纽约(基因组网)——一个来自英国、美国和瑞典的团队扩大了之前记录在家犬基因组中的microrna的收集范围，犬属后裔．
诺维奇基因组分析中心的脊椎动物和健康基因组学研究员Luca Penso-Dolfin在一份声明中说:“我们的研究结果代表着我们对狗基因组知识的明显进步，为进一步研究基因调控的进化以及microrna对病理状况的贡献铺平了道路。”
当他们今天的报道在《公共科学图书馆•综合》Penso-Dolfin和他的同事们对9种狗组织中的小rna进行了测序，作为注释狗的mirna的努力的一部分。他们发现了超过800个狗的mirna，包括720个保守的mirna和91个过去没有描述过的mirna。该结果有望成为了解miRNA生物学的资源，特别是研究团队使用家狗来模拟与人类特征和疾病相关的基因调控。
作者写道:“许多与病理状况相关的miRNAs靶位点的多态性已经被识别出来。”“研究这些新型mirna的功能作用有可能进一步阐明几种人类疾病的生物学，以及在狗身上人工选择的表型性状的进化。”
家犬由于其多样性和与人类共享环境的悠久历史，一直受到人们的青睐。对于与一种或多种狗的疾病重叠的人类疾病尤其如此，包括复杂的特征或者疾病狗癌症如慢性髓系白血病、膀胱癌、淋巴瘤或骨肉瘤。
为了获得狗基因组调控特征的更可靠的视图，研究人员使用Illumina HiSeq 2000测序了小RNA文库，这些小RNA文库代表了家狗的血液和大脑、心脏、肾脏、肺、卵巢、皮肤、睾丸和平滑肌的组织。
研究小组借助最新的狗基因组参考汇编CanFam3.1和其他几种动物物种的序列分析了这些序列，并确定了720个保守的mirna——这一组包括207个在其他动物中描述过的、但以前在狗基因组中没有发现的保守mirna。
研究人员还发现了91个新的mirna，以及263个预测的piwi相互作用RNA (piRNA)簇。他们进一步考虑了组织特异性的小RNA表达，并尝试预测家犬miRNAs靶向的基因。
更新的小RNA注释可通过在线布罗德研究所犬类基因组资源网站以及加州大学圣克鲁兹分校(University of California at Santa Cruz)的一个相关犬类注释跟踪中心，该中心负责托管数据。据报道，该团队正在继续在狗和其他家畜中寻找mirna。
“我们现在正在研究狗和各种农场动物的额外数据，”Penso-Dolfin说，“将microRNA的发现与它们在驯化中可能发挥的作用的调查结合起来。”