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Nature论文:从大量数据预测单细胞表达,在陨石中发现的嘧啶碱基,更多

的统计方法预测细胞组成和基因表达在单个细胞类型的大量RNA测序数据中提出自然癌症这个星期。该贝叶斯模型被称为BayesPrism,由康奈尔大学和斯隆·凯特林研究所的研究人员开发,利用患者来源的单细胞RNA-seq参考作为先验信息,从大量RNA-seq数据集中共同推断细胞类型组分和基因表达的后端分布。科学家们写道:“通过明确建模并忽略单细胞参考数据和大量数据之间的基因表达差异,BayesPrism在肿瘤和非肿瘤环境中细胞类型片段推断方面大大优于领先方法。”该模型使用胶质母细胞瘤、头颈部鳞状细胞癌和皮肤黑色素瘤中的大量RNA-seq和scRNA-seq样本数据集进行了演示。

形成DNA和RNA所需的嘧啶碱基已经被发现发现于富含碳的陨石中,表明遗传特性的出现根据一项新的研究,地球上最早的生命起源于外太空自然通讯.迄今为止,在陨石中只检测到嘌呤碱基,如鸟嘌呤和腺嘌呤,但实验室实验表明,嘧啶——包括胞嘧啶、尿嘧啶和胸腺嘧啶——可以从这些星际物体中发现的化学前体中产生。为了进行调查,一个由多个研究所组成的日本科学家团队使用了最先进的分析技术,优化了碱基的小规模量化,对三颗碳质陨石进行了检测。除了之前在陨石中检测到的嘌呤碱基,他们还发现了各种嘧啶碱基,如胞嘧啶、尿嘧啶和胸腺嘧啶,以及它们的结构异构体。"考虑到嘧啶分子分布的相似性陨石和那些在光子处理的星际冰类似物中,其中一些衍生物可能是由星际介质中普遍存在的光化学反应产生的,后来在太阳系形成过程中被纳入小行星,”他们写道。因此,大气中的碱基可能是早期地球上DNA和RNA的组成部分。

一个RNA计数的新工具在单细胞RNA测序实验中描述自然方法这个星期。在scRNA-seq中,计数策略被用来减少来自每个RNA或DNA分子的扩增子的过量计数,但没有实验策略来评估计数性能。为了解决这个问题,卡罗林斯卡学院的科学家开发了他们称为分子尖刺的东西:含有内置唯一分子标识符的RNA尖刺,可以用于识别scRNA-seq中准确计数RNA的关键实验和计算条件。利用分子尖刺,他们发现流行的scRNA-seq方法中RNA计数受损。研究人员还展示了如何利用分子峰值来提高对细胞内内源性RNA总量的估计,并挽救错误的实验。

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煤矿里的传染病金丝雀

麻疹病例在全球范围内激增,引发卫生官员对这种疫苗可预防疾病和其他疾病可能爆发更大规模疫情的担忧。

度过大流行

拜登总统的首席医疗顾问安东尼·福奇不得不澄清他一天前关于美国“已走出大流行阶段”的评论。

孩子们的另一个选择

Moderna正在寻求FDA授权,向6岁以下儿童提供其COVID-19疫苗,为儿童提供辉瑞疫苗之外的另一种选择。

Nature论文:从大量数据预测单细胞表达,在陨石中发现的嘧啶碱基,更多

本周的《自然》杂志:从大量数据中预测个体细胞类型的基因表达,在富含碳的陨石中发现的嘧啶碱基,等等。
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