纽约 - 与人类蛋白质常规项目相关的研究人员已经产生了人造血细胞中存在的蛋白质ort的初始参考图。
被称为血液蛋白质阿特拉斯，该资源上个月呈现给一篇论文出版于科学该项目的参与者预期的首选将是一系列努力在各种人类细胞类型上目录植物。最终，该项目旨在以每种细胞100万蛋白质形式的深度为5000个细胞类型的蛋白质ort，使得总测量约为50亿种蛋白质综合体，估计有5000万的人独特。
在里面科学研究，研究人员共鉴定了21种不同人造血细胞类型和血浆的总共56,813种蛋白质血浆，其中29,620个是非冗余的。在单个细胞类型中鉴定的数量范围为帕纳T细胞中的9,991至303inaïveb细胞。
大多数情况下，如果不是全部，蛋白质以各种形式存在，由于剪切变体或由于截断而导致的不同长度或不同的翻译后修改的不同组合，以略微不同的氨基酸序列具有略微不同的氨基酸序列。这些不同的形式称为蛋白质ortm，并且细胞内不同的蛋白质常规的存在和比例是各种生物过程的关键，影响蛋白质定位或蛋白质 - 蛋白质相互作用或细胞信号传导等物质。为了充分了解蛋白质在生物学和疾病的不同方面发挥作用，可能需要了解不仅仅是在不同条件下表达的蛋白质，而且还存在哪种特定的蛋白质。
这是驾驶Proteoform Projetct的理由，它的创始人正式提议去年秋天。然而，自信地测量蛋白质组规模的蛋白质ort是一种艰巨的挑战。蛋白质组学恰好，经过二十多年的研究和技术开发，达到实验能够检测到大多数蛋白质编码基因的蛋白质。虽然对某些特异性种类的蛋白质常规 - 磷酸化蛋白进行了广泛的研究，但是 - 蛋白质ort的研究通常落后。
最近的结果科学研究表明，目前差距在现有的技术能力之间以及创建人类蛋白质模型地图的必要条件，普遍存在的普遍研究人员的研究人员设想。
例如，自上而下的质谱 - 最常用于蛋白质组织型蛋白质形式研究的技术 - 在测量较大的蛋白质时挣vwin德赢ac米兰合作扎。在里面科学研究，93％的鉴定的蛋白质常规分子量小于20kDa。该分子量截止，留出了大部分人类蛋白质组，包括研究作者注意到，较大的蛋白质键对各种细胞过程，可以具有比平均水平更多的蛋白质常规。从他们的发现外推出，研究人员计算出原发性造血细胞可能在30kDA和以下范围内为另外的50,000个蛋白质塑造特征，并且人细胞类型中的平均蛋白质常规数量约为110万。
简而言之，该研究只捕获了人体中存在的蛋白质常规的一小部分，表明，随着作者所指出的，“清楚地需要改进技术”，用于蛋白质文件研究。
“我们需要100倍的技术，无论采取的形式都需要100倍，”Neivwin德赢ac米兰合作l Kelleher是西北大学和高级作家的生命过程化学研究所主任Neil Kelleher说科学纸张以及蛋白质形式项目的领导者之一。“我们需要在给定的细胞类型中从10,000个蛋白质血换到一百万，并且在相同的时间和1/100的成本中。”
目前，他说，大众光谱仍然是蛋白质综合绘图的明显技术，但他表示，他预计该领域将看到新兴方法中断，包括最近推出了野生动物生物技术vwin德赢ac米兰合作或Quantum-Si等蛋白质组学工具公司这突出显示其平台的能力来研究蛋白质常规水平的蛋白质。
Kelleher和他的合作者将蛋白质形式项目的价格达到约13亿美元，超过10年 - 一个大量投资，但他争辩的是，他争论的是一系列新技术和企业，就像人类基因组项目所做的那样。
“每个人都会从一个定义的蛋白质组庆祝，而这些[最近推出的蛋白质组学公司]的所有投资回报都会上升，”他说。“因为他们将遇到蛋白质Oform生物学。它是基本的，基础。无论您是鹦鹉螺，Seer，Quantum-Si还是其他人，直到我们定义蛋白质组的分子景观，我们将继续保持一致滑坡上坡爬坡。“
虽然这些较新的公司中的一些项目，其平台将能够进行Novo蛋白质测序，目前目前依赖于某种程度上依赖于蛋白质或肽指纹匹配的信号从不完整的分子的氨基酸产生到预期信号库，如传统的大规模规模的蛋白质组学所做的那样。这表明通过提供定义的搜索空间，全面的蛋白质形式库可以提供价值。
Kelleher和他的同事们瞄准了他们的科学纸张给出了更彻底的蛋白质曲线的价值味道可以带来的。
在他们的观察结果中，平均地，在2.19种细胞类型中，与蛋白质的6.51型细胞类型相比，特定的蛋白质常规发现，表明蛋白质型在细胞之间提供更精细的渐变区别。在类似的静脉中，每个细胞鉴定的它们鉴定的非还原蛋白常规的平均数量为1,346个，其每种细胞识别的76个非冗余蛋白质几乎20倍。
他们还提供了一种基于蛋白质形式的方法的潜在临床效用的示范，鉴定了一组血基的蛋白质常规，可以帮助识别肝移植患者，识别显示出抑制的早期迹象。
这些蛋白质识别这些患者的能力持续“从试点队列，然后发现，[到]验证，”Kelleher表示，并补充说，他们现在在从正在取样的多个网站中测试一组40名肝移植患者的标记纵向跨越五个时间点。
他说：“蛋白质形式应该更忠实地报告潜在的生物学，并提高您试图实施的临床措施的相关性，”他说。“因为它们更具体。它们携带比单一肽更多的信息。”