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在AACR上发行的空间蛋白质组学在多重吞吐量中增加

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纽约 - 上周在美国癌症研究年会上,空间蛋白质组学在美国癌症研究年会上引起了人们的关注,因为许多公司在会议上启动或强调了新平台。

新系统提供了更高水平的多路复用和吞吐量,并指向临床研究中的空间蛋白质组学使用增加,并最终是临床试验。

最引人注目的版本是由Bruker和Ambergen开发的新的MALDI质谱成像平台,该平台扩大了Bruker的持续推进空间生物学。马萨诸塞州Billerica,总部位于马萨诸塞州的布鲁克做了一个战略投资作为两家公司一起工作的一部分,未公开的金额。

Bruker子公司Canopy最近推出了其芯片仪技术的下一代版本,这是一种基于荧光显微镜的空间蛋白质组学系统,该系统使用圆形的抗体染色来测量组织样品中的数十个蛋白质。vwin德赢ac米兰合作相比之下,该方法是由马萨诸塞州沃特敦(Watertown)开发的,该公司在AACR上详细介绍的该公司使用MALDI质谱法来测量组织样品中肽链接抗体的方式,其方式与类似于质量规格的方法类似于像质量规格的方法。标准生物工具和离子路。

该方法将Ambergen的Miralys试剂(与光晶质量标签相关的抗体)与Bruker的Maldi Mass Spec平台,特别是其Rapiflex和Timstof Systems。研究人员用Miralys抗体染色了感兴趣的组织样本,然后将组织暴露于紫外线以裂解质量标签,可以通过Maldi Mass Spec检测到。

与来自Akoya Biosciences,Standard Biotools和Ionpath在内的公司的空间蛋白质组学平台不同,Bruker-Ambergen方法不提供亚细胞分辨率,但它确实可以使高水平的多路复用和高吞吐量。根据Ambergen的联合创始人兼董事长Kenneth Rothschild的说法,研究人员可以使用该系统将100多种蛋白质多重分析,并可以扫描CM2在大致相同的时间量与标准生物工具和离子同步提供的基于质量细胞术的技术相同的时间与扫描MM2样品,尽管处于较低的空间分辨率。

他建议Bruker-Ambergen技术可以证明对这些基于质量细胞仪的技术具vwin德赢ac米兰合作有更高的补充。

他说:“它们是许多研究人员使用的精彩技术,它们完全与我们提供的产品相互互补。”“因为在这一点上,我们无法提供亚细胞(解决方案),但是对于他们来说,能够获得[完整]幻灯片的概述非常困难。”

作为Maldi Mass Spec仪器的领先提供者,Bruker是Maldi Imaging的主要参与者,但其中大部分工作都集中在代谢物和Glycans等小分子上。范德比尔特大学(Vanderbilt University)的理查德·卡普里奥利(Richard Caprioli)等一些学术研究人员已经开发了MALDI蛋白成像的方法,但它仍然是一种技术要求和专业的方法。

Ambergen合作和Miralys试剂使Bruker能够将现有的MALDI质量规格安装为安装基础,这是其进入空间生物学的一部分。

布鲁克(Bruker)生活科学质谱分部的成像总监迈克尔·伊斯特林(Michael Easterling)表示:“进入蛋白质成像是马尔迪成像社区很长一段时间以来一直想做的事情。”能够快速分析大型组织样品的能力和能力将使其在空间蛋白质组学空间中脱颖而出。

他说:“ [空间生物学]的总可寻址市场很大,饱和总量很低。”“因此,在这个领域,还有很多空间可供其他玩家。”

Easterling表示,布鲁克还希望能够测量同一样品中的蛋白质和小分子的能力,这对客户有吸引力。

他说:“在一个单一的组织部分中,您会得到蛋白质,然后得到代谢物,聚糖,小分子异种生物,脂质。”“您不必使用两台机器,也没有与串行区域的模糊关系,这一切都来自同一组织部分。”

他说,该公司预计制药行业的需求强劲。

“多年来,药房一直在解决可毒蛋白酶的问题,但是问题是,如果您正在吸毒蛋白质组,那么您如何知道自己实际上正在吸毒蛋白质组?”他说。“现在,您可以看到[蛋白质]靶标,并且可以同时看到它们的代谢输出,并且可以更好地了解药物与靶标之间的生理互动。”

伊斯特林说,他预计免疫肿瘤学研究(空间蛋白质组学已经看到了大量摄取)将成为另一个主要的兴趣来源。

同样在总部位于马萨诸塞州马萨诸塞州马尔伯勒的AACR中,来自其苯循环系统的数据也提供了数据,其中研究人员使用该平台在整个斜线样品中以单细胞分辨率分析了100个蛋白质面板。

以前,来自Akoya和其他空间蛋白质组学公司的分析通常已在40蛋白范围内占据。不过,Bruker-Ambergen系统的Phancycler融合数据以及预计的多路复用能力表明,该领域正处于向更高丛的转变中。

Akoya首席执行官Brian McKelligon说:“我认为情况将越来越趋向更高的PLEX水平。”他说,凭借更大的丛,研究人员可以“真正覆盖与癌症相关的广泛标记,而且要与免疫反应有关。因此,我们的一部分策略是制定这些大型,完整的面板,以便人们可以有效地拥有一站式商店,用于大型,无所不包的研究。”

McKelligon指出,就Akoya的技术而言,与以前的平台相比,该表类融合的速度以及数vwin德赢ac米兰合作据压缩工具的开发使这种实验更加实用。

他补充说,尽管从理论上讲,在该公司技术的早期版本上可以实验100个实验,但“在运行时和数据文件大小方面有一些自治的[限制]。”vwin德赢ac米兰合作

McKelligon说,他希望该领域将悬停在100个Plex阈值附近,因为研究人员探索他们可以从该级别的多重级别中学到什么。

他说:“我认为这可能是一个暂停并查看客户需求的实际场所。”“整个幻灯片中的100封面,在一两周内包含30或40个样品中包含200万至400万个单元的数据集是一个非常丰富的数据集。因此,我认为我们需要继续投资简化该工作流程,使面板准备就绪走进并改善信息学,然后我们将决定超过100次超过100。”

Andrew Quong,CSO在标准生物工具(以前是流体化)的CSO同样说,他的公司正在看到对多重多样化的需求。

他说,尽管两年前研究人员仍在习惯于30至40种蛋白质的空间蛋白质组学实验的想法,但如今,该公司的客户通常会碰到该系列的顶部。

Quong说:“当我们为客户设计面板时,我们会不断询问我们可以包括我们可以包括的标记数量的界限。”“因此,既然我们在这个高复杂性的空间生物学领域看到了更多的牵引力,那么将需要和渴望对其他标记。”

例如,他说:“如果您正在查看肿瘤中的三种不同类型的细胞,并且您对基质,成纤维细胞,癌症和几种类型的功能水平上的相互作用感兴趣在免疫细胞中,您可以很容易地看到需要比传统的20或30人所需要的标记要多得多。”

在总部位于加利福尼亚州南旧金山的AACR上,该公司启动了最新版本的Imaging Cytof系统Hyperion+,该公司表示,该系统提供了比以前的系统的1.6倍下限,并能够处理100-加上样品每周 - 将上一个Hyperion系统的吞吐量增加两倍。

除多重分析外,分析的速度是空间蛋白质组学公司的关键指标,尤其是当它们将其工具定位为临床研究和临床试验工作时。

Quong说:“当然,如果我们进入的临床研究空间,这些研究需要更大的队列,因此能够使采集速度增加一倍,使我们能够开放更广泛的临床研究空间。”

Akoya也有努力提升其平台的吞吐量。该型融合型设计旨在以几种不同的模式运行,以优化多路复用或吞吐量。目前,每周约10个样品的速度约为10个蛋白质,或每周大约100个样品中的每样样品最多可同时测量50种蛋白质。该公司的目标是在今年年底之前实现能够每周30个样本的每样本蛋白质100蛋白的工作流程。它还出售其表象HT,每周大约300个样品中的每个样品最多可测量6种蛋白质。

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