欧洲联盟和几个伙伴将向加强非洲病原体基因组流行病学活动的新项目投资2 200万欧元(约2 200万美元)，包括利用基因组数据为公共卫生决策提供信息。
全球卫生、欧洲和发展中国家临床试验伙伴关系联合项目(GH EDCTP3 JU)正在监督该项目，该项目最近完成了一项关于“用于监测和控制撒哈拉以南非洲与贫困有关和新发/再发感染的基因组流行病学”的研究提案征集。
全球卫生EDCTP3的一位发言人说，这些提案现在将由独立专家进行评估，之后将选出一些提案获得资助。一旦与选定项目签署赠款协议，该伙伴关系将能够提供更多关于其范围和期限的信息。该发言人表示，全球卫生EDCTP3认为，欧盟最终可能为每个项目贡献约500万欧元。
全球卫生EDCTP3于5月成立，同时宣布了这一呼吁。该联合项目包括欧盟以及欧洲和发展中国家临床试验伙伴关系(EDCTP)协会。后者自2003年以来一直存在，由14个欧洲国家和18个非洲国家支持的机构组成。2014年，它又被续订了10年。
根据该项目，全球卫生EDCTP3的预算总额约为16亿欧元，用于资助各种项目，其中约一半来自欧盟的地平线欧洲项目。其余来自EDCTP和各种慈善组织。在新的基因组流行病学呼吁的情况下，盖茨基金会是一个捐助方。
全球卫生EDCTP3发言人表示，支持非洲新的基因组流行病学相关项目的一个催化剂是COVID-19大流行，它导致了“全球基因组测序能力的空前扩张”，包括在非洲。
发言人说，尽管大流行使能力有所提高，但需要更多的投资来利用其潜力并创建基础设施，使任何发现都具有可操作性。
实现这一目标的一种方法是的描述程序目的是更好地将病原体基因组测序数据与临床和流行病学数据联系起来，以建立综合监测系统，监测撒哈拉以南非洲地区的传染病。
该发言人表示，GH EDCTP3 JU正在特别寻求为教育非洲公共卫生专业人员和研究人员的提案提供资金，以便他们更好地理解如何在他们的监测和疾病控制项目中使用与传染病相关的基因组信息。这些公共卫生当局还应更好地获得基因组数据，更多的研究人员和公共卫生官员应获得基因组流行病学方面的能力。项目还应侧重于培训下一代研究人员和官员，使他们能够自如地生成和使用这些数据。
GH EDCTP3 JU还在寻求资助一些项目，这些项目将在流行病学站点(如生物库和临床试验站点)和国家公共卫生机构内的基因组测序实验室之间建立更好的合作。项目描述中特别提到了非洲病原基因组学计划，作为非洲基因组测序能力提高的一个例子。
最终目标是使非洲国家能够更好地了解传染性病原体的流行病学，确定病原体的特征，并支持公共卫生项目、干预措施设计和有效性监测。
非洲PGI没有答复关于其在新项目中的作用的问题。
《全球卫生EDCTP3》概述的其他优先事项包括创建流行病学、临床和基因组数据综合数据平台;将基因组数据用于决策或产品开发目的的转化研究试点项目;以及社区建设，导致该地区基因组学专业知识的增加。
另一个重点是开发成本较低的解决方案，如可以在低资源环境中部署的诊断、治疗和疫苗。全球卫生EDCTP3还寻求加强撒哈拉以南非洲国家和区域公共卫生组织的基因组流行病学能力。
考虑到该领域迄今为止的投资，这一特定项目未接受与COVID-19相关的提案，但包括欧洲COVID-19数据平台以及该项目在内的其他项目之间的协调由- - - - - -COVID项目，正在被鼓励。
“一大步”
根据创新新诊断基金会(FIND)基因组学和测序副主任Anita Suresh的说法，EDCTP经常管理这类电话，作为地平线欧洲项目的一部分，该项目专注于改善非洲的诊断和卫生系统。然而，她说，这是首次专门针对基因组监测的新呼吁，“标志着对基因组学整体的兴趣和资助机会的增加。”
Suresh说，这家总部位于瑞士日内瓦的非营利组织一直在与总部位于纽约的洛克菲勒基金会病原预防研究所合作，跟踪下一代测序投资和应对大流行的能力建设。FIND和PPI已作出承诺能力映射通过由世界卫生组织共同领导的获取COVID-19工具加速器基因组监测工作组。
Suresh在谈到最近的趋势时说:“在非洲和全球，测序的安装基础和能力显然有了显著的增长。”她说，鉴于基因组能力的这种增强，将测序资源和相关数据联系起来并嵌入整个流行病学监测网络是“关键”。
苏雷什补充说:“各国和执行者还希望确保在COVID-19之后，利用这一已建立的基础设施和能力来应对重点传染病，从监测开始，最终改善临床护理。”因此，她将新的GH EDCTP3 JU项目称为“朝着正确方向迈出的一大步”，以确保COVID-19测序能力在大流行过后是可扩展和可持续的，作为监测和卫生系统的工具。
塞内加尔达喀尔巴斯德研究所的生物技术高级顾问Joe Fitchett说，vwin德赢ac米兰合作总的来说，对新的和不断升级的威胁进行病原体测序在获得医疗服务可能被拖延的环境中是重要的，在发烧常见且潜在感染范围更广泛的环境中是重要的。
Fitchett说，测序的价值通过与监测系统的集成得到了放大，包括评估宿主对病原体反应的免疫平台，以及与临床和流行病学数据的联系。他说，这在包括塞内加尔在内的几个非洲国家已经成为惯例，“应该成为今后的必要标准”。
Fitchett指出，除了投资于基因组流行病学数据整合平台以及提高整个地区的专业知识外，降低测序的价格和周转时间也可能导致对病原体进行更常规的测序。
他强调说:“降低成本的速度太慢，但迫切需要更好地描述区域和全球关注的病原体，并改善在实验室数量减少的环境中获得诊断的机会。”