在公共科学图书馆遗传学,位于布拉迪斯拉发的科美纽斯大学领导的团队提出了基因组、转录组和蛋白质组的研究结果分析假丝酵母parapsilosis它是一种酵母菌,能够代谢苯或苯甲酸衍生化合物。通过短读和长读序列数据,研究小组将13兆酶,染色体水平的基因组组装在一起c . parapsilosisCLIB214菌株,最初是从波多黎各一名接受腹泻治疗的患者身上分离出来的。除了基因组注释和系统发育分析,作者还使用了RNA测序、蛋白质组学分析和基于基因敲除的转录因子分析来深入研究gentisate和3-氧化己二酸途径c . parapsilosis用于处理羟基衍生物化合物。他们报告说:“我们发现,这两种途径中涉及的底物转运体和酶的编码基因分别由转录激活因子Otf1p和Gtf1p共同表达和调节。”他们补充说,这些发现“揭示了这两种途径与中枢代谢和细胞器生物发生的联系,并提供了对羟色胺化合物代谢进化的深入了解。”
对于一个纸《公共科学图书馆•综合》在美国,密歇根大学(University of Michigan)和杜克大学(Duke University)的研究人员在寻找导致败血症的基因因素,并着眼于开发多基因风险评分。从一项涉及2261名败血症患者和近13100名未受影响的对照组的全基因组关联研究开始,该团队基于772例败血症-2相关变异和442例败血症-3相关变异,得出了败血症-2和败血症-3类型的不同多基因风险评分。通过多变量调整,作者缩小了与败血症-2或败血症-3独立相关的数十个基因变体,以及与两种败血症类型有重叠关联的25个变体。他们写道:“败血症-2和败血症-3既有独立的遗传变异,也有共享的遗传变异。”他们指出,“大多数遗传变异的影响大小较小,但累积起来,多基因风险评分具有良好的识别力。”
利用单细胞RNA测序,英国的研究人员跟踪锥虫属brucei转录组在引起锥虫病的寄生虫的发育阶段。正如它在PLOS病原体该团队对从受感染的采采蝇载体的唾液腺、中肠和其他部分分离出来的388个锥虫个体进行了单细胞RNA-seq,确定了锥虫体内不同的细胞类型、转录和形态特征。“我们应用单细胞RNA测序来探索采采蝇中异质锥虫种群,”作者写道,并指出他们的数据正在通过一个在线单细胞图谱资源向寄生虫学社区的其他成员提供。