纽约 - 单细胞DNA测序公司Mission Bio为其Tapestri样品制备平台推出了新的功能,包括三个与癌症相关的面板 - 由客户对同行评审的研究验证 - 以及在仪器上运行更少细胞的能力。
已发表的面板包括由Memorial Sloan Kettering Cancer Center的研究人员设计的Myelip恶性克隆的研究人员设计的T细胞急性淋巴细胞白血病测定,并由澳大利亚Peter Maccallum癌症中心设计的研究人员设计的组合小组(Peter Mac)。
“现在,他们在我们的网站上提供作为目录产品,”anjali pradhan.,任务生物的产品管理副总裁。“随着我们渗透血液学和肿瘤学,这真的加速了正在入门的研究人员。”
VIB / KU Leuven Panel包含超过与全部有关的110个基因的300多个区域。但是一些公布的面板可能太具体了特定的实验室的利益是广泛有用的。“我认为这个想法很好,但也许我们的面板是一点异常值。它在两个不同的研究中使用该小组的分子血液研究员艾拉·汤普森说,这是一个杂项。”
Tapestri平台现在也可以运行少于20,000个单元格,而以前则它耗尽了大约100,000。“这真的可以帮助客户拯救他们的宝贵样本,并运行更多的翻译和临床样本”Pradhan说。
新功能遵循添加单细胞表面蛋白质测量使用来自BioLegend的共轭抗体,去年年底宣布。更一般地说,该公司继续推动美国以外的市场,并更多与制药公司进行订婚。
面板导致了“增加了与Pharma的机会增加”Pradhan.说。使命生物也推出Pharma Assay开发服务4月份并与Semanta合作,在中国提供单细胞DNA测序服务。
在许多月内减少每次运行所需的细胞数量,以保留与较高数量的细胞相同的灵敏度水平。“研究人员总是在实验室中进行,然后尝试一下,但我们希望向他们保证,在检测到罕见的变种时,您可以获得这种敏感度。”改变是帮助客户在治疗抵抗,谱系追踪和基于多组合的筛选方面进行研究,Pradhan.说。
根据LluciaAlbertí-Servera是2月份的克隆异质性论文的第一作者血与来自vib和ku leuven的同事,她是一个邮政编码。
“要使用任务生物,你需要知道你在寻找什么,”她说。“在我们的情况下,它是来自110个不同基因的300个地区。”该小组是专门针对患者样品的公布研究设计的,但旨在用于随后的研究。
“我们不仅能够检测突变,还可以在单细胞层面上进行突变,”她说。在不同时间点进行治疗后克隆揭示了缓解的残留克隆。“你可以立即回答是否是预先存在的克隆的问题,或者如果它是一个新的问题。如果复发,你可以看到复发机制是什么,无论是现有的突变还是a德诺维一。”
来自面板的数据是“真的很好”,她说。“我们真的瞄准了那些最突变的地区。”
她说她会“很高兴看到更广泛的社区使用。”她唯一关心的是制造和交货时间。她叫制造过程“艰苦”,并说需要五个月的时间来从她在目标清单中发送的那一刻收到套件。
“自2018年以来,Mission Bio的制造过程已经急剧提升,具有精简的进程和专门的人,以协助每次定制面板订单,”在一封电子邮件中表示。“目录面板通常在一周内发货,自定义面板从完整的设计中需要2-3周。”
每个套件成本至少为1,000欧元(1,159美元),Albertí-Servera表示,以及总样品准备成本 - 不包括测序 - 每种样品约为1,500欧元至2,000欧元。
相比之下,彼得Mac面板涉及与几种不同研究的70个基因的70个区域涉及汤普森。第一次看着在两个共突变的MPN的两种情况下肌鳞状肿瘤驱动突变之间的克隆关系,第二次使用相同的小组在慢性淋巴细胞白血病或地幔细胞淋巴瘤的九个患者的克隆结构研究中。
该团队在2020年8月的第一项研究中公布了结果血液淋巴动物并从第二次虚拟会议的血液学学会的第二次虚拟会议上提出了数据。
在第一项研究中,通过其他方法获得类似的结果将需要种植超过10,000个克隆的克隆。“数字上,实际上做太多了,”汤普森说。Tapestri数据有助于扩展以前从基于殖民地的测定获得的结果。
在第二项研究中,Tapestri提供了一种非常罕见的突变的能力,大约为10,000的细胞。“如果我们抽出较小的数字,我们就无法看到那些低级事件,”她说。
虽然她持怀疑态度,但另一个实验室有兴趣订购小组,她仍然认为提供的潜在有价值。“看到其他人的小组的内容总是一个好主意,”她说。
她指出,在设计她的小组时,细胞表面制造商无法在“但是将是一个很棒的补充”,“她说。
Pradhan表示,Mission Bio将继续向Tapestri添加能力,包括更高的细胞吞吐量和细胞复用,并在实体肿瘤分析和癌症治疗周围开发更多的应用。