研究人员亚利桑那州立大学的生物设计研究所正在与辉瑞公司合作开展一个为期四年、耗资500万美元的国家卫生研究院资助的项目，以识别和验证与糖尿病患者心血管疾病相关的蛋白质生物标志物。
该项目将由该研究所分子生物特征分析部门主任兰德尔·纳尔逊(Randall Nelson)领导，并以他去年因心脏病和糖尿病标记物研究而获得的310万美元NIH奖为基础（点5/7/2010）．
尼尔森表示，这两项计划之间“是一个自然的过渡”ProteoMonitor这个星期。他说，最初的拨款主要用于心血管生物标志物的开发和验证，当前项目的目标是将其转移到药物开发等应用领域。
具体来说，Nelson的团队正在与辉瑞公司合作，将生物标志物整合到该公司的糖尿病研究项目中。2007年克利夫兰诊所心脏病学家史蒂夫·尼森发表了一项研究在新英格兰医学杂志将葛兰素史克公司的糖尿病药物文迪雅与心血管疾病风险增加联系起来。这种联系导致美国食品和药物管理局要求制药公司监测其糖尿病疗法对心血管的影响，这增加了糖尿病药物开发中对CVD生物标志物的需求。
“FDA决定，所有新的糖尿病药物批准都需要进行长期研究，以监测不良的心血管影响，”辉瑞公司个性化药物定向蛋白质组学主管吉姆·皮尔森(Jim Pearson)说ProteoMonitor．“所以本质上他们是在告诉制药公司，‘你不能只给我们看12周的数据。你必须向我们展示两到三年的数据，而且你必须把一些病人纳入这些研究。’”
然而，“问题是，没有一个特定的小组来衡量不良心血管风险，”他说。“那么如何进行这些长期的心血管研究呢?”当真的没有公认的面板时，你怎么知道要寻找什么?(长期试验)将是非常昂贵的，在我们开始这些试验之前，我们希望有一个很好的想法，在试验中加入什么。”
纳尔逊指出，传统的糖尿病药物疗效指标——降低血糖——“并不能真正告诉你心血管疾病的结果。”有鉴于此，“你必须建立一组标记，告诉你你正在获得降糖药物的效果，同时不会增加心血管疾病。”
Nelson正在使用他实验室开发的质谱免疫分析(MSIA)平台研究CVD生物标志物。MSIA依靠一种专利的移液管免疫富集技术，该技术使用高通量、高结合能力的微柱，由抗体激活，分离复杂样品vwin德赢ac米兰合作中的低丰度蛋白质。然后，通过选择反应监测质谱分析分离的蛋白质，从而能够定量预测和诊断有用的蛋白质变体。
亚利桑那州立大学和辉瑞的合作源于几年前纳尔逊和皮尔逊在美国质谱学会年会上的一次会议。
皮尔逊说:“(纳尔逊)告诉我(MSIA技术)的所有应用，我告诉他，如果你想进入制药行业，你必须选择一种应用。”vwin德赢ac米兰合作“我认为最好的应用是在糖尿病中，所以我们让(Nelson)在我们的糖尿病项目中(使用MSIA技术)进行了某种试验，令我印象深刻的是，多次试验只需最小的样本量;vwin德赢ac米兰合作它是高通量的;他测试了400个样本，我们得到了每个样本的数据，所以检测失败率为零。”
虽然ASU带来了MSIA技术的安排，但辉瑞能够提供生vwin德赢ac米兰合作物标志物验证所需的大型、特征良好的临床样本集，包括多年来跟踪患者的纵向样本集，Nelson说，研究人员将在大约1000名患者的样本中测试他们的小组。
皮尔逊说:“辉瑞公司有很多临床样本。“所有制药公司都有很多临床样本。但问题是如何让学术界和制药公司合作。”
他说，美国国立卫生研究院为两人牵线搭桥。
尼尔森说，生物设计研究所的CVD小组目前基于大约140种不同的蛋白质，这些蛋白质来自11种不同的基因产物。他指出，他的团队将在改进面板的过程中继续添加标记。
“由于翻译后修饰，这11个基因的产物变成了大约140种不同的分子物种，”他说。“所以当我们应用这11项分析时，我们得到了大约140条数据，这140条数据告诉你，你在心血管疾病和糖尿病合并的情况下处于什么位置。这是我们(加入新计划)的原始小组。一年后可能会有12或15个检测目标。”
如果他们成功地将该小组整合到药物开发中，研究人员希望将其用于“更广泛的人群筛查”。尼尔森说，尽管他补充说，这样的应用可能还需要十年的时间。
关于该小组在糖尿病药物开发中的使用，皮尔逊说，它可能会与弗雷明汉心脏研究等其他研究中的标记物联合使用。
他说:“为了真正得到一个好的ROC曲线下的生物标志物面板，我觉得它将从几个组学和不同的模式中获得[数据]。”“我们不想做的一件事是在竖井里工作，说所有的生物标志物都必须来自某个学科，无论是DNA、蛋白质组学还是代谢组学。”
据尼尔森说，亚利桑那州立大学目前拥有蛋白质标记和签名的专利。他说，如果辉瑞“想要实施(专家组)，我们肯定会与他们合作，”但他补充说，虽然制药公司目前是一个明显的合作伙伴，但他将在未来与其他公司合作。
尼尔森通过Intrinsic Bioprobes公司将MSIAvwin德赢ac米兰合作技术商业化，该公司于9月被赛默飞世尔科学公司收购（点9/2/2011）．赛默飞世尔并不是asu -辉瑞项目的合作者，但是Pearson说，从制药公司的角度来看，这次收购增加了这项技术的吸引力。vwin德赢ac米兰合作
“从制药的角度来看，我认为这是好事，因为赛默飞世尔将有更多的资源投入到他们的应用中，”他说。“如果我们进入三期临床试验，我们将有数千个样本，我宁愿把样本给赛默飞世尔，也不愿给一家小商店。”
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