绘制大肠癌的单细胞基因组、转录组图谱

利用多种测序技术，北京大学的科学家已经生成了原发性和转移性结直肠癌(CRC)的单细胞基因组和转录组图谱。这项工作出现在本周的基因组医学，对这种疾病的分子机制有了新的认识。虽然技术的进步使研究CRC发生和转移的细胞和分子基础成为可能，但肿瘤内的异质性和癌症的不同组学之间的关系尚未得到系统的研究。为此，研究人员对12例转移性结直肠癌患者的邻近正常组织、原发肿瘤和转移性肿瘤进行了全基因组测序、多区域全外显子组测序、同步单细胞rna测序和单细胞靶向cDNA Sanger测序。他们发现，PPAR信号通路在CRC肿瘤中普遍异常激活。此外，在患者源性肿瘤类器官中，阻断该通路抑制了CRC的生长并促进了CRC的凋亡，提示异常激活PPAR信号通路在CRC的肿瘤发生中起着关键作用。研究人员还结合了单细胞RNA-seq和通过靶向cDNA Sanger测序进行的单细胞点突变鉴定，以揭示同一患者中存在和不存在临界点突变的癌细胞之间的表型差异在活的有机体内单细胞分辨率。该研究的作者写道，这项工作提供了“关于转移机制的新知识，以及CRC诊断和治疗的潜在标记物和治疗靶点。”