这篇报道最初发表于7月15日。
蛋白质组学标准倡议人类蛋白质组学组织(Human Proteomics Organization)上周发布了一系列新的模块《关于蛋白质组学的最低信息实验指南》(Minimum Information About a Proteomics Experiment guidelines)，其中包括实验涉及的标准蛋白质亲和试剂，柱层析法，毛细管电泳,凝胶图像信息学．
出版于当前版自然生物技术vwin德赢ac米兰合作，这些模块提供了蛋白质组学研究人员应该报告关于他们的实验的哪些数据的指南，以及在蛋白质亲和试剂(MIAPAR)的情况下，亲和试剂制造商应该提供关于其产品的哪些信息的指南。
欧洲生物信息学研究所高级科学数据库馆长、MIAPAR模块的作者之一桑德拉·奥查德(Sandra Orchard)告诉记者，亲和试剂制造商提供的关于其产品的信息不足一直是蛋白质组学研究中的一个问题ProteoMonitor．
她说:“多年来，人们浪费了大量资金购买质量差的(亲和)试剂，并因此得出了误导性的数据。”她援引斯德哥尔摩皇家理工学院的马赛厄斯·乌伦(Mathias Uhlen)的研究表明，蛋白质组学研究人员使用的抗体中，只有一小部分具有用户假设的特异性。vwin德赢ac米兰合作
奥查德说:“人们是否只是懒得做适当的实验来证明他们抗体的特异性，还是他们非常清楚自己的抗体并不像自己说的那么好，但还是继续出售，这不是我能说的。”“我们能说的是，在很多很多情况下，无论是商业产品还是捐赠产品，都没有足够的数据来让人们充分评估这种资源的价值。
她说:“我们希望能够正面解决这个问题，并鼓励制造商清楚地表明试剂的优势是什么，以及局限性是什么。”
为此，MIAPAR指南规定，抗体生产商应包括特定蛋白质和表位的详细信息，一种试剂正在被提出;它是如何被提出的;它的特异性是什么——它有多敏感，它应该用于什么适应症。
奥Orchard说，MIAPAR指南与其他MIAPE模块有些不同，因为它们“处理的是一个产品主要是商业性的社区”。发布的其他三个模块更为典型，主要关注科学家应该将哪些信息作为实验数据的一部分，以及这些数据应该如何呈现，以使研究尽可能地可访问和可重复。
Orchard说，抗体制造商计划在多大程度上遵守MIAPAR还有待观察，并指出抗体供应商如英国剑桥的AbCam -该报告的作者之一自然生物技术vwin德赢ac米兰合作提交-参与了这个过程。
“这是一个巨大的领域。有很多人在卖抗体，我们不可能联系到所有人。其他供应商的反应将会很有趣。”
给几家供应商的电话没有及时回复。
实现阶段
PSI在2008年8月发布了第一套MIAPE模块，此时距离该项目最初构想已经过去了大约5年（点08/14/2008）．目前已经发表了关于质谱、质谱信息学、凝胶电泳、凝胶图像信息学、柱层析、毛细管电泳和样品制备和处理的指南。
“我想说，我们已经很好地覆盖了整个(蛋白质组学)领域。所以现在我们正处于实施阶段，让人们真正使用(这些标准)，并以那种格式提供数据。”
Orchard指出，例外的是定量质谱和生物活性实体领域，在这些领域MIAPE家族仍然存在空白。
她说，就生物活性实体而言，制药公司越来越愿意分享药物靶点相互作用的数据，这就产生了对数据应该包括哪些内容制定标准的需求。
“制药公司一直不愿公布数据，但我想说，这种情况正在改变。他们更加认真地对待他们所谓的赛前信息，实际上是自愿提供数据。”“他们意识到，如果他们要么为这些数据付费，要么通过公共领域获得这些数据，那么他们需要一定数量的信息才能成为有用的数据。如果这些信息丢失了，那么这是一种没有充分发挥其潜力的宝贵资源。”
目前，PSI和EBI正在研究一个涵盖这一领域的模块，称为MIABE，或关于生物活性实体的最低信息。
Orchard说，由于蛋白质组学研究中越来越多地使用这些技术，定量质谱方法的MIAPE指南的工作也在进行中。所涉及的各种技术和该领域的快速发展使得为定量MS数据设计标准化的开源格式变得困难。
量化领域发展迅速，我们需要多名专家来帮助我们开发这些格式。她说，并预测在2011年4月PSI会议前后，将会有一种定量的MS数据格式。
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利物浦大学兽医科学学院的研究员、最近发布的MIAPE模块的合作者Andy Jones告诉记者，数据格式的开发与建立报告指南是一个独立的、但互为补充的过程，有时被证明是方程中比较棘手的那一半ProteoMonitor．
“数据标准的开发是相当资源密集型的。要让许多团体同意在所有这些不同软件之间发送的实际数据格式是一件相当困难的事情。”
“在凝胶图像信息学方面，我们仍在研究表现这类数据的最佳方法。我们有凝胶电泳数据的数据格式，它将在接下来的几个月发布，但它并没有覆盖所有的图像信息学的细节，我们在报告指南中有。我们正在研究这种格式，并试图决定如何让供应商参与制定数据标准。”
Orchard说，对于已经建立的MIAPE模块，现在的挑战是鼓励它们的采用。实现这一目标的关键是让期刊参与进来。
“在质谱仪领域，只有大约六家期刊。我们正在与所有人进行积极对话，大多数人至少都建议进行取证。在其他领域要困难得多，因为信息分散在很多很多生化期刊上。”她说。
据Jones说，他们正在考虑建立某种在线界面，以方便向期刊报告MIAPE信息。
“我们正在与几家顶级蛋白质组学期刊讨论建立某种在线系统，让人们可以完成一些复选框，说‘我已经告诉过你这个、这个和这个，在这里你可以找到这些信息。因此，这将使这一进程正规化。”
奥查德说:“大型实验室、高通量实验室都很擅长提交(MIAPE数据)。”“最难的部分是说服正在做一个共同ip作为一系列不同实验的一部分的实验室生物化学家为我们提供数据。说服科学家们采用(MIAPE标准)符合他们的利益并不总是微不足道的，但他们总是看到它的普遍好处。他们中的一些人反对为他们特定的数据集做额外的工作，但他们一致认为其他人都应该这样做。”