提出了一种检测单细胞完整转录组的新测序方法在本周的自然生物技术vwin德赢ac米兰合作.大多数单细胞转录组测序方法扩增了多聚腺苷酸转录本的末端,仅捕获了整个细胞转录组的一小部分,并排除了许多长非编码、短非编码和短非编码的检测非聚腺苷化蛋白编码转录本。为了解决这一缺点,由荷兰Hubrecht研究所的研究人员领导的一个小组开发了一种方法,通过分裂和跟踪细胞裂解后的所有RNA分子,在单细胞中捕获非聚腺苷酸化和多聚腺苷酸化转录本。该技术被称为VASA-seq——通过da -tail对单细胞进行大规模转录组分析的缩写——具有高通量,与基于平板的格式和液滴微流体兼容,并且不依赖于商业试剂盒。“VASA-seq是一种敏感且可扩展的单细胞技术,它揭示了一层生物信息,而依赖于当前mRNA tervwin德赢ac米兰合作mini-centric视图的技术无法实现,”它的开发人员写道。
感染阿斯加德古菌的六种病毒的基因组被认为是与真核生物密切相关的原核微生物报道微生物学性质本周.阿斯加德在世界各地都有发现,基因组数据表明,它们是产生第一个真核生物共同祖先的古细菌细胞的后代。然而,感染这些生物体的病毒还没有被描述。在本周的研究中,来自德克萨斯大学奥斯汀分校的科学家们使用从深海热液沉积物中恢复的宏基因组序列来描述六个相对较大的双链DNA病毒基因组,它们感染了两个阿斯加德古菌门。在他们的发现中,这些病毒同时具有原核和真核病毒的特征,这与它们宿主的进化位置是一致的。研究人员写道:“对与阿斯加德相关的病毒的描述促进了我们对其分子作用、宿主相互作用和基因组特征的理解。”
在青藏高原冰川中发现的微生物的基因组目录是本周出版自然生物技术vwin德赢ac米兰合作这是首个此类工具,可能有助于为冰川融化的潜在健康风险的调查提供信息。青藏高原是世界上几条大河的源头,也是低纬度冰川面积最大的地区。在这项研究中,由中国科学院领导的研究小组对来自21个覆盖雪、冰和冰冰栖息地的西藏冰川的85个宏基因组和883个培养分离物进行了测序,以建立西藏冰川基因组和基因目录。该资源包含883个基因组和2358个宏基因组组装基因组,代表了横跨30个门的968个候选物种,以及超过2500万个非冗余蛋白质编码基因。科学家们写道,这个目录可以作为一个数据库和平台,在基因组和基因水平上存档、分析和比较冰川微生物群——在冰川生态系统受到全球变暖威胁的情况下,这是一个特别及时的资源。他们总结道:“这项工作填补了冰川生态系统中微生物多样性和功能理解的主要知识空白,并为生物活性化合物的生物勘探和冰川退缩的区域健康影响评估提供了一个丰富的工具包。”