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面包小麦基因组组装,大肠杆菌群体基因组分析,M6A转录组制图

南非面包小麦的染色体规模基因组组装(小麦)是报道自然遗传学本周.一个由阿卜杜拉国王科技大学的科学家们领导的团队制造了这个装置vwin德赢ac米兰合作t . aestivum栽培品种Kariega——它比以前的小麦组合更接近一个数量级——使用高保真长读、光学绘图和染色体构象捕获的组合。他们写道,这种组装在很短的时间内就完成了,成本仅为以前染色体规模的小麦组装的一小部分,而且不需要“以前基于基因组的小麦基因克隆方法所需要的耗时费力的复杂性降低”。它还揭示了一种有助于抵抗一种关键面包小麦病原体的基因,它与一种提供抵抗另一种病原体的基因是等位基因。

群体基因组分析大肠杆菌在肯尼亚饲养牲畜的家庭中提出了微生物学性质本周,强调需要建立一个监测框架,以确定人畜共患病原体的出现。在这项研究中——内罗毕疾病出现的流行病学、生态学和社会经济学(或称城市动物园)项目的一部分——由爱丁堡大学的研究人员领导的一个团队对1338人进行了全基因组测序大肠杆菌从内罗毕99个家庭的人类、牲畜和家庭周边野生动物中分离得到的分离株。他们发现多样性和共享模式大肠杆菌很大程度上是由家庭构成的,很大程度上是由宿主类型形成的,并发现了家庭间和宿主间共享以及人类和动物之间的证据。科学家们写道:“这些发现表明,家庭细菌的分布主要(虽然不是完全)受传播限制的驱动,而在家庭内,宿主生态位是细菌共享(和它们的基因库)分布的最强驱动因素。”他们还发现,这些分离株的耐药组的相似性与共享基因组的模式不匹配,这可能反映了常见的抗生素使用习惯,特别是在家禽中。这组科学家总结说,这项研究强调有必要在适当的范围内对新出现的病原体进行监测——在这种情况下,是家庭——并“考虑到可能由牲畜、野生动物或人类自身造成的流行病学联系的相互联系模式。”

一种单核苷酸分辨率的n6 -甲基ladenosine (m6A)全转录组定位新方法被发表在本周的自然生物技术vwin德赢ac米兰合作.虽然m6A修饰的生物学重要性已被证实,但无法在整个转录组中绘制单个m6A修饰位点限制了研究。为了解决这个问题,芝加哥大学的研究人员开发了m6A选择性烯丙基化学标记和测序,或称m6A- sac -seq,它以单碱基分辨率映射整个转录组中的m6A位点,只需要大约30纳米克的输入RNA。他们使用这种方法来绘制来自细胞系的RNA中的m6A修饰化学计量学在体外从人类造血干细胞和祖细胞中进行单核细胞生成,识别出大量细胞状态特异性的m6A位点,这些位点的甲基化状态在细胞分化过程中是高度动态的。科学家们写道:“我们认为m6A- sac -seq将成为一个金标准,克服目前m6A定量测序的技术瓶颈,并使新的生物发现成为可能。”

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另一个提高

据《华盛顿邮报》报道,Moderna正在寻求获得美国食品和药物管理局(fda)的批准,为所有成年人提供第二种新型冠状病毒(SARS-CoV-2)疫苗增强剂。

BA.2上升

据美国广播公司新闻报道,SARS-CoV-2的ba -2变体预计将成为美国的主要病毒变体。

为了渡渡鸟的复兴

据《每日电讯报》报道,研究人员已经对渡渡鸟的基因组进行了测序,朝着灭绝的方向迈出了一步。

科学论文提出评估因果变量的方法,初始编辑方法

本周的《科学》杂志:评估因果变异的大规模并行报告者分析方法,以及更多。
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