团队解开果蝇模型中可选的末端连接特征

来自塔夫茨大学和华盛顿州立大学的研究小组提出了对基因序列的分析结果特别倾向于替代端连接在被基于crispr -Cas9的基因编辑中使用的Cas9酶剪切后，这是一种可能不准确的双链DNA断裂修复形式。通过深度测序和计算分析，研究人员分析了大约1100个半随机DNA质粒结构，这些质粒与单导向RNA一起被注入果蝇表达Cas9酶的果蝇胚胎，专注于合成依赖的微同源性介导末端连接(SD-MMEJ)修复。作者写道:“我们在单核苷酸分辨率中发现了驱动SD-MMEJ修复成功的序列特征的证据。”“这些包括最佳引物重复长度，重复到断裂的距离，引物重复之间DNA序列的灵活性，以及相对于首选引物重复的微同源模板的定位。”