果蝇胚胎发生的单细胞图谱

阿特拉斯的果蝇胚胎发育在单细胞分辨率发表在科学本周，为其研究提供了新的资源。为了建立图谱，由华盛顿大学的科学家领导的一个团队使用各种测序技术，从横跨整个的11个重叠窗口，分析了近100万个细胞核的染色质可达性和50万个细胞核的基因表达果蝇胚胎发生。利用胚胎集合中的发育不同步性，他们进一步使用基于深度神经网络的预测建模来精确预测每个核的发育年龄，从而获得绝对时间内分子和细胞跃迁的连续、多模态视图。该研究的作者写道:“有了这些数据，增强子使用和基因表达的动态可以在几分钟内探索不同谱系内和不同谱系的基因表达，包括像合子基因组激活这样的精确转变。”“尽管幼虫阶段仍然没有得到充分的描述，我们希望这些数据和方法，以及最近发布的大型成虫图谱，使我们更接近社区范围内的多模式目标果蝇Atlas跨越了从受精卵到成年的连续体。”