而目标质谱仪像多反应监测这样的技术继续与样品制备、通量和灵敏度的问题作斗争，最近的出版物和演讲表明，该技术已经作为一种研究工具在工业界和学术界站稳了脚跟。vwin德赢ac米兰合作
特别是上周的11th在波士顿举行的人类蛋白质组组织年度会议上，许多科学家强调了针对各种应用的定向质谱工作流程，包括蛋白质生物标志物验证和验证以及药物研究。
辉瑞副研究员Hendrik Neubert介绍了使用免疫亲和质谱对基于抗体的药物进行临床前药代动力学/药效学分析的工作，他观察到“使用质谱，特别是免疫亲和质谱的愿望越来越强烈”，用于测量靶标和治疗水平，以支持PK/PD模型的开发。
Neubert说，对基于质谱的定量的兴趣增加“是由对非常高特异性的需求所驱动的”，并补充说，“在我的领域，我们经常遇到(传统的)免疫分析”无法提供这种所需的特异性的问题。
他概述了他的小组的免疫亲和质谱工作流程，该工作流程在液体处理平台上完全自动化，并使用基于柱状的抗体富集来捕获目标肽和蛋白质，用于LC-MS/MS定量。该平台包括一个高流量抗体富集步骤，然后是一个短的反相纳米流色谱阶段，使每个样品的检测运行时间小于10分钟。
Neubert说:“(免疫亲和质谱)的质量和成本正在与转化研究和临床环境中的常规蛋白质定量相适应。”“因此，我预计至少在我的研究领域(PK/PD建模)，也许在整个制药行业，这种技术的应用将越来越优先。”vwin德赢ac米兰合作
另一家行业参与者——法国生物技术公司BioMérieux——也报告了其使用靶向质谱技术，研究人员Geneviève Choquet-Kastylevsky介绍了该公司使用MRM-MS来评估57种候选蛋白质作为结直肠癌的生物标志物。
Choquet-Kastylevsky说，最初，BioMérieux计划开发用于评估过程的elisa试剂盒，但很快意识到开发近60种用于验证的elisa试剂盒是不可可行的。然后，该公司转向质谱，采用正常流LC建立MRM-MS工作流程，用于在两个队列中量化候选标记，一个队列中有116例和121个对照，另一个队列中有115例和222个对照。
Choquet-Kastylevsky称该项目是一个概念证明，证实了“[使用MRM-MS]量化大量患者血清中的肿瘤标志物等东西是可能的，”Choquet-Kastylevsky说，质谱工作流程提供了“一个技术平台，将真正允许我们评估新的生物标志物的性能”。vwin德赢ac米兰合作
她补充说，这一努力“向我们表明(MRM-MS)方法是可行的”。“我们认为有可能在人类身上实现这种检测的发展。”
西雅图Fred Hutchinson癌症研究中心的研究员Amanda Paulovich同样介绍了MRM-MS，描述了她的团队，Broad研究所研究员Steve Carr和首尔国立大学研究员Youngsoo Kim之间的合作，其中团队开发了四种多路检测，每种检测150个MRM-MS，她说，他们正在用它来测量30种“广泛使用和广泛基因组特征的乳腺癌细胞系”中300种蛋白质的表达。
通过对其中12个细胞系的分析得出的结果，Paulovich指出了她的实验室和Kim的实验室产生的数据之间的高度相关性，观察到分析表明“不仅使用这种(MRM-MS)技术达到了前所未有的多路复用水平，而且分析是可移植的……跨越了半个地球，跨越了语言和文化障碍。”vwin德赢ac米兰合作
她说，MRM-MS提供了定量、高通量、易于多路复用和可重复的分析。
然而，Paulovich指出，MRM-MS和Neubert所描述的免疫亲和质谱技术仍然存在障碍。她说，这vwin德赢ac米兰合作项技术存在不足，因为“我们没有用于绝大多数蛋白质的分析验证试剂，而且分析结果不容易生成新创在大多数最终用户实验室的时间、金钱或所需的专业知识方面。”
这与瑞士联邦理工学院苏黎世分校研究员Ruedi Aebersold上周在HUPO上发表的言论相呼应vwin德赢ac米兰合作（点9/14/2012），波洛维奇建议，为了实现其潜力，MRM-MS必须像基因组学一样，成为一种“没有接受过蛋白质组学专业培训的翻译科学家”可以轻松使用的工具。
这个目标是“完全可以实现的”，Paulovich说，并补充说她相信“概念的证明已经在这里了。”
然而，她承认，更广泛的实施可能会是一个挑战，并指出“这是一个巨大的潜在市场，但目前还不存在。所以商业部门不敢在这方面进行大规模投资，而学术部门既没有资金也没有能力进行产品开发。”
然而，尽管存在这个问题，靶向质谱继续缓慢但稳定地进入商业和临床领域。例如，安捷伦是MRM- ms工作流程开发的主要行业参与者之一，上周表示已与MRM蛋白质组学签署了联合营销协议，MRM蛋白质组学是从维多利亚大学基因组英属哥伦比亚蛋白质组学中心剥离出来的公司，将该中心开发的靶向蛋白质组学技术商业化。
安捷伦代谢组学和蛋白质组学营销经理Steve Fisher表示，根据协议，安捷伦将销售MRM蛋白质组学开发的MRM- ms试剂盒ProteoMonitor．
他说:“他们正在开发试剂盒，帮助人们进行定量蛋白质组学研究，我们将推广这些试剂盒。”“这将让我们推广他们正在做的事情，并将帮助我们在商业计划中推广蛋白质测量的三-四(定量)。”
该协议只是安捷伦开发MRM-MS作为广泛研究和临床应用工具的一系列努力中的最新一项。今年1月，该公司宣布与生物技术公司Integrated Diagnostics合作，改进现有的MRM-MS技术，旨在将InDi的肺癌检测商业化（点1/13/2012）．InDi的目标是在明年初将这种诊断方法作为实验室开发的一种基于大质量规格的测试推向市场。
安捷伦还与免疫亲和质谱方法SISCAPA的发明者之一、SISCAPA Assay Technologies的创始人兼首席执行官利·安德森(Leigh Anderson)合作，后者与诺伊伯特(Neubert)和辉瑞(Pfizer)合作开展了一些免疫亲和质谱工作。该公司和Anderson已经在自动化SISCAPA工作流程方面工作了几年，目的是实现临床应用所需的高可重复性和吞吐量（点2/11/2011）．
在一次采访中ProteoMonitor本周，Anderson表示，他和安捷伦将继续研究提高工作流程胰蛋白酶消化步骤的速度和可重复性的方法，但指出SISCAPA工作流程在质谱分析之前使用抗体对感兴趣的肽进行富集，可以使用安捷伦的RapidFire系统以每样本7秒的速度测量中高丰度的目标。
Anderson说，对于低丰度的标记，需要更广泛的色谱，该系统的循环时间可以在3到5分钟范围内。
Fisher指出，在安捷伦为SISCAPA和标准MRM-MS开发自动化、高通量工作流程的过程中，样品准备仍然是最具挑战性的部分。
不过，他说，该公司“非常接近解决工作流程中的所有错误”，并补充说，“我们目前正在进行一些合作，我预计我们一定会在明年公布结果。”
Fisher还表示，安捷伦希望在今年年底前开始营销第一批MRM蛋白质组学套件。
安捷伦以外的供应商也在努力提高目标大规模规格工作流程的性能和可访问性。例如，赛默飞世尔科技公司(Thermo Fisher Scientific)最近领导了一项努力，召集了几个领先的蛋白质组学团队，研究MRM-MS分析应用于前期蛋白质富集技术处理的临床样本的实验室间可重复性（点6/8/2012）．
Bruker公司传统上将其靶向蛋白质组学工作集中在MALDI-MS仪器上（点1/30/2012）该公司本月推出了首款lc -三重四极杆仪器，使该公司拥有了能够运行MRM-MS工作流程的新机器（点9/7/2012）．
在工具领域之外，一些蛋白质诊断公司也在转向定向质谱作为他们的测试平台。除了前面提到的InDi公司计划明年推出基于质谱的肺癌检测外，生物技术公司Sera预后也计划明年在质谱平台上推出早产预后检测（点11/18/2011）．
今年6月，Quest Diagnostics开始提供新的甲状腺球蛋白质谱检测方法，旨在帮助监测甲状腺癌手术后的复发情况（点6/22/2012）．