英国研究考虑快速、较慢的SARS-CoV-2测序策略用于医院感染控制

在eLife，伦敦大学学院领导的研究小组提出了研究结果从一个前瞻性的非随机试验在2020年冬季和2021年冬季进行的研究，将SARS-CoV-2测序作为一种感染预防控制(IPC)措施，在英国国家卫生服务的十多个急性医院信托中进行。利用英国COVID-19基因组学测序中心生成的数据以及量身定制的报告策略，研究人员将8周的快速病毒测序与4周的SARS-CoV-2测序进行了比较，周期为5至10天。从2020年10月至2021年4月报告的2170例“医院发病的COVID-19感染”(HOCIs)中，他们在研究的干预阶段为650例病例生成了SARS-CoV-2序列。尽管快速和非快速的SARS-CoV-2测序方法导致了相当一部分病例的感染控制病毒变化，但在研究期间，这种方法似乎没有显著改变传播。“虽然我们没有证明测序对医院传播发生率的直接影响，但我们的结果表明，测序可以通知IPC对hoci的响应，特别是在5天内返回时，”他们报告说，并指出“在实施干预和有效应对产生的任何见解时遇到了重大困难。”