纽约(基因组网)——牛津纳米孔技术公司上周表示,它正在接纳更多用户加入其MinIon测序仪的早期访问项目,同时越来越多的项目参与者正在展示和发表他们的结果。
在佛罗里达州马可岛举行的基因组生物学和技术进展会议上。vwin德赢ac米兰合作,this week, for example, researchers from The Genome Analysis Centre in the UK and from Cold Spring Harbor Laboratory are scheduled to talk about real-time surveillance approaches, cDNA sequencing, and新创使用MinIon数据进行基因组组装。
早期用户也一直在发布这项技术的新应用程序和数据分析方法。vwin德赢ac米兰合作其中包括加州大学圣克鲁斯分校的Mark Akeson团队上周出版一种用于纳米孔数据的单核苷酸变体检测工具,并表明他们能够在人类染色体的未解决区域中解决癌症基因的拷贝数。
其他研究小组已经证明了新创细菌基因组的组装从MinIon数据和新创酵母基因组的组装从MinIon读取后,用Illumina进行了短读取的纠错,并给出了结果宏基因组测序,人类基因测序、细菌抗生素耐药性岛描述,细菌爆发分析.
牛津纳米孔第一开业登记到目前为止,已有两轮参与者从去年春天开始接收MinIon设备。
该公司表示,到目前为止,早期访问计划的重点是DNA测序,但未来“预计将包括对RNA和蛋白质的直接分析”。
该公司表vwin德赢ac米兰合作示,在该项目期间,该技术在多个领域得到了改进。库准备套件已多次更新,有助于提高数据准确性、缩短工作流程和更好的健壮性。该公司还推出了新的文库准备套件和协议,以实现其他应用,如基因组DNA和扩增子的cDNA测序和条形码。
此外,牛津纳米到目前为止已经交付了三个版本的流单元,每一次都增加了工作纳米孔的数量,从而提高了数据的产量和质量。
通过增加2D读取的比例,数据质量总体上得到了改善,其中来自正向和反向链的读取结合起来以提高准确性。
仪器控制软件MinKnow也进行了多次更新。例如,数据采样频率的改变提高了产量和准确性。
Metrichor是一款基于云计算的基础呼叫软件,根据该公司的说法,它“将演变为更全面的分析和服务”,并将包括其他应用程序。它已经更新了Metrichor的分析算法和其他方面,以提高数据质量和分析速度,用户开发了各种数据分析工具。