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研究称,数据分析可以使早期的SARS-CoV-2变体检测成为可能

根据这项研究,通过对现有序列数据进行高效数据分析,欧米克隆变体可以更早地检测到SARS-CoV-2本周在《美国医学会杂志》网络开放.现在是美国的主要SARS-CoV-2变种,Omicron最早于2021年11月底由南非报告,随后不久由美国疾病控制和预防中心报告。为了确定是否可以更早地检测到这种变异——这可能为更好地控制其传播提供了机会——弗雷德·哈钦森癌症研究中心的科学家们领导的一个小组对从2020年初到2021年底期间从63686名非洲人和531827名美国人收集的病毒基因组序列数据应用了统计学习策略(SLS)。调查人员发现,早在2020年12月31日,Omicron就在南非被检测到,它可能比官方宣布的时间早了近一个月。该研究的作者写道,更早地发现SARS-CoV-2变体可能有助于全球在疾病预防和控制方面的努力。“为了优化早期检测,高效的数据分析,如SLS,可以利用全球监测的病毒序列数据,在新变种出现时,帮助快速识别它们,无论它们是否指定了血统。”

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团队提出具有结构设计能力的De Novo蛋白质工具

一个瑞士领导的团队在PNAS上分享了一种人工蛋白质设计方法,该方法将目标拓扑和结构见解添加到现有的名为TopoBuilder的全新蛋白质设计策略中。

研究跟踪酵母模型中缺失个体基因的蛋白质组结果

正如他们在《自然通讯》上报告的那样,研究人员通过对序列基因敲除的酵母模型生物中发现的蛋白质转移进行表征和聚类,获得了功能线索。

LivestockExp数据库跟踪几种动物的基因表达和拼接

研究人员使用超过43,700只动物的RNA序列,在BMC Genomics建立了一个数据库,用于分析和可视化物种内部或跨物种的转录或网络特征。

三外显子用于检测先天免疫错误的De Novo变异

在eLife的一篇新论文中,研究人员通过对亲子三胞胎的回顾性外显子组测序,追踪了14个可能具有诊断意义的罕见变异,以123个疑似先天性免疫错误。
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