科学家们隆德大学无法验证血浆蛋白生物标志物面板,该面板之前被确定与阿尔茨海默病有关,并被探索为该疾病的潜在商业诊断。
这项研究于上周发表在《公共科学图书馆•综合》隆德大学的研究人员、该论文的合著者奥斯卡·汉森(Oskar Hansson)说,这突出了阿尔茨海默病血浆蛋白生物标志物发现面临的持续挑战——具体来说,在有限的样本集中进行生物标志物发现的困难,以及调查与该疾病生物学没有明显联系的标志物的风险ProteoMonitor.
他说:“当你研究与你所研究的疾病的发病机制没有明显关系的生物标记物时——就像在这个例子中,这些[蛋白质]都没有真正被证明与大脑中发生的事情有关——那么你需要谨慎。”
在这项研究在2007年的一项研究中,研究人员评估了一组18种血浆蛋白,这些蛋白此前被确定为阿尔茨海默病的生物标志物自然医学研究.隆德研究小组无法重现最初的研究结果,并发现,根据其新的分析,18种蛋白质中没有一种能以较高的诊断精度识别阿尔茨海默氏症患者。
虽然最初的研究声称,18种标志物可以将阿尔茨海默氏症患者分类,准确率接近90%,并识别出将从轻度认知障碍发展为阿尔茨海默氏症的患者《公共科学图书馆•综合》研究发现,标记物识别阿尔茨海默氏症患者的曲线下面积仅为63%。
斯坦福大学研究员Tony Wyss-Coray是原文的作者之一自然医学论文中,汉森表示同意ProteoMonitor“测量血浆蛋白是一个巨大的挑战,我认为大多数在该领域有经验的人都认识到这一点。”
他称隆德的努力是“一项非常好的研究”,“没有什么可批评的”,他说,回顾2007年的工作,他和他的合作者对他们发现的标记“可能有点naïve,太热情了”。
“我认为(老年痴呆症患者的血浆蛋白质组)存在差异,实际上我们继续看到差异,但我认为还有很多问题,”他指出。
Wyss-Coray说,他的实验室已经从盲目的生物标志物发现工作转移到识别与阿尔茨海默病相关的信号通路上,目的是更好地理解这种疾病的机制。
“我不认为你必须完全抛弃蛋白质组学的发现,”他说,“但你必须在之后进行生物学研究。”
Wyss-Coray将目前阿尔茨海默病血浆蛋白生物标志物的发现状态与基因组学的早期进行了比较,当时研究人员正在进行一系列稳定的研究,大肆宣传潜在重要的snp的发现。
他说:“基本上你会看到一篇接一篇的论文发现一个SNP与一种疾病有关,其中大多数都没有在独立的数据集中得到复制。”他说,样本量小是这些研究的一个基本问题,同样,也是今天基于蛋白质组学的发现研究的一个关键问题。
他说:“大多数研究涉及的样本量都不现实,无法得出可重复的结果。”他指出,最初的研究调查了大约100名患者和对照组。的《公共科学图书馆•综合》与此同时,这项研究检查了174名对照组、142名阿尔茨海默病患者和88名其他痴呆症患者。
Wyss-Coray说,他认为要使无定向血浆生物标志物的发现有效,研究人员需要研究的不是数百个样本,而是数万个样本。
他说:“仅仅在病例和对照中测量蛋白质,然后认为你有了疾病的生物标志物,除非你有测量10,000个样本的奢侈,否则是行不通的。”
基于研究结果自然医学在论文中,Wyss-Coray创立了生物技术公司Satoris,旨在将这些标记商业化。去年5月,该公司被Rules-Based Medicine(现在的Myriad RBM)收购(点5/17/2011).这些蛋白质已经进入了Myriad RBM旗下的研究小组,但还没有进入fda批准的诊断,Wyss-Coray说,他认为这些标记的研究工作“处于搁置状态”。
阿尔茨海默病一直是蛋白质生物标志物研究的重点领域。去年6月,蛋白质组学公司Proteome Sciences委托的一份报告预测,阿尔茨海默病的蛋白质生物标志物在未来十年将代表一个累计90亿美元的市场(点6/3/2011).除了在诊断和预测疾病进展方面有希望外,早期检测和进展生物标记物还有望在药物研究中发挥越来越大的作用,帮助选择患者进行临床试验和监测对治疗的反应。
虽然阿尔茨海默氏症生物标志物的大部分工作都在脑脊液中寻找标记物,但血浆标记物是可取的,因为它们可以在不需要进行腰椎穿刺的情况下进行测试,这使得它们在定期监测等目的中更有用。
百时美施贵宝(Bristol-Myers Squibb)临床神经科学生物标志物主管Holly Soares同意Wyss-Coray的观点,即如果对阿尔茨海默病血浆蛋白标志物的研究要有效,就需要更大的样本量。然而,她对把这些研究放在一起的可能性比较乐观。Soares是阿尔茨海默病神经成像倡议生物标志物联盟项目团队的主席,他说,最近在10,000个样本的规模上进行生物标志物发现研究已经变得可行。
她说:“我认为许多大型阿尔茨海默病研究中心都会定期收集血浆,所以我认为我们能够将其中一些队列结合起来,以一种有意义的方式解决这些问题是非常合理的。ProteoMonitor这表明,这种努力可能会在今年夏天的阿尔茨海默氏症协会国际会议上出现。
“在那里,我们将讨论所有关于基于血液的生物标志物的报告,许多拥有大量队列的主要参与者将在那里,这可能是我们考虑合并数据集的地方。”
Soares指出,尽管像Lund小组提出的结果一样令人沮丧,但研究人员已经看到“在一些大型队列中[阿尔茨海默氏症血浆标记物]有一些有希望的可重复性。”
她说,ADNI、澳大利亚衰老成像、生物标志物和生活方式旗舰研究以及德克萨斯州阿尔茨海默氏症研究联盟最近都对来自Myriad-RBM的发现小组的样本进行了筛选。“因此,总共有大约2500个样本被研究过,并且有一定的可重复性。”
苏亚雷斯说:“我们在非常大的队列中看到了相当一致的变化,而且似乎确实与基因型有关,这是有希望的。”“所以我认为我们最终可能会看到一些可用的东西,至少作为一种筛查工具,让我们进入下一步。”
她说ADNI的血浆生物标志物工作目前处于“中间阶段”,目前使用的研究平台仍然“有一些批与批之间的可变性”。
她说:“我们想做的是有一个更可靠的检测方法,没有这种可变性,然后对样本进行更多的测试,以确保我们的发现可以被使用。”
Soares还表示,该小组可能会考虑添加到ADNI的血浆生物标志物数据中,在其早期工作的基础上,使用RBM的小组测量基线和一年后采集的受试者血液样本中的189种蛋白质(点12/10/2010).
她指出,目前“有一项提议”,将这项工作中一些更有前途的标记合并到一个更小的小组中,重新分析它们,“如果数据看起来不错”,就回到ADNI寻求更多的资金来继续监测这些受试者。
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