在基因组生物学中，研究人员共享无参考的纳米孔转录分析算法

来自澳大利亚、西班牙和葡萄牙的一个团队提出了一种名为“RATTLE”的无参考“贪婪聚类”算法，用于基于纳米孔测序读取的转录数据汇总和量化。正如他们在《华尔街日报》基因组生物学，研究人员将RATTLE应用于多种样本类型的模拟和真实RNA序列数据，包括人体组织样本。作者写道:“使用模拟数据、异构体峰值和来自人类组织和细胞系的测序数据，我们表明，尽管没有使用任何参考文献中的信息，但在恢复转录本序列及其丰度方面，rattl具有竞争力。”并补充说，他们的rattl方法“为纳米孔转录组学的大量潜在新应用奠定了基础。”