纽约(基因组网)——本周,加州大学戴维斯分校的研究人员和他们的合作者宣布,他们成功地对加州糖松的基因组进行了测序。针叶树(松果体lambertiana),这种濒危物种的基因组是人类基因组的10倍。
研究人员在一份声明中说,糖松是世界上最高的树木之一,作为木材来源,它在加州森林生态系统和经济生态系统中发挥着关键作用。然而,自1930年以来,一种名为白松水泡锈病的真菌病原体一直威胁着糖松和其他种类的白松。该物种还受到树皮甲虫的攻击,并受到加州持续干旱的影响。研究人员希望对这棵树进行测序可以获得有助于保护它的信息。
加州大学戴维斯分校森林遗传学家、首席研究员大卫·尼尔在一份声明中说:“有了基因组序列,我们就能发现抗病性的潜在遗传决定因素,这将极大地促进植树造林工作。”“我们现在可以为森林管理者提供现代、快速的基因工具来识别抗性树木。”
戴维斯大学的研究人员与美国林务局合作,从林务局退休遗传学家博亨·金洛克在1970年所做的研究开始。在几年的时间里,Kinloch利用传统的育种方法和子代测试,在糖松亲本树上检测到了一种罕见的抗水泡锈病基因。
从那时起,林务局将这些抗性亲本的幼苗种植到森林中。金洛赫在一份声明中说,对这棵树的基因组进行测序可以帮助开发诊断工具,使林务局能够更快、更经济地找到耐药树木。
他补充说:“从这些亲本种下的种子将有助于保护新一代糖松免受毁灭性的水泡锈病病原体的侵害。”
糖松的基因组可以通过开放获取松树参考序列网站.