GenomeWebinars:最近
由Seqera Labs赞助
用组学数据分析管道解开生物学
越来越多的多个组学学科被结合起来,更全面地研究生物过程。今天,多组学技术被用于个性化医疗和剂量控制研究,发现新的分子途径,人群水平的研究等等。随着对生物学的更好理解,研究人员可以设计更有效的预测模型,开发新的临床治疗方法,并验证新的疗法和药物。
在本次网络研讨会上,斯蒂芬·拉德他是牛津纳米孔生物信息学产品副总监Harshil帕特尔Seqera Labs的科学开发主管,将讨论工作流语言(如Nextflow)如何帮助研究人员构建和管理数据管道,以解析、处理和分析跨组学学科的大量数据集。当与Nf-core等项目的努力相结合时,可以创建和管理跨学科的管道,简化生产环境中工作流的执行,以创新的方式加速发现和探索多组数据。
由
赞助:Illumina
了解患者异质性在心血管疾病预防和治疗中的重要性
包含遗传和健康相关数据的大型数据集的爆炸式增长,使人们对心血管疾病生物学有了更深入的了解。然而,大多数研究主要集中在基本同质的样本上,这导致临床指南偏向于某些个体群体和那些没有其他复杂性的个体,如疾病共发病。
本次网络研讨会将重点关注基因组学研究,强调了解心血管疾病异质性的重要性,包括疾病的潜在遗传结构,共病个体的治疗,以及了解性别和遗传特异性风险。
由
由Akoya Biosciences赞助
通过高速多组空间表型识别癌症治疗靶点和耐药性
免疫检查点抑制剂已被证明是一种有效的治疗粘膜头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)的方法。随着抗pd -1/PD-L1免疫检查点抑制剂治疗在人乳头瘤病毒阳性和阴性患者中的成功,我们现在必须专注于开发一种持续预测的生物标志物,以指导患者选择高度靶向的检查点抑制剂治疗。
本次网络研讨会将讨论单细胞多组空间表型如何成为一种宝贵的工具,用于描述使用派姆单抗/尼volumab治疗的转移/复发性HNSCC肿瘤的无偏倚全切片成像的肿瘤微环境。使用这些技术,我们能够识别与免疫治疗耐药性和总生存率低相关的基质、免疫和代谢组织特征。
参加者将学习:
- 肿瘤微环境组成、结构和细胞结构现在被认为是理解免疫应答和耐药表型的关键。
- 与诊断为HNSCC的患者分层相关的挑战。
- 利用混合蛋白质/RNA检测板获得多组空间特征的全玻片空间生物学实验可能为靶向治疗选择提供线索。
由
由Invivoscribe赞助
CLL诊断、预后生物标志物评估和MRD监测的多参数方法
慢性淋巴细胞白血病(CLL)是一种发展缓慢、无法治愈的白血病。多种诊断工具和平台的可用性使我们能够识别疾病和疾病病程,并做出更明智的治疗决定。随着先进的多参数流式细胞术(MFC)的出现,cll特异性分子生物标志物可以提供预测和预后信息,允许人群分层为疾病进展、对治疗的反应等定义的子集。
在这次会议上,约瑟夫Annunziatakinred Healthcare将讨论CLL的诊断和可测量残留疾病(MRD)监测方法,以及使用多模态外周血分析进行预测和预后评估的好处。此外,本次演讲还将强调MRD在CLL药物开发中的作用。
在本次网络研讨会期间,Annunziata将:
- 比较CLL的各种诊断方法。
- 强调分子检测对CLL的预测和预后的好处。
- 评估MRD方法对CLL患者的长期监测。
- 探讨基于mfc的CLL MRD在药物研发中的先进作用。
由
由SeqOne赞助
一种临床验证和易于实施的HRD评分解决方案,使用靶向面板和浅全基因组测序
PAOLA-1/ENGOT-ov25 III期临床试验是一项针对晚期卵巢癌的一线治疗研究,结果显示,在同源重组缺陷(HRD)肿瘤患者中,PARP抑制剂奥拉帕尼联合贝伐珠单抗维持的最大获益。
在本次网络研讨会上,帕斯卡Pujol蒙彼利埃大学(University of Montpellier)的研究人员将描述一种基于低覆盖率和成本效益高的全基因组测序(WGS)的HRD评分解决方案的回顾性临床评估-使用PAOLA-1数据。SeqOne HRD解决方案结合了基因组不稳定性和从WGS中提取的CCNE1基因扩增特征,以及BRCA 1/2基因的致病突变。Pujol将描述确定测序覆盖率和肿瘤含量下限的稀释实验。来自PAOLA-1试验的368例患者的临床评估包括无进展生存期(PFS)数据以及与MyChoice CDx试验的比较。评估发现,SeqOne HRD解决方案具有低肿瘤含量的成本效益和效率,同时可以灵活地适应不同的实验室配置。
Pujol将加入迈克尔·布卢姆他将介绍SeqOne的人力资源开发测试方法。
由
由阿尔马登基因公司赞助
复杂性状分析的归责策略与技术
本次网络研讨会将深入探讨遗传研究中用于复杂性状的归责和分析的各种技术。专家演讲者将介绍填补缺失基因型数据的imputation方法,包括使用参考面板进行分期和imputation,并将指导与会者如何优化imputation工作流程。演讲者还将探讨不同的复杂性状分析方法,这些方法旨在支持研究人员的快速遗传分析和假设测试,无论他们是否有编程经验或技术背景。VWIN娱乐网站
与会者将学习如何利用这些技术来提高遗传研究中复杂性状的准确性和理解。网络研讨会还将包括问答环节,与会者可以向我们的专家提问并讨论他们自己的研究项目。本次网络研讨会是为研究人员,研究生和遗传学领域的专业人士设计的,但对任何有兴趣了解更多关于复杂性状的归因和分析的人都是开放的。
由
Ionpath赞助
利用MIBI的多重组织成像了解乳腺癌免疫浸润
透明质酸介导的动力受体(RHAMM)的表达已被观察到在乳腺癌患者中存在很大程度的异质性,其过表达与侵袭性亚型有关。在本次网络研讨会上,认为他而且格兰特Barthel明尼苏达大学的研究人员将讨论为了解RHAMM在调节乳腺癌免疫反应中的作用而进行的研究,以及他们如何应用多路离子束成像(MIBI)来表征人类乳腺癌FFPE切片中的免疫浸润。
主持人将讨论:
- rhamm相关肿瘤微环境(TME)中免疫细胞的富集-如B细胞,T细胞和巨噬细胞。
- rhamm相关TME中肿瘤和免疫细胞的空间关系。
- 与RHAMM表达相关的免疫细胞活性。
由
赞助:ArcherDx (IDT)
髓系肿瘤高级综合基因组板:锚定多重PCR (AMP)技术在GenPath Oncology的实施和实践vwin德赢ac米兰合作
在包括骨髓增生异常综合征、骨髓增生性肿瘤和急性髓系白血病在内的髓系肿瘤中,多重NGS板正在成为基因组分析的标准护理解决方案。Wojciech斯瓦特GenPath癌症基因组学和分子病理学部门的医学主任,使用快速通量NGS研究小组利用锚定多重PCR (AMP)技术,协助血液病理学同事在骨髓活检中对髓系恶性肿瘤进行形态学评估。vwin德赢ac米兰合作这样的小组有助于诊断,风险分层,预后和恶性克隆的纵向跟踪。与传统检测方法(如PCR/片段分析和Sanger测序)相比,NGS基因组分析可以显著简化实验室工作流程,以大大减少tat提供全面的评估,并提高分析的敏感性和特异性。
在这次演讲中,Swat将讲述他在GenPath实验室使用快速通量、多面板Archer VariantPlex Myeloid和FusionPlex Myeloid Research Use Only (RUO)分析的经验,这些分析能够在两天内提供结果,可以跟踪特定克隆的MRD,并可以检测到变异等位基因频率低至0.1%的亚克隆的出现。
由
赞助:TE Connectivity
了解设计转让和监管规定,有效支持IVD产品的量产和商业化
在IVD设备设计过程中尽早让转移到制造团队参与,可以增加成功将医疗设备设计转移到生产的可能性。此外,并行工程和管理活动将缩短开发时间,降低生产成本,提高产品质量。
从小批量试产线到完全自动化生产的过渡,需要一个高度熟练的技术转移团队努力确定扩大规模的参数,建立正确的方法,并设计专门的工艺设备。vwin德赢ac米兰合作能够适应生产坡道的iso认证和灵活的制造资产也具有重要的战略意义。这些集成功能极大地降低了技术转让的风险,同时提高了产品商业化的成功率。vwin德赢ac米兰合作
在本次圆桌讨论中,IVD运营、向制造转移和监管方面的行业专家将讨论向生产过渡的挑战和需求,以及选择战略合作伙伴的考虑因素,该合作伙伴将整合监管、开发和制造服务的全套服务,以避免不良结果,如产品重新设计、低制造产量或意外的成本增加。
由
赞助:Illumina
社区环境中的综合基因组分析:来自病理学家和肿瘤学家的观点
综合基因组分析(CGP)是一种新一代测序技术,可以使用单一检测方法识别数百个基因的基因组改变。vwin德赢ac米兰合作CGP在临床实验室的应用是个性化癌症治疗方案的有力方法。实现CGP内部提供了减少周转时间的机会,并使临床医生能够为患者管理做出明智的决定。
在本次网络研讨会上,Carlo Bifulco博士而且瑞秋·桑伯恩博士将深入了解普罗维登斯癌症研究所内部CGP检测的好处,以及这种方法如何促进更强的多学科合作和患者管理,并有可能改善患者护理。演讲者将通过案例研究强调内部CGP在患者护理中的影响。CGP未来的潜在机遇也将被强调。
由
由SPT Labtech赞助
流行病学实验室SARS-CoV-2测序的小型化和自动化
SARS-CoV-2大流行要求监测该病毒的流行病学实验室的测序能力呈指数级增长。
在本次网络研讨会上,昆汀数而且理查德Chalvignac里昂公民临终关怀中心将在他们的实验室讨论SARS-CoV-2测序的小型化和自动化。他们的方案使样本处理能力增加了52%,使他们能够在流行高峰阶段每周对多达5000个样本进行测序。
由
赞助:Seegene Inc
是三联症吗?RSV/流感/COVID-19检测和患者护理的最新情况
在COVID-19大流行之后,许多非covid呼吸道病原体正在死灰复燃。特别是流感和呼吸道合胞病毒(RSV)的阳性反应均呈上升趋势。
RSV是婴儿呼吸道住院最常见的单一原因,也是全球下呼吸道感染死亡的第二大原因。今年RSV发病率超过了通常的病例数,SARS-CoV-2大流行的免疫差距加剧了这一情况。因此,卫生保健资源正在紧张,产生了新的挑战。
本次网络研讨会将从诊断和患者护理临床医生的角度概述当前呼吸道疾病的现状。
我们的演讲者将:
- 提供COVID-19检测和治疗趋势的最新情况
- 强调大流行后流感和呼吸道合胞病毒复苏的临床考虑
- 讨论非covid呼吸道病原体阳性增加对实验室和医疗系统在这个呼吸季节意味着什么
由
由SomaLogic赞助
血浆蛋白质组学在肺动脉高压中的早期发现、危险分层和药物靶点识别
肺动脉高压是一种罕见的疾病,是临床异质性的,往往在疾病进展的晚期被诊断。血浆蛋白质组学提供了早期诊断,风险分层患者,并确定新的药物靶点的潜力。
在本次网络研讨会上,克里斯托弗·罗兹而且马丁·威尔金斯将讨论:
- 肺动脉高压作为一种临床症状。
- 将蛋白质组学应用于风险分层。
- 结合蛋白质组学和全基因组关联研究,以确定与该疾病相关的蛋白质数量性状位点。
由
由Seqera Labs赞助
医疗保健和生命科学研究中控制云计算成本的策略
对于大大小小的生命科学公司来说,在云计算中管理成本是一个越来越大的挑战。虽然云超大规模提供了许多优势,包括规模、最先进的基础设施和灵活的按使用付费模式,但这种便利性和灵活性是有代价的。组织经常难以充分跟踪和管理云支出——尤其是在混合和多云环境中。挑战包括:
- 未经批准或不必要的运行。
- 部门或研究小组的支出缺乏可见性。
- 闲置的或未充分利用的资源。
- 复杂的多维云计费模型。
在这次联合网络研讨会上,迈克尔Kroell以及Nf-core创始人菲尔·埃韦尔斯博士将分享他们在云中运行大规模生物信息学管道的经验。Kroell将讨论Gritstone使用云计算进行基因组和表观基因组分析,并讨论在云中运行工作负载的好处和潜在挑战,而Ewels将讨论开发人员、生物信息学家和Nextflow社区的其他成员在日常工作中使用的一些技术,以大规模管理工作负载并最大化利用云资源。
由
赞助:Illumina
基于ngs的半自动化同源重组缺陷评估
当肿瘤表现出同源重组缺陷(HRD)时,患者可能适合用PARP抑制剂治疗。近年来,由于临床试验产生了有希望的数据,PARP抑制剂的适应症已经扩大。虽然有多种方法来检测HRD,但新一代测序(NGS)正在成为一种强大的技术,可以在一次试验中同时评估致病基因和基因组瘢痕。vwin德赢ac米兰合作
在本次网络研讨会上,Conxi Lázaro, Daniel Azuara和Bellvitge生物医学研究所的Sergio Villatoro将解释他们在实验室中建立Illumina TruSight Oncology 500 HRD半自动化方案的经验、系统的性能和验证阶段的结果,包括对96名连续的高级别浆液性卵巢癌(HGSOC)患者的分析,这些患者此前曾接受过金标准HRD测试Myriad myChoice CDx。
主讲人将讨论:
- DNA修复机制和BRCA。
- hr缺陷性卵巢癌基因突变的鉴定。
- 评估乳腺癌、卵巢癌和前列腺癌的效用。
- 一致性研究验证TruSight Oncology 500 HRD检测。
由