道。”
今年的鹦鹉螺号推迟其单分子平台将于2023年至2024年发布，部分原因是难以开发和采购该系统所需的亲和试剂。
与马利克对宏观经济前景的评论一致，首席执行官Sujal Patel在公司的第三季度业绩电话会议该公司计划在计划平台发布的过程中积极控制费用。
其他蛋白质组学工具公司也根据新的商业环境调整了战略。8月，单分子免疫分析公司Quanterix宣布了一项重组工作该公司裁员约130名员工，占其员工总数的25%，因为该公司重新聚焦其商业努力，这是旨在提高测定物质量和大规模生产能力的计划的一部分。单细胞蛋白质组学公司IsoPlexis也进行了重组该公司将裁员20%左右。该公司收购这周由伯克利灯光在一个全股票交易价值5780万美元。
Fluidigm与此同时，该公司获得了一个新的名称——标准生物工具——一个新的管理团队，以及来自Casdin Capital和Viking Global Investors的2.5亿美元投资。新任首席执行官迈克尔·埃霍姆曾是丹纳赫生命科学公司的首席技术官，vwin德赢ac米兰合作旨在改造该公司的管理流程和重组其战略围绕其大规模细胞术技术，以使挣扎的公司盈利的目标。vwin德赢ac米兰合作
即使在更具挑战性的环境中，一些新的蛋白质组学公司出现在现场，一些现有的公司将新的平台推向市场。最热门的领域之一是空间蛋白质组学，该领域有几个新进入者，以及传统蛋白质组学参与者的新投资。
瑞士免疫组织化学公司Lunaphore随着Comet平台的推出，该公司进入了高倍蛋白质成像领域。另一家瑞士公司，Navignostics该项目于今年启动，计划利用单细胞空间蛋白质组学数据支持肿瘤药物开发工作，并指导癌症治疗。
同样在今年位于马萨诸塞州马尔堡的Akoya生物科学公司展示了其PhenoCycler-Fusion系统的数据，在该系统中，研究人员使用该平台在整个载片样本上以单细胞分辨率分析了100个蛋白质面板，这比该系统之前的多路复用限制增加了约40个蛋白质。与此同时，标准生物工具公司发布了其最新版本的成像CyTOF系统Hyperion+，该公司表示，该系统的检测下限是之前系统的1.6倍，同时能够每周处理100多个样本——是之前Hyperion系统的两倍。
传统的质谱仪供应商也在空间蛋白质组学技术方面进行了投资，Bruker展示了与AmberGen合作开发的新型蛋白质成像平台，该平台使用MALDI质谱法vwin德赢ac米兰合作测量组织样本中的肽联抗体。此外，该公司的子公司Canopy最近推出了下一代芯片细胞术技术，这是一种基于荧光显微镜的空间蛋白质组学系统，使用轮抗体染色来测量组织样本中的数十种蛋白质。vwin德赢ac米兰合作
在美国质谱学会年会今年6月，赛默飞舍(Thermo Fisher)宣布与德国贾斯图斯·李比希大学(Justus Liebig University Giessen)的TransMIT质谱发展中心达成协议，将推广一个结合了Orbitrap仪器、TransMIT扫描微探针基质辅助激光解吸/电离(SMALDI)和3d表面技术的质谱成像平台。vwin德赢ac米兰合作该系统将允许研究人员对各种分析物进行空间分析，包括代谢物、多肽和酶消化蛋白质。
在研究方面，哥本哈根大学和马克斯·普朗克生物化学研究所的科学家们发表一个方法结合激光显微解剖和质谱分析，在保留空间信息的同时表征少量细胞中的数千种蛋白质。
西北大学研究人员Neil Kelleher将纳米解吸电喷雾电离(nano-DESI)与今年在Thermo Fisher的Q Exactive UHMR仪器上发布的新型直接质量技术相结合，以优于80 μ m的空间分辨率对高达70 kDa的完整蛋白质形态进行成像。vwin德赢ac米兰合作在对肾脏组织的自上而下的空间蛋白质组学分析中，研究人员使用该技术鉴定出169种蛋白质形态。
作为自上而下蛋白质组学的先驱，凯莱赫长期以来一直认为更好的蛋白质形态水平信息的重要性。他说，他看到了一些趋势，比如对单分子技术的大量投资，以及对蛋白质形态特征的关注，这些趋势有助于该领域朝着这个方向发展。
2021年，凯莱赫和同事启动了他们所谓的“人类蛋白质形态项目”，这项工作的最终目标是在每个细胞100万个蛋白质形态的深度上表征5000种细胞类型的蛋白质形态，总共测量大约50亿种蛋白质形态，其中估计有5000万个是唯一的。今年，该项目的研究人员发表了第一篇论文，一项研究发表在科学详细描述了人类造血细胞中存在的蛋白质形态。
2022年蛋白质组学实验的吞吐量也在持续提高。西达斯-西奈医学中心医学和生物医学教授Jennifer Van Eyk表示，虽然提高产量一直是该领域的关注焦点，但有两个因素——单细胞蛋白质组学的日益普及和对血浆生物标志物工作的重新兴趣——使得这个问题可能比以往任何时候都更加突出。
“我们在越来越多的实验室看到越来越多的自动化和高通量的发现水平，”她说。“人们正在自动化样品准备。工业界为我们提供了更好的自动化系统。你可以看到实验室使用更短的(分离)梯度，但它们同样可靠。我认为最大的变化是进入更高的通量、更大的(样本)数量和更可重复的(实验)。”
在单细胞方面，进步包括集成将广泛使用的DIA-NN分析软件应用到单细胞工作流程中，以及Bruker将其timsTOF SCP仪器与Scienion的CellenOne F1.4仪器相耦合，用于分配单细胞，并将其proteoChip平台用于自动化单细胞蛋白质组学样品制备，为单细胞蛋白质组学提供了一个可商用的端到端系统。
在血浆生物标志物方面，今年值得注意的发展之一是精确科学公司的1500万美元购买德国血浆蛋白质组学公司OmicEra Diagnostics的首席执行官。Exact CSO Jorge Garces表示，总部位于威斯康星州麦迪逊的公司计划使用OmicEra基于质谱的蛋白质组学技术来发现癌症生物标志物，并指出，基于质谱的血浆蛋白质组学的最新进展“让我们更放心地使用这项技术来发现生物标志物”，这表明蛋白质组学在快速增长的多种癌症早期检测领域的潜力。vwin德赢ac米兰合作
蛋白质基因组学是该领域的另一个主要重点领域，因为国家癌症研究所推出第四版它的临床蛋白质组肿瘤分析协会(CPTAC)，该项目旨在使用蛋白质基因组分析来研究包括黑色素瘤、多发性骨髓瘤、急性髓系白血病和非小细胞肺癌在内的癌症的药物反应和耐药性等问题。该倡议在2022年提供了1130万美元的资金，预计资金将在五年内保持在类似的水平。
另一个主要的蛋白质基因组学研究项目，英国生物银行制药蛋白质组学项目(UKB-PPP)，在今年发布的研究结果中，研究人员使用Olink的Explore 1536平台，测量了54306人血浆中每人1463种独特的蛋白质，并将这些蛋白质水平的数据与来自同一受试者的基因组信息整合在一起。
这项研究生成了迄今为止最广泛的数据集之一，将蛋白质表达与其遗传影响联系起来，并为药物开发和生命科学的研究人员提供了丰富的信息。
Olink及其在高复杂等离子蛋白质组学领域的竞争对手SomaLogic都发现，他们的系统越来越多地被用于这类蛋白质基因组学研究。Olink计划在年底前将其检测菜单从大约3000个蛋白质靶点扩大到4500个蛋白质靶点，而SomaLogic的SomaScan平台可以测量大约7000个蛋白质。
蛋白质组学公司Seer今年也进入了蛋白质基因组学市场发射该公司表示，一个新的软件套件将简化基因组和蛋白质组学数据的整合。