纽约(基因组网)-美国国家人类基因组研究所本周宣布,它已经选定了2017财年最高3150万美元的资助对象,这是ENCODE项目扩大范围努力的一部分。
ENCODE是DNA元素百科全书(ENCyclopedia Of DNA Elements)的缩写,于2003年启动,旨在识别人类基因组中的所有功能元素,并以可访问和可解释的格式与科学界自由共享数据。大约一年前,NHGRI说它正在为五个新倡议寻求拨款申请,以扩大项目的功能要素目录;朝着对这些基因组元素在不同背景下的作用的一般理解迈进;制定策略,将该项目的发现应用于疾病;增加参与项目的研究人员数量;开发和传播新的分析工具,以提高ENCODE数据的价值。
几家机构的研究人员现在已被选中监督八个绘图中心,这些中心将在更多的细胞环境中创建人类和小鼠基因组候选功能元素的全面目录。这些机构包括布罗德研究所的研究小组;贝勒医学院;密歇根大学安娜堡分校;哈德森阿尔法生物技术研究所;vwin德赢ac米兰合作位于亨茨维尔的阿拉巴马大学;杰克逊实验室;斯坦福大学;Altius生物医学科学研究所;加州理工学院;vwin德赢ac米兰合作 and the University of California, Irvine.
NHGRI还为五个中心提供了拨款,这些中心将开发和应用新的和可推广的方法,以描述使用ENCODE数据识别的候选功能元素。这些中心将由加州大学旧金山分校的研究人员运营;华盛顿大学;斯坦福大学;康奈尔大学;劳伦斯伯克利国家实验室;以及路德维希癌症研究所/加州大学圣地亚哥医学院。
此外,还向计划开发和使用新的统计、数学和计算方法以改进ENCODE数据的分析、可视化或解释的小组颁发了6个奖项。这些团队包括约翰霍普金斯大学的团队;斯隆-凯特琳癌症研究所;哈佛大学;布里格姆妇女医院;斯坦福大学;华盛顿大学;犹他大学;以及加州大学洛杉矶分校。
NHGRI还承诺为斯坦福大学的一个数据协调中心和马萨诸塞大学、阿默斯特大学和耶鲁大学的一个数据分析中心提供资金。
NHGRI基因组科学部的项目主任Elise Feingold在一份声明中说:“ENCODE已经创建了高质量和易于获取的数据、工具和分析集,这些数据、工具和分析被广泛用于解释基因组序列和理解基因组变异的后果的研究中。”“这些奖项通过扩大资源的广度和深度,提供了加强这一基础的机会。”